56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_14496 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009357  OSTLU_14496  predicted protein  100 
 
 
314 aa  632  1e-180  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.161441  normal  0.197799 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_24687  predicted protein  29.34 
 
 
730 aa  88.6  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.818146  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27350  hypothetical protein  27.59 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2313  hypothetical protein  28.87 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2143  spermidine synthase-like protein  26.76 
 
 
259 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.122833  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3621  hypothetical protein  26.07 
 
 
253 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1773  hypothetical protein  26.07 
 
 
253 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.738032  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15340  hypothetical protein  28.64 
 
 
249 aa  60.8  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  27.44 
 
 
255 aa  57.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  28.33 
 
 
285 aa  57.4  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  28.16 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1476  hypothetical protein  26.07 
 
 
262 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251712  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  32.26 
 
 
275 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  32.26 
 
 
277 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3989  hypothetical protein  25.33 
 
 
251 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0913  spermidine synthase-like  29.71 
 
 
253 aa  53.5  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  28 
 
 
285 aa  53.1  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  27.62 
 
 
281 aa  52.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1867  hypothetical protein  25.82 
 
 
251 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3848  hypothetical protein  25.82 
 
 
261 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0392798  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1442  hypothetical protein  24.41 
 
 
251 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.280635 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2736  hypothetical protein  27.66 
 
 
752 aa  49.7  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  24 
 
 
308 aa  49.3  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  28.46 
 
 
261 aa  48.9  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  25.62 
 
 
271 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  26 
 
 
248 aa  48.5  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0275  spermidine synthase  31.18 
 
 
293 aa  47.8  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0154876  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2285  putative spermidine synthase  28.51 
 
 
256 aa  47.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0277  spermidine synthase  31.18 
 
 
296 aa  47.8  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.173175  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3414  hypothetical protein  29.69 
 
 
253 aa  47.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.730904  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2748  hypothetical protein  29.69 
 
 
259 aa  47.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.690701  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  28.57 
 
 
541 aa  47  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  21.93 
 
 
307 aa  45.8  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0958  hypothetical protein  24.55 
 
 
270 aa  45.8  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117269  hitchhiker  0.00182599 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1067  hypothetical protein  29.75 
 
 
254 aa  45.8  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.153628  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  25 
 
 
311 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  25.83 
 
 
533 aa  45.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  26.5 
 
 
516 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  27.72 
 
 
259 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2497  hypothetical protein  26.88 
 
 
310 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00914951  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3240  hypothetical protein  26.75 
 
 
255 aa  44.3  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0941  hypothetical protein  26.06 
 
 
251 aa  43.9  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.330674  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  28.26 
 
 
278 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  24.62 
 
 
490 aa  44.3  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1326  spermidine synthase  25.19 
 
 
295 aa  43.9  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  29.38 
 
 
257 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  27.05 
 
 
289 aa  43.5  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  23.73 
 
 
302 aa  43.5  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1694  integral membrane protein-like  30.33 
 
 
678 aa  43.1  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0225851  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2560  hypothetical protein  28.65 
 
 
789 aa  43.1  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  21 
 
 
558 aa  42.7  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0836  hypothetical protein  25.98 
 
 
258 aa  42.7  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44275  predicted protein  27.27 
 
 
824 aa  42.7  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  27.42 
 
 
284 aa  42.7  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3670  spermidine synthase-like protein  29.66 
 
 
261 aa  42.7  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27620  spermidine synthase  26.98 
 
 
257 aa  42.4  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.090706  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>