195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3629 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3629  conserved hypothetical protein; putative SAM domain  100 
 
 		 339 aa  645    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0222869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3326  FO synthase  56.2 
 
 		 372 aa  332  5e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.9768  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  46.83 
 
 		 872 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  45.83 
 
 		 852 aa  272  7e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  44.01 
 
 		 859 aa  271  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  46.09 
 
 		 899 aa  270  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  44.29 
 
 		 859 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  44.29 
 
 		 859 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  44.29 
 
 		 859 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  43.92 
 
 		 859 aa  268  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  45.56 
 
 		 944 aa  266  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  44.01 
 
 		 859 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  41.87 
 
 		 863 aa  260  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  42.62 
 
 		 856 aa  260  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  45.45 
 
 		 884 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  40.73 
 
 		 842 aa  250  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  39.57 
 
 		 867 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  53.35 
 
 		 811 aa  246  4e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  41.69 
 
 		 836 aa  245  8e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  40.44 
 
 		 875 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  43.43 
 
 		 838 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  39.94 
 
 		 841 aa  243  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  40.06 
 
 		 857 aa  239  6.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  38.69 
 
 		 871 aa  238  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  40.72 
 
 		 860 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  39.41 
 
 		 881 aa  233  5e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  37.29 
 
 		 800 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  38.25 
 
 		 792 aa  215  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  38.11 
 
 		 820 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  38.66 
 
 		 453 aa  203  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  39.22 
 
 		 826 aa  202  8e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1115  radical SAM domain-containing protein  35.36 
 
 		 418 aa  200  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  31.53 
 
 		 429 aa  200  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  36.05 
 
 		 435 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  30.08 
 
 		 419 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  36.56 
 
 		 841 aa  183  3e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  33.33 
 
 		 376 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  37.6 
 
 		 779 aa  180  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  31.76 
 
 		 359 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3281  FO synthase subunit 2  34.83 
 
 		 381 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  0.662491 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  37.54 
 
 		 757 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1071  FO synthase subunit 2  29.63 
 
 		 359 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  34.56 
 
 		 367 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  33.33 
 
 		 366 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0194  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  34.08 
 
 		 382 aa  169  4e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200924  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  29.83 
 
 		 362 aa  170  4e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  29.91 
 
 		 370 aa  169  7e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  33.06 
 
 		 362 aa  168  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0775  FO synthase subunit 2  33.71 
 
 		 391 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.848355  hitchhiker  0.00153433 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  35.69 
 
 		 741 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  31.29 
 
 		 356 aa  167  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  29.91 
 
 		 359 aa  166  5e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  35.98 
 
 		 737 aa  166  8e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  35.43 
 
 		 737 aa  165  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0686  FO synthase subunit 2  35.53 
 
 		 386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  30.94 
 
 		 358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  34.48 
 
 		 362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  33.81 
 
 		 362 aa  163  4.0000000000000004e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  34.2 
 
 		 365 aa  162  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2116  FO synthase subunit 2  31.69 
 
 		 398 aa  160  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1434  FO synthase subunit 2  32.31 
 
 		 376 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3080  FO synthase subunit 2  32.64 
 
 		 384 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3040  FO synthase subunit 2  32.94 
 
 		 384 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  32.31 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0123  hypothetical protein  30.26 
 
 		 361 aa  154  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  32.76 
 
 		 364 aa  153  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1054  FO synthase subunit 2  30.79 
 
 		 358 aa  150  4e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  30 
 
 		 356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1072  FO synthase subunit 2  27.4 
 
 		 358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  31.32 
 
 		 361 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1620  FO synthase subunit 2  29.94 
 
 		 358 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  31.3 
 
 		 355 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  31.36 
 
 		 371 aa  142  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  29.46 
 
 		 356 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  34.91 
 
 		 356 aa  135  7.000000000000001e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  32.54 
 
 		 375 aa  135  9e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  32.29 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  32.75 
 
 		 396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  31.07 
 
 		 358 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  31.07 
 
 		 358 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  32.24 
 
 		 395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  32.27 
 
 		 355 aa  126  6e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  29.58 
 
 		 359 aa  125  9e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  28.03 
 
 		 348 aa  125  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  34.25 
 
 		 355 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  28.49 
 
 		 360 aa  124  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  31.86 
 
 		 353 aa  124  3e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  32.39 
 
 		 394 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  31.21 
 
 		 381 aa  123  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  32.69 
 
 		 626 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  31.05 
 
 		 355 aa  123  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  31.79 
 
 		 385 aa  122  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  29.33 
 
 		 358 aa  122  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  30.14 
 
 		 368 aa  122  9e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  28.69 
 
 		 360 aa  122  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  28.74 
 
 		 349 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  31.61 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  27.38 
 
 		 373 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3637  Radical SAM domain protein  30.94 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  32.36 
 
 		 626 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>