58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2194 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2194  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  589  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1644  protein of unknown function DUF178  59.79 
 
 		 283 aa  362  3e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  hitchhiker  0.000000480374 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1090  hypothetical protein  49.82 
 
 		 274 aa  302  5.000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0670  protein of unknown function DUF178  51.25 
 
 		 285 aa  280  2e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1158  hypothetical protein  39.42 
 
 		 275 aa  206  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.640507  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1845  hypothetical protein  37.91 
 
 		 286 aa  193  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8062  protein of unknown function DUF178  34.38 
 
 		 296 aa  179  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0549  hypothetical protein  32.85 
 
 		 294 aa  170  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3086  hypothetical protein  34.17 
 
 		 286 aa  166  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000103866 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2017  hypothetical protein  35.47 
 
 		 273 aa  166  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138811  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0796  hypothetical protein  33.45 
 
 		 291 aa  165  8e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0141719  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0522  hypothetical protein  33.83 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.783802 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1227  hypothetical protein  32.61 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1276  hypothetical protein  30.82 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0986  hypothetical protein  30.47 
 
 		 278 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167852  decreased coverage  0.00614129 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1828  hypothetical protein  31.52 
 
 		 273 aa  153  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000107819  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0261  hypothetical protein  35.54 
 
 		 280 aa  151  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.611921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1190  protein of unknown function DUF178  32.71 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.621312 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1281  protein of unknown function DUF178  32.58 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2125  hypothetical protein  31.5 
 
 		 275 aa  149  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2652  protein of unknown function DUF178  33.58 
 
 		 273 aa  146  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132342 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1564  protein of unknown function DUF178  33.21 
 
 		 273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000640469  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4475  hypothetical protein  32.95 
 
 		 283 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4076  hypothetical protein  33.33 
 
 		 304 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0359636 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6108  hypothetical protein  32.21 
 
 		 289 aa  142  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2019  hypothetical protein  33.46 
 
 		 275 aa  142  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000126009  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1684  protein of unknown function DUF178  34.67 
 
 		 284 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37152  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1601  protein of unknown function DUF178  30.34 
 
 		 275 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.506959  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0524  hypothetical protein  31.02 
 
 		 253 aa  130  3e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3342  hypothetical protein  27.9 
 
 		 278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2099  hypothetical protein  32.66 
 
 		 294 aa  112  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0571299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2162  hypothetical protein  33.5 
 
 		 271 aa  112  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0783  protein of unknown function DUF178  28.1 
 
 		 281 aa  109  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16966  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  33.81 
 
 		 500 aa  100  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0786  hypothetical protein  30.19 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0287484  normal  0.781608 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1524  protein of unknown function DUF178  30.3 
 
 		 271 aa  99.8  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4038  protein of unknown function DUF178  27.76 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.063784 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0146  protein of unknown function DUF178  29.37 
 
 		 245 aa  95.5  8e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00604091  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2810  protein of unknown function DUF178  31.47 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.446803  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1882  radical SAM domain-containing protein  28.95 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  29.33 
 
 		 625 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  29.86 
 
 		 626 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  28.92 
 
 		 626 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  28.43 
 
 		 626 aa  65.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0737  hypothetical protein  27.78 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000184342 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0440  hypothetical protein  30.05 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0543  hypothetical protein  27.31 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.040615  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1302  hypothetical protein  30.05 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1477  hypothetical protein  30.43 
 
 		 223 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0885  hypothetical protein  23.47 
 
 		 272 aa  52.4  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.331492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0237  hypothetical protein  25 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1291  conserved hypothetical protein (DUF178 domain protein)  28.65 
 
 		 221 aa  50.1  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1558  hypothetical protein  25.95 
 
 		 227 aa  49.7  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0858753  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1418  hypothetical protein  25.93 
 
 		 245 aa  48.9  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0657187 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0252  hypothetical protein  26.87 
 
 		 216 aa  48.9  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0215  hypothetical protein  23.5 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.260844  normal  0.647762 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2188  protein of unknown function DUF178  24.32 
 
 		 221 aa  45.4  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.745567  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1444  hypothetical protein  25.47 
 
 		 267 aa  42.4  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.111813 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>