84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2884 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2884  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.181441  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4454  TPR repeat-containing protein  64.2 
 
 		 177 aa  224  4e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0399  TPR repeat-containing protein  61.67 
 
 		 178 aa  222  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0431  Tetratricopeptide domain protein  62.22 
 
 		 178 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3118  TPR repeat-containing protein  57.95 
 
 		 181 aa  205  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.202741  normal  0.0573831 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2801  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.48 
 
 		 186 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318638  normal  0.053059 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3065  hypothetical protein  32.48 
 
 		 186 aa  89  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0081027  normal  0.712309 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1844  hypothetical protein  30.83 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.35393 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0360  tetratricopeptide TPR_2  37.11 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3432  TPR repeat-containing protein  38.38 
 
 		 153 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3702  TPR repeat-containing protein  40.96 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.604438 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3236  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.076369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2305  TPR repeat-containing protein  33.07 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  39.22 
 
 		 734 aa  58.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3457  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1010  tetratricopeptide TPR_2  25.32 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5172  hypothetical protein  31.96 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163802  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2074  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 163 aa  53.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6947  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 412 aa  52  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0148309  normal  0.609148 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  33.33 
 
 		 700 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  39.74 
 
 		 716 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.41 
 
 		 810 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1850  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 		 123 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1876  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 		 123 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 1276 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 		 878 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2197  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 178 aa  47.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670804 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.03 
 
 		 632 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 202 aa  46.2  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 1737 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  46.3 
 
 		 713 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 		 605 aa  45.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1754  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 		 184 aa  45.1  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107491  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  39.74 
 
 		 3560 aa  45.1  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  38.03 
 
 		 875 aa  45.1  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  37.84 
 
 		 560 aa  45.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  37.65 
 
 		 699 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1289  hypothetical protein  33.33 
 
 		 206 aa  45.1  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  35.38 
 
 		 329 aa  45.1  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 657 aa  44.7  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  32.1 
 
 		 290 aa  43.9  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 		 827 aa  44.3  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.97 
 
 		 249 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.68 
 
 		 1022 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.97 
 
 		 249 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3719  tetratricopeptide TPR_2  27.72 
 
 		 267 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 243 aa  43.9  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  32.93 
 
 		 743 aa  44.3  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  32.94 
 
 		 623 aa  43.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.42 
 
 		 3145 aa  43.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.96 
 
 		 784 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6465  TPR repeat-containing protein  34.33 
 
 		 396 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.592241  normal  0.571031 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3645  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 		 266 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.21 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.104926  normal  0.485023 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 649 aa  42.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  34.62 
 
 		 321 aa  42.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 		 715 aa  42.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  29.9 
 
 		 745 aa  42.4  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  32.5 
 
 		 1979 aa  42.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0587  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.53 
 
 		 1393 aa  42.4  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.836601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2908  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 203 aa  42  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0269  TPR repeat-containing protein  34.23 
 
 		 267 aa  42  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1983  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.06 
 
 		 142 aa  41.6  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5712  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 		 396 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.513235 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.53 
 
 		 818 aa  41.6  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2423  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.45 
 
 		 415 aa  42  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  37.33 
 
 		 4489 aa  41.6  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 		 162 aa  41.6  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 792 aa  41.6  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1157  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 		 522 aa  41.2  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  30.59 
 
 		 820 aa  41.2  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 638 aa  41.2  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3581  tetratricopeptide TPR_4  27.1 
 
 		 272 aa  41.2  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211804  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  31.53 
 
 		 417 aa  41.2  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2747  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 617 aa  40.8  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538174  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  40.35 
 
 		 402 aa  40.8  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 750 aa  40.8  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 		 722 aa  40.8  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  26.21 
 
 		 577 aa  40.8  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 412 aa  40.8  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 		 670 aa  40.8  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  31.75 
 
 		 884 aa  40.8  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  26.21 
 
 		 577 aa  40.8  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>