53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1190 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1190  protein of unknown function DUF178  100 
 
 		 284 aa  579  1e-164  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.621312 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0549  hypothetical protein  74.91 
 
 		 294 aa  427  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1281  protein of unknown function DUF178  65.26 
 
 		 282 aa  373  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0796  hypothetical protein  60.36 
 
 		 291 aa  345  4e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0141719  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3086  hypothetical protein  51.65 
 
 		 286 aa  260  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000103866 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2017  hypothetical protein  35.77 
 
 		 273 aa  159  7e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138811  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1845  hypothetical protein  36.9 
 
 		 286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2194  hypothetical protein  32.71 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1090  hypothetical protein  37.07 
 
 		 274 aa  150  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1601  protein of unknown function DUF178  32.73 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.506959  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2019  hypothetical protein  36.13 
 
 		 275 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000126009  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1828  hypothetical protein  33.45 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000107819  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1276  hypothetical protein  32.23 
 
 		 278 aa  142  5e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1644  protein of unknown function DUF178  33.81 
 
 		 283 aa  142  8e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  hitchhiker  0.000000480374 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2652  protein of unknown function DUF178  34.52 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132342 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1564  protein of unknown function DUF178  33.81 
 
 		 273 aa  140  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000640469  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1684  protein of unknown function DUF178  37.28 
 
 		 284 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37152  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0986  hypothetical protein  32.97 
 
 		 278 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167852  decreased coverage  0.00614129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8062  protein of unknown function DUF178  32.73 
 
 		 296 aa  132  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2125  hypothetical protein  32.73 
 
 		 275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0670  protein of unknown function DUF178  35.52 
 
 		 285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1227  hypothetical protein  34.69 
 
 		 282 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0783  protein of unknown function DUF178  33.22 
 
 		 281 aa  124  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16966  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0524  hypothetical protein  29.78 
 
 		 253 aa  123  4e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1158  hypothetical protein  28.18 
 
 		 275 aa  122  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.640507  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0522  hypothetical protein  32.29 
 
 		 292 aa  116  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.783802 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3342  hypothetical protein  29.33 
 
 		 278 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6108  hypothetical protein  31.36 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  27.14 
 
 		 500 aa  103  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4475  hypothetical protein  34.16 
 
 		 283 aa  102  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4076  hypothetical protein  35.14 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0359636 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0261  hypothetical protein  31.66 
 
 		 280 aa  95.9  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.611921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4038  protein of unknown function DUF178  28.24 
 
 		 246 aa  92.4  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.063784 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2162  hypothetical protein  30.58 
 
 		 271 aa  89.4  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2810  protein of unknown function DUF178  28.52 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.446803  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  27.68 
 
 		 626 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  28.68 
 
 		 626 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1882  radical SAM domain-containing protein  26.18 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  28.99 
 
 		 626 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  29.21 
 
 		 625 aa  72.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0146  protein of unknown function DUF178  24.87 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00604091  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2099  hypothetical protein  28.15 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0571299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0786  hypothetical protein  26.49 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0287484  normal  0.781608 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1524  protein of unknown function DUF178  30.46 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0237  hypothetical protein  24.05 
 
 		 227 aa  52.4  0.000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0543  hypothetical protein  25.55 
 
 		 232 aa  50.8  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.040615  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1477  hypothetical protein  28.57 
 
 		 223 aa  48.9  0.00008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1302  hypothetical protein  28.57 
 
 		 223 aa  48.9  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0440  hypothetical protein  29.12 
 
 		 223 aa  48.5  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1988  protein of unknown function DUF191  26.24 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1323  hypothetical protein  31.62 
 
 		 239 aa  42.7  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.551661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1418  hypothetical protein  31.85 
 
 		 245 aa  42.4  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0657187 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0737  hypothetical protein  32.77 
 
 		 238 aa  42.4  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000184342 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>