62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0873 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0873  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  684    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.197999  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0181  hypothetical protein  90.86 
 
 		 340 aa  622  1e-177  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1730  hypothetical protein  88.53 
 
 		 340 aa  615  1e-175  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.8235 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1581  hypothetical protein  69.82 
 
 		 338 aa  474  1e-133  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0147  hypothetical protein  56.87 
 
 		 366 aa  360  3e-98  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.464612  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0840  protein of unknown function DUF752  32.48 
 
 		 289 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0811  protein of unknown function DUF752  32.48 
 
 		 289 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1778  hypothetical protein  27.14 
 
 		 303 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773906  normal  0.904742 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0559  hypothetical protein  30.55 
 
 		 300 aa  97.4  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1933  hypothetical protein  31.17 
 
 		 254 aa  97.1  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06681  hypothetical protein  28.87 
 
 		 294 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245122  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0612  hypothetical protein  29.51 
 
 		 301 aa  94  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.930586  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06381  hypothetical protein  29.79 
 
 		 303 aa  92.8  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1941  hypothetical protein  27.11 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5281  protein of unknown function DUF752  26.43 
 
 		 293 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.338387 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06691  hypothetical protein  29.3 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.194908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0048  SAM-dependent methyltransferase  29.45 
 
 		 298 aa  90.5  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.62416  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18881  hypothetical protein  28.32 
 
 		 313 aa  86.7  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1327  hypothetical protein  28.23 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3463  protein of unknown function DUF752  29.61 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0679006 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1130  hypothetical protein  27.44 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.398385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  32 
 
 		 500 aa  83.6  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0476  protein of unknown function DUF752  28.63 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06771  hypothetical protein  26.88 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2519  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.76 
 
 		 679 aa  65.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4769  hypothetical protein  24.89 
 
 		 221 aa  65.1  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2432  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.33 
 
 		 678 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.974463  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0261  Radical SAM domain protein  24.79 
 
 		 564 aa  60.5  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.2 
 
 		 677 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2402  queuine tRNA-ribosyltransferase  30.65 
 
 		 726 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10381  hypothetical protein  24.87 
 
 		 187 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3321  hypothetical protein  25.55 
 
 		 257 aa  54.3  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3871  protein of unknown function DUF752  26.61 
 
 		 226 aa  53.5  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0879  hypothetical protein  32.22 
 
 		 266 aa  52.8  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2539  hypothetical protein  26.71 
 
 		 266 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0656342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2336  hypothetical protein  32.53 
 
 		 218 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3563  protein of unknown function DUF752  23.29 
 
 		 223 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158975  normal  0.127143 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1602  protein of unknown function DUF752  23.15 
 
 		 220 aa  50.8  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4256  hypothetical protein  26.2 
 
 		 227 aa  50.4  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000473463  hitchhiker  0.0000809329 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2709  hypothetical protein  24.66 
 
 		 223 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.388652  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3099  hypothetical protein  28.95 
 
 		 230 aa  49.7  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0142  hypothetical protein  27.78 
 
 		 242 aa  49.7  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0147  hypothetical protein  30.67 
 
 		 227 aa  48.9  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00930427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0152  protein of unknown function DUF752  35 
 
 		 230 aa  47.8  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1833  protein of unknown function DUF752  20.09 
 
 		 229 aa  47.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1456  hypothetical protein  22.01 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.439461  normal  0.0456624 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1737  hypothetical protein  22.27 
 
 		 225 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1235  protein of unknown function DUF752  22.49 
 
 		 226 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.887893  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1332  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  30.88 
 
 		 668 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02209  hypothetical protein  30.88 
 
 		 668 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.334228  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2702  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  30.88 
 
 		 668 aa  44.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.673186  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0664  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.92 
 
 		 676 aa  45.1  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0436264  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02249  hypothetical protein  30.88 
 
 		 668 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.425785  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3465  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.97 
 
 		 668 aa  44.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2619  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  30.88 
 
 		 668 aa  44.3  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1222  spermidine synthase  30.87 
 
 		 510 aa  44.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00106657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0140  hypothetical protein  28.95 
 
 		 218 aa  44.3  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.946459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1328  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  30.88 
 
 		 668 aa  43.9  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.831924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2475  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  30.88 
 
 		 668 aa  43.9  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0640  hypothetical protein  23.61 
 
 		 227 aa  43.1  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000640329  normal  0.493062 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07050  hypothetical protein  22.27 
 
 		 226 aa  42.7  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1709  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.93 
 
 		 657 aa  42.7  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0318232 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>