137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1941 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1941  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  605  9.999999999999999e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3463  protein of unknown function DUF752  59.87 
 
 		 296 aa  312  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0679006 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0840  protein of unknown function DUF752  51.4 
 
 		 289 aa  292  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0811  protein of unknown function DUF752  51.05 
 
 		 289 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5281  protein of unknown function DUF752  50.34 
 
 		 293 aa  278  7e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.338387 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1778  hypothetical protein  50.69 
 
 		 303 aa  270  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773906  normal  0.904742 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0559  hypothetical protein  50 
 
 		 300 aa  268  5.9999999999999995e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18881  hypothetical protein  44.33 
 
 		 313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1130  hypothetical protein  45.73 
 
 		 305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.398385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06771  hypothetical protein  38.23 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0612  hypothetical protein  37.63 
 
 		 301 aa  202  6e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.930586  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0048  SAM-dependent methyltransferase  37.46 
 
 		 298 aa  199  3e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.62416  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06681  hypothetical protein  37.29 
 
 		 294 aa  198  9e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245122  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06691  hypothetical protein  37.67 
 
 		 298 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.194908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1327  hypothetical protein  41.95 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06381  hypothetical protein  36.18 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10381  hypothetical protein  40.98 
 
 		 187 aa  142  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  27.6 
 
 		 500 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1933  hypothetical protein  30.35 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0873  hypothetical protein  27.53 
 
 		 340 aa  97.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.197999  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1581  hypothetical protein  28.52 
 
 		 338 aa  97.4  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0181  hypothetical protein  27.17 
 
 		 340 aa  92.8  6e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0147  hypothetical protein  26.55 
 
 		 366 aa  91.7  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.464612  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1456  hypothetical protein  32.05 
 
 		 225 aa  87.8  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.439461  normal  0.0456624 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1730  hypothetical protein  25.82 
 
 		 340 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.8235 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3321  hypothetical protein  27.78 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07050  hypothetical protein  26.89 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4769  hypothetical protein  26.29 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0261  Radical SAM domain protein  26.74 
 
 		 564 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3099  hypothetical protein  27.36 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1833  protein of unknown function DUF752  30.41 
 
 		 229 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1737  hypothetical protein  29.91 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1796  hypothetical protein  26.43 
 
 		 639 aa  70.1  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1926  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  26.43 
 
 		 639 aa  70.1  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0476  protein of unknown function DUF752  24.3 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1235  protein of unknown function DUF752  27.36 
 
 		 226 aa  68.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.887893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3563  protein of unknown function DUF752  28.86 
 
 		 223 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158975  normal  0.127143 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4256  hypothetical protein  24.76 
 
 		 227 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000473463  hitchhiker  0.0000809329 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0640  hypothetical protein  23.94 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000640329  normal  0.493062 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2983  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  28.29 
 
 		 620 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2424  hypothetical protein  28.77 
 
 		 637 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2432  queuine tRNA-ribosyltransferase  32.38 
 
 		 678 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.974463  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1956  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.91 
 
 		 644 aa  65.1  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243551  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1538  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.8 
 
 		 672 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0998844 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0764  hypothetical protein  20.6 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0142  hypothetical protein  28.8 
 
 		 242 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1709  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.88 
 
 		 657 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2539  hypothetical protein  30.46 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0656342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2519  queuine tRNA-ribosyltransferase  31.4 
 
 		 679 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0879  hypothetical protein  30.46 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2850  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  28.31 
 
 		 644 aa  63.5  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413253  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0147  hypothetical protein  27.27 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00930427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3066  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.36 
 
 		 655 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.16811 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3048  hypothetical protein  30.36 
 
 		 635 aa  63.2  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.115559  normal  0.0258128 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1871  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  28.18 
 
 		 672 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0302238 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2806  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  35.29 
 
 		 675 aa  62.8  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.641074  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0140  hypothetical protein  29.44 
 
 		 218 aa  62  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.946459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3401  hypothetical protein  25.12 
 
 		 674 aa  62  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.473665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4098  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.11 
 
 		 659 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1602  protein of unknown function DUF752  25.23 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4644  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  27.73 
 
 		 645 aa  60.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.683342  hitchhiker  0.0000257745 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4488  protein of unknown function DUF752  24.45 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0144966  normal  0.226664 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0067  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.1 
 
 		 657 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1639  oxidoreductase, FAD-binding protein  26.87 
 
 		 660 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.562541  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3742  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.99 
 
 		 665 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0063824 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3871  protein of unknown function DUF752  23.21 
 
 		 226 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1458  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  37.76 
 
 		 675 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.622829  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0152  protein of unknown function DUF752  43.21 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2146  hypothetical protein  26.64 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2343  hypothetical protein  25.81 
 
 		 637 aa  56.6  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.955559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1927  hypothetical protein  33.73 
 
 		 617 aa  55.8  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3465  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  37.36 
 
 		 668 aa  55.8  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02249  hypothetical protein  37.36 
 
 		 668 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.425785  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02209  hypothetical protein  37.36 
 
 		 668 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.334228  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1277  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.93 
 
 		 667 aa  55.5  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0226023  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2619  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  37.36 
 
 		 668 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2054  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  26.67 
 
 		 655 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149668 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2608  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.54 
 
 		 666 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1332  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  37.36 
 
 		 668 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.86 
 
 		 677 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2377  hypothetical protein  23.47 
 
 		 667 aa  54.7  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.954774 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1964  hypothetical protein  26.09 
 
 		 653 aa  54.7  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2475  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  37.36 
 
 		 668 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3369  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  35.04 
 
 		 673 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00235092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1861  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  25 
 
 		 661 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1328  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  37.36 
 
 		 668 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.831924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2702  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  37.36 
 
 		 668 aa  54.7  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.673186  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2732  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.01 
 
 		 666 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2481  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  36.26 
 
 		 668 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3230  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.93 
 
 		 657 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2336  hypothetical protein  25.37 
 
 		 218 aa  52.4  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1410  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  30.77 
 
 		 689 aa  52.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000203784  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0372  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  30.77 
 
 		 689 aa  52.4  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000353518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1519  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  30.77 
 
 		 689 aa  52.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0252518  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0704  hypothetical protein  24.11 
 
 		 699 aa  52  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1887  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.87 
 
 		 672 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2519  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.54 
 
 		 666 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0743  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  23.29 
 
 		 668 aa  51.6  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1751  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.03 
 
 		 654 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1378  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.22 
 
 		 668 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>