136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0612 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0612  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.930586  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06381  hypothetical protein  81.73 
 
 		 303 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06681  hypothetical protein  84.01 
 
 		 294 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245122  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06771  hypothetical protein  68.47 
 
 		 297 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18881  hypothetical protein  41.53 
 
 		 313 aa  248  8e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1130  hypothetical protein  41.4 
 
 		 305 aa  248  1e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.398385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0048  SAM-dependent methyltransferase  42.76 
 
 		 298 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.62416  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1327  hypothetical protein  38.21 
 
 		 330 aa  237  1e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06691  hypothetical protein  41.72 
 
 		 298 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.194908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1941  hypothetical protein  37.63 
 
 		 298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3463  protein of unknown function DUF752  38.59 
 
 		 296 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0679006 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0840  protein of unknown function DUF752  41.16 
 
 		 289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0811  protein of unknown function DUF752  41.16 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0559  hypothetical protein  39.38 
 
 		 300 aa  180  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5281  protein of unknown function DUF752  38.62 
 
 		 293 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.338387 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1778  hypothetical protein  36.33 
 
 		 303 aa  168  8e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773906  normal  0.904742 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10381  hypothetical protein  41.94 
 
 		 187 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1933  hypothetical protein  34.65 
 
 		 254 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  30.32 
 
 		 500 aa  97.1  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1581  hypothetical protein  29.86 
 
 		 338 aa  95.9  7e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0181  hypothetical protein  28.62 
 
 		 340 aa  94.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0873  hypothetical protein  29.51 
 
 		 340 aa  94  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.197999  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0147  hypothetical protein  29.97 
 
 		 366 aa  90.1  4e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.464612  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1730  hypothetical protein  29.02 
 
 		 340 aa  89.7  5e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.8235 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1456  hypothetical protein  27.78 
 
 		 225 aa  89  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.439461  normal  0.0456624 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1602  protein of unknown function DUF752  29.27 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4769  hypothetical protein  25.51 
 
 		 221 aa  81.6  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3563  protein of unknown function DUF752  27.91 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158975  normal  0.127143 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1235  protein of unknown function DUF752  29.52 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.887893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0476  protein of unknown function DUF752  29.92 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0640  hypothetical protein  27.85 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000640329  normal  0.493062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3871  protein of unknown function DUF752  24.77 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0140  hypothetical protein  26.19 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.946459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3321  hypothetical protein  24.44 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4256  hypothetical protein  23.83 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000473463  hitchhiker  0.0000809329 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2336  hypothetical protein  25.5 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07050  hypothetical protein  24.64 
 
 		 226 aa  72  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4488  protein of unknown function DUF752  26.09 
 
 		 223 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0144966  normal  0.226664 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0142  hypothetical protein  24.55 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2539  hypothetical protein  26.98 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0656342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3099  hypothetical protein  25.7 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1833  protein of unknown function DUF752  27.48 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0261  Radical SAM domain protein  25.48 
 
 		 564 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2146  hypothetical protein  25.73 
 
 		 251 aa  67  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0879  hypothetical protein  25.69 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0147  hypothetical protein  24.65 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00930427  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1639  oxidoreductase, FAD-binding protein  27.05 
 
 		 660 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.562541  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34940  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.74 
 
 		 653 aa  65.9  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3742  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.34 
 
 		 665 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0063824 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0152  protein of unknown function DUF752  24.76 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1926  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  28.51 
 
 		 639 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1796  hypothetical protein  28.51 
 
 		 639 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0621  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.04 
 
 		 612 aa  60.1  0.00000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0764  hypothetical protein  29.51 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4098  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.73 
 
 		 659 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1343  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.5 
 
 		 654 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1751  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.27 
 
 		 654 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3963  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.39 
 
 		 654 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.94523  normal  0.0279642 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1538  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25 
 
 		 672 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0998844 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1709  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.66 
 
 		 657 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03106  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.86 
 
 		 672 aa  54.7  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1671  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.09 
 
 		 654 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.86051  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1277  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  29.76 
 
 		 667 aa  53.5  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0226023  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1737  hypothetical protein  26.73 
 
 		 225 aa  53.1  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0003  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.22 
 
 		 657 aa  52.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3048  hypothetical protein  23.83 
 
 		 635 aa  52.8  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.115559  normal  0.0258128 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1964  hypothetical protein  21.08 
 
 		 653 aa  52.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2481  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.37 
 
 		 668 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2891  protein of unknown function DUF752  34.38 
 
 		 240 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0866147  normal  0.0591468 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19400  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.5 
 
 		 654 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0825831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3465  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.83 
 
 		 668 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3369  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  33.87 
 
 		 673 aa  50.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00235092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0067  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.17 
 
 		 657 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002869  5-methylaminomethyl-2-thiouridine-forming enzyme MnmC  22.86 
 
 		 672 aa  51.2  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00103068  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1359  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.74 
 
 		 657 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490609  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3932  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.04 
 
 		 656 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1332  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  26.34 
 
 		 668 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0704  hypothetical protein  24.11 
 
 		 699 aa  50.4  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2519  queuine tRNA-ribosyltransferase  21.7 
 
 		 679 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0664  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  38.6 
 
 		 676 aa  50.4  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0436264  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2054  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  25.73 
 
 		 655 aa  50.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149668 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3066  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.9 
 
 		 655 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.16811 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2702  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.34 
 
 		 668 aa  50.4  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.673186  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02249  hypothetical protein  26.34 
 
 		 668 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.425785  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2432  queuine tRNA-ribosyltransferase  21.23 
 
 		 678 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.974463  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02209  hypothetical protein  26.34 
 
 		 668 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.334228  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1871  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.4 
 
 		 672 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0302238 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3396  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23 
 
 		 708 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0003  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23 
 
 		 708 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3359  hypothetical protein  29.03 
 
 		 219 aa  49.7  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2475  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.34 
 
 		 668 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1328  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.34 
 
 		 668 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.831924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1956  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.06 
 
 		 644 aa  49.3  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243551  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2850  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.69 
 
 		 644 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413253  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0217  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.69 
 
 		 660 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1628  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.69 
 
 		 711 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0003  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.69 
 
 		 711 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2973  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.69 
 
 		 711 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2619  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  36.21 
 
 		 668 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2568  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.85 
 
 		 666 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.580805  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>