24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3065 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3065  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  387  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0081027  normal  0.712309 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2801  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  99.46 
 
 		 186 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318638  normal  0.053059 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1010  tetratricopeptide TPR_2  41.77 
 
 		 181 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1844  hypothetical protein  46.67 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.35393 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0431  Tetratricopeptide domain protein  32.77 
 
 		 178 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3118  TPR repeat-containing protein  35.33 
 
 		 181 aa  101  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.202741  normal  0.0573831 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0399  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 		 178 aa  98.2  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4454  TPR repeat-containing protein  34.43 
 
 		 177 aa  97.1  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2884  hypothetical protein  32.48 
 
 		 177 aa  89  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.181441  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2305  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 307 aa  51.6  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5172  hypothetical protein  30.61 
 
 		 181 aa  51.2  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163802  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2197  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670804 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3236  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 178 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.076369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3432  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 153 aa  48.5  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.96 
 
 		 725 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  27.2 
 
 		 587 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  34.43 
 
 		 875 aa  43.9  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  35.8 
 
 		 648 aa  43.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  26.98 
 
 		 545 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  28.57 
 
 		 887 aa  42.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2715  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 702 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.287445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3867  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 1116 aa  41.6  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.409704  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  30.86 
 
 		 577 aa  41.2  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  35.53 
 
 		 878 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>