60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3380 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3380  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0454  hypothetical protein  79.04 
 
 		 278 aa  442  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0686  hypothetical protein  70.96 
 
 		 277 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000504074  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0657  protein of unknown function DUF191  66.3 
 
 		 277 aa  377  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.886624  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3279  hypothetical protein  67.28 
 
 		 284 aa  372  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0613  protein of unknown function DUF191  69.12 
 
 		 288 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.6811699999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0599  protein of unknown function DUF191  68.01 
 
 		 288 aa  361  8e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000197308  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0885  hypothetical protein  58.09 
 
 		 272 aa  307  1.0000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.331492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2834  protein of unknown function DUF191  55.15 
 
 		 280 aa  278  5e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185622  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1810  hypothetical protein  54.84 
 
 		 279 aa  271  6e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.24214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3116  hypothetical protein  54.78 
 
 		 276 aa  264  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00331427  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5858  hypothetical protein  53.18 
 
 		 264 aa  262  6e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.912985 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1277  hypothetical protein  48.92 
 
 		 282 aa  261  8e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1615  hypothetical protein  56.86 
 
 		 287 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.702514 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1815  hypothetical protein  51.1 
 
 		 279 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.113959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6959  protein of unknown function DUF191  47.86 
 
 		 261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1702  protein of unknown function DUF191  55.08 
 
 		 276 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0552  hypothetical protein  49.26 
 
 		 307 aa  253  3e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00285947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4152  protein of unknown function DUF191  45.62 
 
 		 281 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00371107 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2176  hypothetical protein  55.6 
 
 		 276 aa  252  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0105  hypothetical protein  52.22 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0799  hypothetical protein  49.45 
 
 		 278 aa  250  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.732287  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1773  protein of unknown function DUF191  55.21 
 
 		 276 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1187  protein of unknown function DUF191  50.57 
 
 		 297 aa  249  3e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.195086 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4199  protein of unknown function DUF191  50.36 
 
 		 282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0151  hypothetical protein  53.36 
 
 		 293 aa  242  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0137772 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0260  hypothetical protein  49.46 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4422  hypothetical protein  51.46 
 
 		 281 aa  238  5.999999999999999e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.928924  normal  0.490091 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3234  hypothetical protein  46.74 
 
 		 282 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3946  hypothetical protein  46.76 
 
 		 320 aa  238  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4337  hypothetical protein  46.23 
 
 		 298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8091  protein of unknown function DUF191  51.15 
 
 		 272 aa  231  9e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1278  protein of unknown function DUF191  48.67 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1988  protein of unknown function DUF191  40.75 
 
 		 280 aa  212  3.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1029  protein of unknown function DUF191  39.85 
 
 		 275 aa  206  4e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3445  hypothetical protein  38.15 
 
 		 291 aa  204  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1444  hypothetical protein  42.91 
 
 		 267 aa  202  6e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.111813 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0462  hypothetical protein  42.16 
 
 		 268 aa  201  7e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.104402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0535  hypothetical protein  44.91 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.766739  normal  0.0869709 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0830  hypothetical protein  43.4 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1168  protein of unknown function DUF191  36.4 
 
 		 280 aa  189  5e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1581  protein of unknown function DUF191  40.82 
 
 		 271 aa  189  5e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1608  hypothetical protein  39.55 
 
 		 266 aa  186  5e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.384595 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0746  hypothetical protein  33.08 
 
 		 275 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.227567 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3010  protein of unknown function DUF191  41.15 
 
 		 263 aa  166  4e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2413  protein of unknown function DUF191  43.27 
 
 		 286 aa  156  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113534 
 
 
-
 
NC_002620  TC0533  hypothetical protein  31.76 
 
 		 256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2237  protein of unknown function DUF191  31.54 
 
 		 288 aa  122  8e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0202  hypothetical protein  30.08 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0340  hypothetical protein  29.39 
 
 		 288 aa  116  5e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2098  S-ribosylhomocysteine lyase (autoinducer-2 productionprotein LuxS; AI-2 synthesis protein)  30.5 
 
 		 290 aa  112  6e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.19682  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1670  hypothetical protein  29.23 
 
 		 286 aa  106  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0620  succinyl-CoA ligase [ADP-forming] subunit alpha (succinyl-CoA synthetase subunit alpha) (SCS-alpha)  29.67 
 
 		 290 aa  105  6e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2004  hypothetical protein  30.42 
 
 		 287 aa  105  7e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0715126  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1846  hypothetical protein  28.63 
 
 		 286 aa  105  8e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2048  hypothetical protein  30 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.343897  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0154  conserved hypothetical protein (DUF191 domain protein)  28.79 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0779  periplasmic solute-binding protein-like protein  23.87 
 
 		 288 aa  53.5  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.124322 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0049  protein of unknown function DUF191  21.32 
 
 		 288 aa  48.9  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0522  hypothetical protein  28.79 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.783802 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>