61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1564 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1564  protein of unknown function DUF178  100 
 
 		 273 aa  560  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000640469  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2652  protein of unknown function DUF178  97.44 
 
 		 273 aa  549  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132342 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1828  hypothetical protein  65.07 
 
 		 273 aa  362  4e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000107819  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2017  hypothetical protein  60.29 
 
 		 273 aa  340  2e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138811  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0986  hypothetical protein  59.93 
 
 		 278 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167852  decreased coverage  0.00614129 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1601  protein of unknown function DUF178  46.32 
 
 		 275 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.506959  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2019  hypothetical protein  47.97 
 
 		 275 aa  231  8.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000126009  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2125  hypothetical protein  42.91 
 
 		 275 aa  217  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1158  hypothetical protein  34.33 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.640507  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1644  protein of unknown function DUF178  34.91 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  hitchhiker  0.000000480374 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3086  hypothetical protein  35.42 
 
 		 286 aa  155  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000103866 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0796  hypothetical protein  34.07 
 
 		 291 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0141719  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1845  hypothetical protein  37.85 
 
 		 286 aa  152  8e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0783  protein of unknown function DUF178  36.62 
 
 		 281 aa  151  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16966  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0670  protein of unknown function DUF178  36.7 
 
 		 285 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2194  hypothetical protein  33.21 
 
 		 284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1684  protein of unknown function DUF178  34.93 
 
 		 284 aa  145  5e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37152  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1090  hypothetical protein  34.75 
 
 		 274 aa  145  7.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1276  hypothetical protein  32.1 
 
 		 278 aa  145  9e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  35.69 
 
 		 500 aa  142  8e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8062  protein of unknown function DUF178  29.85 
 
 		 296 aa  141  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1190  protein of unknown function DUF178  33.81 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.621312 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1281  protein of unknown function DUF178  32.73 
 
 		 282 aa  132  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2162  hypothetical protein  34.87 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1227  hypothetical protein  33.21 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0549  hypothetical protein  33.45 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4475  hypothetical protein  32.45 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4076  hypothetical protein  32.08 
 
 		 304 aa  122  8e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0359636 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3342  hypothetical protein  31.85 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0522  hypothetical protein  29.3 
 
 		 292 aa  119  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.783802 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0261  hypothetical protein  31.97 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.611921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6108  hypothetical protein  27.84 
 
 		 289 aa  108  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2099  hypothetical protein  36.1 
 
 		 294 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0571299  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1524  protein of unknown function DUF178  35.47 
 
 		 271 aa  96.7  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0786  hypothetical protein  32.8 
 
 		 270 aa  95.1  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0287484  normal  0.781608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1882  radical SAM domain-containing protein  32.71 
 
 		 241 aa  90.5  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0524  hypothetical protein  28.57 
 
 		 253 aa  87.8  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4038  protein of unknown function DUF178  28.24 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.063784 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1418  hypothetical protein  29.13 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0657187 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0146  protein of unknown function DUF178  25.77 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00604091  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2810  protein of unknown function DUF178  24.91 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.446803  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0543  hypothetical protein  29.63 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.040615  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  28.68 
 
 		 626 aa  65.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  29.58 
 
 		 626 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  27.94 
 
 		 625 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  29.17 
 
 		 626 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0237  hypothetical protein  26.64 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0215  hypothetical protein  27.57 
 
 		 246 aa  52.8  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.260844  normal  0.647762 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1029  protein of unknown function DUF191  23.16 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0711  hypothetical protein  23.44 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1477  hypothetical protein  30.9 
 
 		 223 aa  49.7  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1302  hypothetical protein  30.9 
 
 		 223 aa  49.7  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2188  protein of unknown function DUF178  26.05 
 
 		 221 aa  48.9  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.745567  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1558  hypothetical protein  23.86 
 
 		 227 aa  48.5  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0858753  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0440  hypothetical protein  32.58 
 
 		 223 aa  48.9  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0252  hypothetical protein  26.01 
 
 		 216 aa  47.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0346  hypothetical protein  24.62 
 
 		 230 aa  46.6  0.0005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1581  protein of unknown function DUF191  27.53 
 
 		 271 aa  45.8  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6959  protein of unknown function DUF191  23.91 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0105  hypothetical protein  24.05 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1323  hypothetical protein  24 
 
 		 239 aa  43.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.551661  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>