110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0587 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0587  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 1393 aa  2860    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.836601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  27.07 
 
 		 826 aa  123  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  28.97 
 
 		 829 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2061  hypothetical protein  24.5 
 
 		 841 aa  87.8  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119992  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  38.95 
 
 		 1121 aa  66.6  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  36.96 
 
 		 217 aa  62  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 		 543 aa  59.3  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  38.64 
 
 		 620 aa  59.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2791  TPR repeat-containing protein  36.63 
 
 		 243 aa  58.9  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  32.43 
 
 		 267 aa  58.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  38.64 
 
 		 620 aa  57.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2284  hypothetical protein  29.63 
 
 		 281 aa  57  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.82127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 		 1486 aa  55.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 265 aa  55.5  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 1827 aa  55.5  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 414 aa  55.1  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 366 aa  55.1  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  37.65 
 
 		 244 aa  55.1  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  32.94 
 
 		 266 aa  54.3  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  25.55 
 
 		 890 aa  54.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  34.44 
 
 		 927 aa  53.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  29.25 
 
 		 417 aa  54.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1564  TPR repeat-containing protein  44.64 
 
 		 199 aa  53.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 716 aa  52.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.43 
 
 		 297 aa  52.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.43 
 
 		 297 aa  52.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.53 
 
 		 296 aa  52.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1983  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.16 
 
 		 142 aa  52  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 213 aa  51.6  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  40.54 
 
 		 1069 aa  52  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  39.77 
 
 		 560 aa  51.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  30.39 
 
 		 252 aa  51.2  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 162 aa  51.2  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 280 aa  50.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 619 aa  50.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 		 3560 aa  50.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  33.33 
 
 		 622 aa  50.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1876  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 123 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  40.62 
 
 		 4489 aa  50.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  37.65 
 
 		 1094 aa  50.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1850  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 123 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 499 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 4079 aa  50.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.81 
 
 		 265 aa  50.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.26 
 
 		 397 aa  49.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2004  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 236 aa  49.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.149426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 		 713 aa  49.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2305  TPR repeat-containing protein  34.41 
 
 		 307 aa  49.7  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  33.33 
 
 		 764 aa  49.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  35 
 
 		 334 aa  49.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  33.02 
 
 		 742 aa  49.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 		 699 aa  49.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 265 aa  49.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.05 
 
 		 711 aa  49.3  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.317292  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  30.87 
 
 		 732 aa  49.3  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 626 aa  49.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 1276 aa  49.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.07 
 
 		 730 aa  49.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1770  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 		 173 aa  49.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 598 aa  48.9  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2742  tetratricopeptide TPR_2  31.11 
 
 		 390 aa  48.9  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.890739  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1476  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 226 aa  48.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818932  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 743 aa  48.9  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 		 523 aa  48.9  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2060  tetratricopeptide TPR_2  32.98 
 
 		 984 aa  48.5  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  35.23 
 
 		 887 aa  48.5  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0504  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 169 aa  48.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0681  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 375 aa  48.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  27.36 
 
 		 391 aa  47  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0928  calcium-binding EF-hand  29.27 
 
 		 431 aa  47  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0688898  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 565 aa  47.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 767 aa  47.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  29.09 
 
 		 1240 aa  47.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  34.83 
 
 		 1694 aa  47.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 		 3035 aa  47.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 657 aa  47.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0089  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 388 aa  47.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.159552  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1000  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 486 aa  47.8  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.326539  normal  0.768066 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.03 
 
 		 632 aa  47.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2796  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 621 aa  47.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1503  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.63 
 
 		 862 aa  46.6  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  28.91 
 
 		 871 aa  46.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  27.1 
 
 		 314 aa  46.6  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 		 162 aa  47  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0795  putative PAS/PAC sensor protein  29 
 
 		 458 aa  46.6  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0670898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 		 388 aa  47  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.53 
 
 		 810 aa  47  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 		 388 aa  47  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1101  Tetratricopeptide domain protein  32.97 
 
 		 216 aa  47  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.157985 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1019  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 273 aa  46.2  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 636 aa  46.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.69 
 
 		 836 aa  46.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  29.07 
 
 		 1138 aa  46.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 1451 aa  46.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 		 637 aa  45.8  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 		 243 aa  46.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 750 aa  46.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 1454 aa  46.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  36.56 
 
 		 667 aa  46.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 878 aa  46.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>