63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0522 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0522  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  572  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.783802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6108  hypothetical protein  81.95 
 
 		 289 aa  449  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0261  hypothetical protein  66.04 
 
 		 280 aa  313  9.999999999999999e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.611921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4076  hypothetical protein  65.81 
 
 		 304 aa  311  5.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0359636 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4475  hypothetical protein  65.27 
 
 		 283 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1227  hypothetical protein  60.89 
 
 		 282 aa  305  8.000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8062  protein of unknown function DUF178  59.62 
 
 		 296 aa  298  6e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1158  hypothetical protein  39.71 
 
 		 275 aa  210  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.640507  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2194  hypothetical protein  33.83 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1644  protein of unknown function DUF178  33.21 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  hitchhiker  0.000000480374 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1090  hypothetical protein  34.62 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0670  protein of unknown function DUF178  35.32 
 
 		 285 aa  151  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0796  hypothetical protein  34.63 
 
 		 291 aa  142  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0141719  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1276  hypothetical protein  34.88 
 
 		 278 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3086  hypothetical protein  33.33 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000103866 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1828  hypothetical protein  30.45 
 
 		 273 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000107819  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0986  hypothetical protein  33.7 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167852  decreased coverage  0.00614129 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0549  hypothetical protein  34.05 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1845  hypothetical protein  32.83 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1281  protein of unknown function DUF178  32.26 
 
 		 282 aa  123  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3342  hypothetical protein  32.37 
 
 		 278 aa  123  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2652  protein of unknown function DUF178  29.56 
 
 		 273 aa  122  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132342 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0524  hypothetical protein  27.54 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2162  hypothetical protein  33.97 
 
 		 271 aa  119  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  26.28 
 
 		 500 aa  119  6e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1564  protein of unknown function DUF178  29.3 
 
 		 273 aa  119  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000640469  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2017  hypothetical protein  30.77 
 
 		 273 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138811  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1190  protein of unknown function DUF178  32.29 
 
 		 284 aa  116  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.621312 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2810  protein of unknown function DUF178  33.33 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.446803  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  34.53 
 
 		 625 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1601  protein of unknown function DUF178  31.48 
 
 		 275 aa  109  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.506959  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2019  hypothetical protein  29.45 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000126009  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  33.21 
 
 		 626 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2099  hypothetical protein  33.92 
 
 		 294 aa  106  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0571299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0783  protein of unknown function DUF178  30.58 
 
 		 281 aa  105  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16966  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1684  protein of unknown function DUF178  30.25 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37152  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2125  hypothetical protein  27.44 
 
 		 275 aa  103  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4038  protein of unknown function DUF178  27.41 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.063784 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  33.58 
 
 		 626 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1524  protein of unknown function DUF178  33.33 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  33.21 
 
 		 626 aa  99  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0786  hypothetical protein  31.18 
 
 		 270 aa  95.9  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0287484  normal  0.781608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1882  radical SAM domain-containing protein  28.29 
 
 		 241 aa  90.1  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0146  protein of unknown function DUF178  24.72 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00604091  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0543  hypothetical protein  28.1 
 
 		 232 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.040615  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0440  hypothetical protein  29.03 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1302  hypothetical protein  29.03 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1477  hypothetical protein  29.03 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0346  hypothetical protein  19.48 
 
 		 230 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1558  hypothetical protein  21.84 
 
 		 227 aa  52  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0858753  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0711  hypothetical protein  22.14 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1032  periplasmic solute-binding protein-like protein  26.71 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0237  hypothetical protein  22.66 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1418  hypothetical protein  25.89 
 
 		 245 aa  47  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0657187 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0799  hypothetical protein  33.33 
 
 		 278 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.732287  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1810  hypothetical protein  31.64 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.24214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3380  hypothetical protein  28.79 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0737  hypothetical protein  30.34 
 
 		 238 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000184342 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1168  protein of unknown function DUF191  25.37 
 
 		 280 aa  43.5  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0215  hypothetical protein  26.84 
 
 		 246 aa  43.1  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.260844  normal  0.647762 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1323  hypothetical protein  28.27 
 
 		 239 aa  42.7  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.551661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3116  hypothetical protein  30.09 
 
 		 276 aa  42.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00331427  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0885  hypothetical protein  23.9 
 
 		 272 aa  42.4  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.331492  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>