18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2284 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2284  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.82127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0587  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.63 
 
 		 1393 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.836601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  32.14 
 
 		 743 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 		 927 aa  46.2  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  32.5 
 
 		 576 aa  45.8  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 		 592 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3178  TPR repeat-containing protein  37.1 
 
 		 211 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0335083  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.14 
 
 		 711 aa  43.9  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.317292  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11910  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 		 394 aa  43.9  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000944223  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2980  TPR repeat-containing protein  37.1 
 
 		 208 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  35.62 
 
 		 1121 aa  43.5  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.24 
 
 		 629 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 		 750 aa  43.1  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2761  TPR repeat-containing protein  23.76 
 
 		 468 aa  42.7  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.594013  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  38.18 
 
 		 713 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 		 534 aa  42.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  27.57 
 
 		 519 aa  42.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  26.5 
 
 		 715 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>