216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0738 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0738  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 359 aa  735    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000230285 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0222  radical SAM domain-containing protein  80.58 
 
 		 353 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.255233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0220  radical SAM domain-containing protein  78.8 
 
 		 350 aa  567  1e-161  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1325  radical SAM domain-containing protein  75.42 
 
 		 362 aa  533  1e-150  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.270915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1417  radical SAM domain-containing protein  60.22 
 
 		 364 aa  449  1e-125  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  42.73 
 
 		 365 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  42.9 
 
 		 368 aa  279  6e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  41.94 
 
 		 347 aa  276  4e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1416  radical SAM domain-containing protein  40.11 
 
 		 358 aa  270  2.9999999999999997e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.150894 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  39.53 
 
 		 364 aa  269  4e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  39.5 
 
 		 367 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0554  radical SAM domain-containing protein  36.97 
 
 		 372 aa  261  2e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.420102 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  39.42 
 
 		 368 aa  259  6e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  37.93 
 
 		 348 aa  258  1e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  39.02 
 
 		 353 aa  256  5e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  37.46 
 
 		 367 aa  256  6e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  41.16 
 
 		 373 aa  253  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  40.28 
 
 		 355 aa  252  8.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  38.15 
 
 		 373 aa  249  6e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2163  radical SAM domain-containing protein  39.94 
 
 		 367 aa  247  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  38.2 
 
 		 353 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  36.81 
 
 		 358 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  36.84 
 
 		 360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  36.95 
 
 		 358 aa  243  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  38.44 
 
 		 361 aa  242  7e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  37.39 
 
 		 356 aa  241  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  38.66 
 
 		 354 aa  239  4e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  38.44 
 
 		 360 aa  239  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  38.73 
 
 		 359 aa  240  4e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  38.84 
 
 		 359 aa  239  5e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  37.79 
 
 		 357 aa  238  9e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0519  hypothetical protein  38.9 
 
 		 382 aa  238  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0259  hypothetical protein  38.04 
 
 		 384 aa  237  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.341096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6111  radical SAM domain-containing protein  38.04 
 
 		 392 aa  236  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0611343  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  38.62 
 
 		 373 aa  236  4e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  37.1 
 
 		 364 aa  235  1.0000000000000001e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  37.07 
 
 		 388 aa  232  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  37.5 
 
 		 388 aa  232  9e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  39.13 
 
 		 360 aa  231  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  36.93 
 
 		 364 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  37.57 
 
 		 357 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  36.13 
 
 		 387 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  35.36 
 
 		 360 aa  230  3e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  36.49 
 
 		 388 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0097  Radical SAM domain protein  37.32 
 
 		 386 aa  229  4e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  37.74 
 
 		 355 aa  229  5e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  34.6 
 
 		 355 aa  229  6e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  35.63 
 
 		 359 aa  227  3e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1188  Radical SAM domain protein  37.32 
 
 		 387 aa  226  4e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12301 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  37.04 
 
 		 357 aa  226  6e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  37.21 
 
 		 352 aa  225  7e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  36.31 
 
 		 375 aa  225  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  38.57 
 
 		 372 aa  224  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  39.89 
 
 		 356 aa  225  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  35.94 
 
 		 358 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8066  Radical SAM domain protein  36.84 
 
 		 386 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  36.01 
 
 		 386 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  35.86 
 
 		 367 aa  223  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  36.92 
 
 		 348 aa  222  7e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  37.14 
 
 		 371 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3637  Radical SAM domain protein  39.1 
 
 		 347 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  35.28 
 
 		 381 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0587  Radical SAM domain-containing protein  35.81 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  34.91 
 
 		 395 aa  220  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  35.55 
 
 		 362 aa  219  6e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  33.99 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  34.54 
 
 		 376 aa  217  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0584  hypothetical protein  35.65 
 
 		 360 aa  217  2e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4085  radical SAM domain-containing protein  35.29 
 
 		 389 aa  217  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.181055 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  33.33 
 
 		 362 aa  217  2e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  35.73 
 
 		 371 aa  216  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  36.28 
 
 		 394 aa  216  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4505  radical SAM domain-containing protein  35.57 
 
 		 389 aa  216  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.325974  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  34.01 
 
 		 363 aa  216  4e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0149  Radical SAM domain protein  37.32 
 
 		 358 aa  216  5e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00717785  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  33.14 
 
 		 350 aa  215  8e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  39.03 
 
 		 355 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  34.01 
 
 		 349 aa  215  9.999999999999999e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  35.44 
 
 		 354 aa  215  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1475  hypothetical protein  34.12 
 
 		 350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.904959  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  34.92 
 
 		 396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1525  Radical SAM domain protein  34.9 
 
 		 396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1560  hypothetical protein  34.1 
 
 		 354 aa  213  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  32.56 
 
 		 348 aa  213  3.9999999999999995e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  36.47 
 
 		 453 aa  213  3.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  34.73 
 
 		 367 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  34.26 
 
 		 362 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0282  hypothetical protein  34.1 
 
 		 354 aa  211  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  34.01 
 
 		 362 aa  209  4e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  34.8 
 
 		 380 aa  209  4e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  34.71 
 
 		 385 aa  209  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  33.88 
 
 		 404 aa  209  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1370  hypothetical protein  34.1 
 
 		 354 aa  209  7e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1483  hypothetical protein  34.78 
 
 		 353 aa  209  7e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  35.1 
 
 		 365 aa  209  8e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1029  hypothetical protein  32.54 
 
 		 359 aa  208  1e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.148113  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  34.31 
 
 		 366 aa  207  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0427  hypothetical protein  32.95 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6099  radical SAM domain-containing protein  34.6 
 
 		 515 aa  207  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61579  normal  0.0270865 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0832  hypothetical protein  33.63 
 
 		 353 aa  206  4e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.709091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>