73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2305 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2305  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 307 aa  605  9.999999999999999e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0360  tetratricopeptide TPR_2  35.9 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2074  TPR repeat-containing protein  45.54 
 
 		 163 aa  72  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3457  TPR repeat-containing protein  44.21 
 
 		 152 aa  70.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 713 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3432  TPR repeat-containing protein  35.04 
 
 		 153 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0431  Tetratricopeptide domain protein  38.78 
 
 		 178 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3702  TPR repeat-containing protein  37.76 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.604438 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0399  TPR repeat-containing protein  37.25 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3236  TPR repeat-containing protein  37.72 
 
 		 178 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.076369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 		 4079 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2884  hypothetical protein  33.07 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.181441  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4454  TPR repeat-containing protein  36.89 
 
 		 177 aa  57.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3118  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 		 181 aa  55.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.202741  normal  0.0573831 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2197  TPR repeat-containing protein  35.65 
 
 		 178 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670804 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  36.9 
 
 		 405 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 1069 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.23 
 
 		 632 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4888  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.71 
 
 		 162 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5172  hypothetical protein  36.49 
 
 		 181 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163802  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  36.9 
 
 		 399 aa  53.1  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2801  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.5 
 
 		 186 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318638  normal  0.053059 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  24.31 
 
 		 733 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3065  hypothetical protein  37.5 
 
 		 186 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0081027  normal  0.712309 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1754  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 184 aa  50.1  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107491  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.99 
 
 		 742 aa  49.7  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0587  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.41 
 
 		 1393 aa  49.7  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.836601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.77 
 
 		 2240 aa  49.3  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 207 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 		 1192 aa  48.5  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0896  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29 
 
 		 234 aa  48.5  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.323909  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1658  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  45.65 
 
 		 602 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 		 505 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  22.67 
 
 		 875 aa  47.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.01 
 
 		 707 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.07 
 
 		 397 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 566 aa  47  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  22.07 
 
 		 1979 aa  46.2  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  34.78 
 
 		 668 aa  46.6  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000479067  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  24.79 
 
 		 377 aa  45.8  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 		 927 aa  46.2  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 280 aa  45.8  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  26.24 
 
 		 586 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 		 543 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  24.77 
 
 		 417 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  40.51 
 
 		 601 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1010  tetratricopeptide TPR_2  33.93 
 
 		 181 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4127  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 655 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248641  normal  0.206732 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40924  predicted protein  26.76 
 
 		 375 aa  44.3  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.458934  normal  0.213634 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 		 714 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 402 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2165  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 137 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00018031  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6037  hypothetical protein  36.07 
 
 		 570 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.78 
 
 		 810 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 1406 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3329  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 397 aa  43.5  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 		 1276 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 		 1276 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2046  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.93 
 
 		 208 aa  43.5  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.278718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.07 
 
 		 250 aa  43.9  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58946e-23 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2352  tetratricopeptide TPR_2  31.06 
 
 		 201 aa  43.1  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.205488 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  31.63 
 
 		 222 aa  43.1  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 		 878 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  21.58 
 
 		 391 aa  43.1  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  22.73 
 
 		 566 aa  43.1  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2045  tetratricopeptide TPR_2  27.91 
 
 		 199 aa  42.7  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.00000000000222916  normal  0.0184394 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1261  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 185 aa  42.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.71 
 
 		 1694 aa  42.7  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1965  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 188 aa  42.7  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0650389  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  35.2 
 
 		 636 aa  42.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1220  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.13 
 
 		 399 aa  42.4  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0163733  hitchhiker  0.0019262 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  23.66 
 
 		 1213 aa  42.4  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>