79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0399 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0399  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 178 aa  362  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0431  Tetratricopeptide domain protein  90.45 
 
 		 178 aa  332  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2884  hypothetical protein  61.67 
 
 		 177 aa  222  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.181441  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4454  TPR repeat-containing protein  60.23 
 
 		 177 aa  213  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3118  TPR repeat-containing protein  52.57 
 
 		 181 aa  191  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.202741  normal  0.0573831 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2801  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.68 
 
 		 186 aa  99  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318638  normal  0.053059 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3065  hypothetical protein  30.68 
 
 		 186 aa  98.2  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0081027  normal  0.712309 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3432  TPR repeat-containing protein  40.62 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1844  hypothetical protein  30.22 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.35393 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1010  tetratricopeptide TPR_2  29.61 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0360  tetratricopeptide TPR_2  27.16 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3236  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 		 178 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.076369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2305  TPR repeat-containing protein  37.25 
 
 		 307 aa  65.5  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3702  TPR repeat-containing protein  36.08 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.604438 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2074  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5172  hypothetical protein  27.12 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163802  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3457  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2197  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670804 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 		 326 aa  49.3  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4888  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 162 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  37.36 
 
 		 734 aa  47.8  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1754  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107491  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 		 827 aa  47  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.65 
 
 		 632 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.71 
 
 		 196 aa  45.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.104926  normal  0.485023 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  39.68 
 
 		 1276 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 290 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 713 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2379  hypothetical protein  30.56 
 
 		 283 aa  44.7  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.91 
 
 		 810 aa  44.3  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 329 aa  43.9  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.11 
 
 		 249 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 291 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.11 
 
 		 249 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 716 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 		 1737 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 		 279 aa  43.9  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5686  TPR domain-containing protein  28.57 
 
 		 279 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 3145 aa  43.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3954  tetratricopeptide TPR_2  28.04 
 
 		 260 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1983  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.59 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6947  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 		 412 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0148309  normal  0.609148 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 		 955 aa  43.5  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 		 4489 aa  43.5  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 286 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2910  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.81 
 
 		 257 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0603977  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2655  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 250 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 878 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 		 425 aa  42  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 		 213 aa  42.4  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 301 aa  42  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 1406 aa  42.4  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  38.33 
 
 		 560 aa  42  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2020  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 243 aa  42.4  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 		 3301 aa  42  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3526  tetratricopeptide TPR_2  30.23 
 
 		 281 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.476305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  29.36 
 
 		 597 aa  42  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2822  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 		 257 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 		 988 aa  41.6  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 286 aa  42  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0295  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 290 aa  42  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0739  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 		 75 aa  41.6  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.725007 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 286 aa  42  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 		 4079 aa  41.6  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  33.78 
 
 		 875 aa  41.6  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  29.63 
 
 		 577 aa  41.2  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 		 699 aa  41.6  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0407  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 177 aa  41.2  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644736  normal  0.04042 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  29.17 
 
 		 745 aa  41.2  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.86 
 
 		 784 aa  40.8  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  34.67 
 
 		 3035 aa  40.8  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  29.63 
 
 		 577 aa  40.8  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 589 aa  40.8  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 292 aa  40.8  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 1121 aa  40.8  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3719  tetratricopeptide TPR_2  25.71 
 
 		 267 aa  40.8  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2423  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.91 
 
 		 415 aa  40.8  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0587  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 1393 aa  40.8  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.836601  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>