129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_06381 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_06381  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  611  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06681  hypothetical protein  89.46 
 
 		 294 aa  538  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245122  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0612  hypothetical protein  81.73 
 
 		 301 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.930586  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06771  hypothetical protein  66.78 
 
 		 297 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1130  hypothetical protein  42.66 
 
 		 305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.398385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18881  hypothetical protein  44.06 
 
 		 313 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1327  hypothetical protein  38.29 
 
 		 330 aa  240  2e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0048  SAM-dependent methyltransferase  41.38 
 
 		 298 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.62416  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06691  hypothetical protein  40 
 
 		 298 aa  226  4e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.194908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3463  protein of unknown function DUF752  38.05 
 
 		 296 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0679006 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0840  protein of unknown function DUF752  41.5 
 
 		 289 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0811  protein of unknown function DUF752  41.5 
 
 		 289 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1941  hypothetical protein  36.18 
 
 		 298 aa  183  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1778  hypothetical protein  36.67 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773906  normal  0.904742 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0559  hypothetical protein  39.04 
 
 		 300 aa  170  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5281  protein of unknown function DUF752  36.55 
 
 		 293 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.338387 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10381  hypothetical protein  41.85 
 
 		 187 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  30 
 
 		 500 aa  98.2  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1933  hypothetical protein  31.19 
 
 		 254 aa  95.9  7e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0873  hypothetical protein  29.79 
 
 		 340 aa  92.8  7e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.197999  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0181  hypothetical protein  30.1 
 
 		 340 aa  92.4  9e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1581  hypothetical protein  31.77 
 
 		 338 aa  92  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1456  hypothetical protein  27.78 
 
 		 225 aa  89.4  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.439461  normal  0.0456624 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0147  hypothetical protein  29.39 
 
 		 366 aa  87.4  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.464612  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1730  hypothetical protein  29.83 
 
 		 340 aa  87.8  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.8235 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1602  protein of unknown function DUF752  28.5 
 
 		 220 aa  86.3  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3563  protein of unknown function DUF752  27.49 
 
 		 223 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158975  normal  0.127143 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0476  protein of unknown function DUF752  28.46 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2146  hypothetical protein  25.73 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1235  protein of unknown function DUF752  27.01 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.887893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3871  protein of unknown function DUF752  27.36 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0640  hypothetical protein  28.51 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000640329  normal  0.493062 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0140  hypothetical protein  25.39 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.946459  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07050  hypothetical protein  25.12 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3099  hypothetical protein  26.89 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3321  hypothetical protein  23.32 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4256  hypothetical protein  22.86 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000473463  hitchhiker  0.0000809329 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2539  hypothetical protein  27.69 
 
 		 266 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0656342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4769  hypothetical protein  24.24 
 
 		 221 aa  67  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1833  protein of unknown function DUF752  27.31 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3932  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.9 
 
 		 656 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2336  hypothetical protein  23.5 
 
 		 218 aa  65.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4488  protein of unknown function DUF752  25.37 
 
 		 223 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0144966  normal  0.226664 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0879  hypothetical protein  27.27 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0147  hypothetical protein  25.4 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00930427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1926  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  25.4 
 
 		 639 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0621  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.92 
 
 		 612 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1796  hypothetical protein  25.4 
 
 		 639 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0142  hypothetical protein  24.64 
 
 		 242 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0261  Radical SAM domain protein  24.91 
 
 		 564 aa  60.8  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1639  oxidoreductase, FAD-binding protein  24.58 
 
 		 660 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.562541  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4644  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  24.19 
 
 		 645 aa  58.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.683342  hitchhiker  0.0000257745 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3742  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.81 
 
 		 665 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0063824 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34940  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.7 
 
 		 653 aa  57  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1538  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.35 
 
 		 672 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0998844 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0764  hypothetical protein  26.92 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4505  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.89 
 
 		 656 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1709  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.58 
 
 		 657 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1359  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.24 
 
 		 657 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490609  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3066  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.27 
 
 		 655 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.16811 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2850  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.61 
 
 		 644 aa  54.3  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413253  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4098  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.64 
 
 		 659 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1751  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.26 
 
 		 654 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2424  hypothetical protein  26.81 
 
 		 637 aa  53.9  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3963  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.26 
 
 		 654 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.94523  normal  0.0279642 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0152  protein of unknown function DUF752  34.48 
 
 		 230 aa  54.3  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2432  queuine tRNA-ribosyltransferase  21.33 
 
 		 678 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.974463  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2519  queuine tRNA-ribosyltransferase  21.33 
 
 		 679 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0067  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.7 
 
 		 657 aa  53.1  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1343  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.76 
 
 		 654 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1277  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.14 
 
 		 667 aa  52.8  0.000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0226023  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0003  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.8 
 
 		 657 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1737  hypothetical protein  26.46 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3048  hypothetical protein  22.58 
 
 		 635 aa  51.2  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.115559  normal  0.0258128 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3401  hypothetical protein  22.05 
 
 		 674 aa  50.4  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.473665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3396  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.5 
 
 		 708 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0003  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.5 
 
 		 708 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3653  hypothetical protein  33.8 
 
 		 249 aa  49.3  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1871  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.19 
 
 		 672 aa  49.3  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0302238 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1927  hypothetical protein  23.56 
 
 		 617 aa  49.3  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1628  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.2 
 
 		 711 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0003  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.2 
 
 		 711 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2973  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.2 
 
 		 711 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03106  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  19.23 
 
 		 672 aa  48.5  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3369  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  31.25 
 
 		 673 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00235092  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2914  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.2 
 
 		 660 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0217  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.2 
 
 		 660 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2891  protein of unknown function DUF752  29.87 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0866147  normal  0.0591468 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1390  hypothetical protein  23.38 
 
 		 622 aa  47.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0664  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  36.84 
 
 		 676 aa  47.4  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0436264  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1208  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.41 
 
 		 612 aa  47.4  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3465  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  34.21 
 
 		 668 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4486  hypothetical protein  33.33 
 
 		 241 aa  47  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02249  hypothetical protein  32.89 
 
 		 668 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.425785  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2702  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  32.89 
 
 		 668 aa  46.2  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.673186  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02209  hypothetical protein  32.89 
 
 		 668 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.334228  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1332  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  32.89 
 
 		 668 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3808  hypothetical protein  25.53 
 
 		 682 aa  45.8  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.424966  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1964  hypothetical protein  23.19 
 
 		 653 aa  45.8  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1996  fused 5-methylaminomethyl-2-thiouridine-forming enzyme methyltransferase and FAD-dependent demodification enzyme  33.93 
 
 		 690 aa  45.8  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.155036  normal  0.387333 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>