139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1778 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1778  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  626  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773906  normal  0.904742 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0559  hypothetical protein  57.84 
 
 		 300 aa  351  1e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5281  protein of unknown function DUF752  59.93 
 
 		 293 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.338387 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0840  protein of unknown function DUF752  60.63 
 
 		 289 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0811  protein of unknown function DUF752  60.28 
 
 		 289 aa  332  6e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3463  protein of unknown function DUF752  54.85 
 
 		 296 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0679006 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1941  hypothetical protein  50.69 
 
 		 298 aa  258  6e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18881  hypothetical protein  39.8 
 
 		 313 aa  182  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1130  hypothetical protein  39.39 
 
 		 305 aa  179  4e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.398385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1327  hypothetical protein  39.22 
 
 		 330 aa  176  5e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06771  hypothetical protein  36.59 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06381  hypothetical protein  36.67 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06681  hypothetical protein  37.24 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245122  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0612  hypothetical protein  36.33 
 
 		 301 aa  168  8e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.930586  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06691  hypothetical protein  35.23 
 
 		 298 aa  165  8e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.194908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0048  SAM-dependent methyltransferase  35.23 
 
 		 298 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.62416  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  30.16 
 
 		 500 aa  140  3e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0147  hypothetical protein  26.12 
 
 		 366 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.464612  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10381  hypothetical protein  39.39 
 
 		 187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1581  hypothetical protein  27.76 
 
 		 338 aa  106  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1933  hypothetical protein  30.64 
 
 		 254 aa  102  9e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1730  hypothetical protein  27.01 
 
 		 340 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.8235 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0181  hypothetical protein  28.15 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0873  hypothetical protein  27.14 
 
 		 340 aa  99  8e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.197999  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1833  protein of unknown function DUF752  29.52 
 
 		 229 aa  81.6  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0476  protein of unknown function DUF752  23.26 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1737  hypothetical protein  27.73 
 
 		 225 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1538  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  28.22 
 
 		 672 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0998844 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2432  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.6 
 
 		 678 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.974463  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1456  hypothetical protein  29.44 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.439461  normal  0.0456624 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3048  hypothetical protein  29.96 
 
 		 635 aa  72.8  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.115559  normal  0.0258128 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0261  Radical SAM domain protein  26.36 
 
 		 564 aa  72.4  0.000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1709  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.8 
 
 		 657 aa  72  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1796  hypothetical protein  27.78 
 
 		 639 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2519  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.7 
 
 		 679 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1871  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.8 
 
 		 672 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0302238 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1926  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  27.78 
 
 		 639 aa  70.1  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4644  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  28.57 
 
 		 645 aa  70.1  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.683342  hitchhiker  0.0000257745 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2424  hypothetical protein  27.27 
 
 		 637 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2983  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  28.57 
 
 		 620 aa  67.4  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4769  hypothetical protein  26.05 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3099  hypothetical protein  25.55 
 
 		 230 aa  65.1  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2343  hypothetical protein  26.48 
 
 		 637 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.955559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0152  protein of unknown function DUF752  28.22 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0147  hypothetical protein  26.87 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00930427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2850  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  28.31 
 
 		 644 aa  62.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413253  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0879  hypothetical protein  35.71 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2539  hypothetical protein  35.71 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0656342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2336  hypothetical protein  26.79 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1277  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.8 
 
 		 667 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0226023  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0142  hypothetical protein  36.67 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.46 
 
 		 677 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2146  hypothetical protein  29.28 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0640  hypothetical protein  26.73 
 
 		 227 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000640329  normal  0.493062 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2054  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  25.57 
 
 		 655 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149668 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1751  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  28.46 
 
 		 654 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0704  hypothetical protein  32.33 
 
 		 699 aa  57  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3963  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  28.46 
 
 		 654 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.94523  normal  0.0279642 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1343  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  31.46 
 
 		 654 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3066  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.51 
 
 		 655 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.16811 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07050  hypothetical protein  24.43 
 
 		 226 aa  57  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1602  protein of unknown function DUF752  25.89 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1964  hypothetical protein  25.45 
 
 		 653 aa  56.2  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4098  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  30.11 
 
 		 659 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0664  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  34.12 
 
 		 676 aa  56.2  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0436264  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1359  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  30.34 
 
 		 657 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490609  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0764  hypothetical protein  21.84 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1358  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.58 
 
 		 672 aa  55.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0608182  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1458  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  32.94 
 
 		 675 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.622829  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3465  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.34 
 
 		 668 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1332  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  24.43 
 
 		 668 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2402  queuine tRNA-ribosyltransferase  33.33 
 
 		 726 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2475  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.43 
 
 		 668 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2619  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.43 
 
 		 668 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1328  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.43 
 
 		 668 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.831924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2702  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.43 
 
 		 668 aa  54.7  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.673186  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3742  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  31.07 
 
 		 665 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0063824 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02249  hypothetical protein  23.53 
 
 		 668 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.425785  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1235  protein of unknown function DUF752  25.86 
 
 		 226 aa  53.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.887893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02209  hypothetical protein  23.53 
 
 		 668 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.334228  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2481  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.89 
 
 		 668 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2806  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  29.75 
 
 		 675 aa  53.1  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.641074  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1639  oxidoreductase, FAD-binding protein  31 
 
 		 660 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.562541  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0067  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.84 
 
 		 657 aa  53.1  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4505  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  33.33 
 
 		 656 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1887  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.8 
 
 		 672 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3871  protein of unknown function DUF752  25.65 
 
 		 226 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1378  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.63 
 
 		 668 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1927  hypothetical protein  23.18 
 
 		 617 aa  50.8  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0140  hypothetical protein  22.68 
 
 		 218 aa  51.6  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.946459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19400  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.61 
 
 		 654 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0825831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1170  hypothetical protein  29.91 
 
 		 631 aa  51.6  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.285143  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2872  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  32.22 
 
 		 666 aa  51.6  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.715577  normal  0.0703666 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3401  hypothetical protein  22.52 
 
 		 674 aa  51.2  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.473665  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1494  hypothetical protein  22.45 
 
 		 666 aa  50.4  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34940  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.07 
 
 		 653 aa  50.4  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1956  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  30.85 
 
 		 644 aa  50.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243551  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0003  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25 
 
 		 657 aa  50.1  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3653  hypothetical protein  34.88 
 
 		 249 aa  50.1  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1390  hypothetical protein  28.45 
 
 		 622 aa  50.1  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.909333 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>