138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1933 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1933  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  527  1e-149  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  29.67 
 
 		 500 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1581  hypothetical protein  38.79 
 
 		 338 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0559  hypothetical protein  33.78 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1941  hypothetical protein  30.35 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0612  hypothetical protein  34.65 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.930586  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0840  protein of unknown function DUF752  34.04 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5281  protein of unknown function DUF752  31.78 
 
 		 293 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.338387 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0811  protein of unknown function DUF752  33.62 
 
 		 289 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3463  protein of unknown function DUF752  30.08 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0679006 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1778  hypothetical protein  30.64 
 
 		 303 aa  102  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773906  normal  0.904742 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06771  hypothetical protein  31.71 
 
 		 297 aa  99.8  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0147  hypothetical protein  31.51 
 
 		 366 aa  99.8  4e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.464612  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0181  hypothetical protein  34.42 
 
 		 340 aa  98.6  8e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1730  hypothetical protein  35.29 
 
 		 340 aa  97.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.8235 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0873  hypothetical protein  31.17 
 
 		 340 aa  97.1  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.197999  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06381  hypothetical protein  31.19 
 
 		 303 aa  95.9  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06681  hypothetical protein  31.53 
 
 		 294 aa  95.9  6e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245122  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18881  hypothetical protein  30.5 
 
 		 313 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1130  hypothetical protein  32.02 
 
 		 305 aa  92.4  7e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.398385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0048  SAM-dependent methyltransferase  31.3 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.62416  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06691  hypothetical protein  30.43 
 
 		 298 aa  86.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.194908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1327  hypothetical protein  27.31 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0879  hypothetical protein  28.22 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3099  hypothetical protein  30.56 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2539  hypothetical protein  27.72 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0656342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1538  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  28.87 
 
 		 672 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0998844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3871  protein of unknown function DUF752  28.7 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0142  hypothetical protein  27.45 
 
 		 242 aa  72  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1235  protein of unknown function DUF752  30.66 
 
 		 226 aa  72  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.887893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1871  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  28.03 
 
 		 672 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0302238 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0640  hypothetical protein  28.92 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000640329  normal  0.493062 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1956  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.61 
 
 		 644 aa  68.9  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243551  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0261  Radical SAM domain protein  30.93 
 
 		 564 aa  66.2  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4769  hypothetical protein  26.73 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3563  protein of unknown function DUF752  27.59 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158975  normal  0.127143 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1709  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  29.61 
 
 		 657 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1602  protein of unknown function DUF752  27.67 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0764  hypothetical protein  25.33 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4256  hypothetical protein  25 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000473463  hitchhiker  0.0000809329 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4488  protein of unknown function DUF752  24.53 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0144966  normal  0.226664 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0476  protein of unknown function DUF752  26.64 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10381  hypothetical protein  27.93 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07050  hypothetical protein  27.88 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1977  hypothetical protein  25.98 
 
 		 697 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1456  hypothetical protein  26.03 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.439461  normal  0.0456624 
 
 
-
 
NC_002950  PG2146  hypothetical protein  28.38 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1378  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.38 
 
 		 668 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3369  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.92 
 
 		 673 aa  60.1  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00235092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0152  protein of unknown function DUF752  26.34 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2336  hypothetical protein  26.92 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0147  hypothetical protein  25.37 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00930427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1358  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.7 
 
 		 672 aa  58.5  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0608182  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  32.41 
 
 		 677 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1887  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.32 
 
 		 672 aa  57  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3321  hypothetical protein  24.14 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1926  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  24.88 
 
 		 639 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0140  hypothetical protein  26.29 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.946459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1796  hypothetical protein  24.77 
 
 		 639 aa  55.5  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3808  hypothetical protein  23.5 
 
 		 682 aa  55.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.424966  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2519  queuine tRNA-ribosyltransferase  30.91 
 
 		 679 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1964  hypothetical protein  25.94 
 
 		 653 aa  54.3  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2402  queuine tRNA-ribosyltransferase  34.31 
 
 		 726 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3066  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.53 
 
 		 655 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.16811 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2432  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.81 
 
 		 678 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.974463  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2850  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.19 
 
 		 644 aa  53.5  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413253  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1701  hypothetical protein  24.02 
 
 		 696 aa  52.4  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1751  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  36.62 
 
 		 654 aa  52  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3465  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  31.76 
 
 		 668 aa  52  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3963  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  36.62 
 
 		 654 aa  52  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.94523  normal  0.0279642 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1343  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  32.14 
 
 		 654 aa  52  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2586  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.02 
 
 		 675 aa  52  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2806  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.56 
 
 		 675 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.641074  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4486  hypothetical protein  24.52 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2732  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  31.76 
 
 		 666 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2621  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  31.76 
 
 		 666 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000350397 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4505  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.73 
 
 		 656 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3048  hypothetical protein  22.77 
 
 		 635 aa  50.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.115559  normal  0.0258128 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2519  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  31.76 
 
 		 666 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2608  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  31.76 
 
 		 666 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0704  hypothetical protein  22.94 
 
 		 699 aa  50.1  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3384  hypothetical protein  21.67 
 
 		 705 aa  50.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34940  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.18 
 
 		 653 aa  50.1  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2481  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.96 
 
 		 668 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4098  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.56 
 
 		 659 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2475  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  30.59 
 
 		 668 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2619  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  30.59 
 
 		 668 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4644  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  24.39 
 
 		 645 aa  49.7  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.683342  hitchhiker  0.0000257745 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1328  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  30.59 
 
 		 668 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.831924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1458  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.74 
 
 		 675 aa  49.7  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.622829  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2568  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  31.76 
 
 		 666 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.580805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1410  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.34 
 
 		 689 aa  49.3  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000203784  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0372  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.34 
 
 		 689 aa  49.3  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000353518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1519  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.34 
 
 		 689 aa  49.3  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0252518  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3742  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.61 
 
 		 665 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0063824 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3653  hypothetical protein  23.81 
 
 		 249 aa  48.9  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1332  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  29.41 
 
 		 668 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03106  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.79 
 
 		 672 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1359  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  33.8 
 
 		 657 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490609  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2702  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  29.41 
 
 		 668 aa  48.5  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.673186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>