More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1428 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2432  queuine tRNA-ribosyltransferase  92.18 
 
 
678 aa  1160    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.974463  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2519  queuine tRNA-ribosyltransferase  91.75 
 
 
679 aa  1167    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
677 aa  1325    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2402  queuine tRNA-ribosyltransferase  71.17 
 
 
726 aa  919    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.16 
 
 
370 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.6 
 
 
372 aa  368  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.59 
 
 
370 aa  366  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.16 
 
 
372 aa  369  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 
395 aa  366  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2757  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.22 
 
 
386 aa  365  1e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.717518 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0681  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.28 
 
 
370 aa  364  2e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.111123  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.91 
 
 
371 aa  364  3e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.77 
 
 
369 aa  364  4e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.15 
 
 
375 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.67 
 
 
372 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.3 
 
 
371 aa  363  8e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.48 
 
 
368 aa  362  9e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0052  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.43 
 
 
392 aa  362  1e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.16 
 
 
375 aa  362  1e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.62 
 
 
368 aa  361  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_52  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.43 
 
 
392 aa  362  2e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000223938  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.25 
 
 
392 aa  360  4e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.57 
 
 
382 aa  360  4e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.21 
 
 
368 aa  360  6e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1406  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
374 aa  359  9.999999999999999e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937214  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.45 
 
 
380 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  52.16 
 
 
371 aa  358  2.9999999999999997e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.72 
 
 
373 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.16 
 
 
392 aa  357  3.9999999999999996e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.56 
 
 
385 aa  356  6.999999999999999e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1470  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
377 aa  356  7.999999999999999e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.14 
 
 
394 aa  355  1e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.62 
 
 
355 aa  355  2e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1061  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.57 
 
 
374 aa  354  2e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2833  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.59 
 
 
372 aa  355  2e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1703  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.15 
 
 
383 aa  354  2e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108277  normal  0.62465 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2844  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 
377 aa  354  4e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.73 
 
 
374 aa  353  5e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1524  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.15 
 
 
383 aa  353  5.9999999999999994e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000558338  normal  0.0203734 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2182  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
374 aa  353  5.9999999999999994e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.56 
 
 
370 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1927  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.99 
 
 
383 aa  353  7e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000713351  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2892  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.15 
 
 
377 aa  352  2e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.103545  hitchhiker  0.000645764 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.6 
 
 
365 aa  352  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.61 
 
 
370 aa  351  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.93 
 
 
370 aa  351  3e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.29 
 
 
374 aa  350  4e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000574895  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1401  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.31 
 
 
377 aa  350  4e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000397481  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0820  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.63 
 
 
387 aa  350  5e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1382  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.57 
 
 
374 aa  350  6e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000246245  hitchhiker  0.0000118913 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1447  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.57 
 
 
374 aa  350  6e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000328041  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1435  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.57 
 
 
374 aa  350  6e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000652098  hitchhiker  0.000858372 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.05 
 
 
372 aa  350  7e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1114  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
373 aa  349  8e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.34463  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004367  tRNA-guanine transglycosylase  45.92 
 
 
382 aa  348  1e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2807  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.29 
 
 
374 aa  349  1e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311087  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1570  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 
374 aa  349  1e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000109087  hitchhiker  0.000000108069 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2882  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 
374 aa  349  1e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000363226  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2787  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 
374 aa  349  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000135544  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0270  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.41 
 
 
379 aa  348  1e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147453  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.57 
 
 
371 aa  348  2e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.38 
 
 
379 aa  348  2e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.16 
 
 
375 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0451  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.16 
 
 
375 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0945287  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0444  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.16 
 
 
375 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0445  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.16 
 
 
375 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2476  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.86 
 
 
383 aa  348  2e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0464  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.16 
 
 
375 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.992026  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.74 
 
 
379 aa  348  3e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.74 
 
 
379 aa  348  3e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2337  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.29 
 
 
374 aa  347  3e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00144843  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0875  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.04 
 
 
375 aa  347  4e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.68635  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.44 
 
 
387 aa  347  4e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2214  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.01 
 
 
374 aa  347  4e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00238944  normal  0.155586 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3143  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.23 
 
 
390 aa  347  5e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.38 
 
 
369 aa  347  5e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114064  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2702  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.48 
 
 
374 aa  347  5e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000654614  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3123  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.44 
 
 
374 aa  347  6e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00561158  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01046  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.8 
 
 
378 aa  347  6e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3264  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.44 
 
 
374 aa  347  6e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000400897  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3384  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.44 
 
 
374 aa  347  6e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000344335  normal  0.488605 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3113  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.29 
 
 
374 aa  346  7e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3291  queuine tRNA-ribosyltransferase  48 
 
 
381 aa  346  8.999999999999999e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2193  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.57 
 
 
374 aa  346  8.999999999999999e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0616046  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0508  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.3 
 
 
388 aa  345  1e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.5 
 
 
379 aa  345  1e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.71 
 
 
381 aa  345  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0833  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.71 
 
 
371 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.936074  normal  0.0233256 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3870  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.97 
 
 
390 aa  345  2e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.41663  normal  0.550256 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0863  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.71 
 
 
377 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0466  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.77 
 
 
398 aa  345  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114256  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3733  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.88 
 
 
375 aa  345  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.812012  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0710  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.53 
 
 
376 aa  345  2e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1340  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.68 
 
 
376 aa  345  2e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.20108  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1268  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.3 
 
 
376 aa  345  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236624  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.18 
 
 
379 aa  344  2.9999999999999997e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2352  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.74 
 
 
391 aa  344  2.9999999999999997e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1215  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.74 
 
 
385 aa  344  2.9999999999999997e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.557932 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4345  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.71 
 
 
377 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000330572 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1231  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.01 
 
 
369 aa  343  4e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.579512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>