75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1754 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1754  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 184 aa  362  1e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107491  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0407  TPR repeat-containing protein  48.63 
 
 		 177 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644736  normal  0.04042 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1029  tetratricopeptide TPR_2  41.55 
 
 		 176 aa  107  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3236  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.076369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2197  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670804 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13011  hypothetical protein  31.73 
 
 		 737 aa  52.8  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 3172 aa  52.4  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3248  tetratricopeptide TPR_2  30.63 
 
 		 433 aa  52.4  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 		 3301 aa  52.4  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2305  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 307 aa  50.1  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0986  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 		 479 aa  50.1  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.461111 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  31.82 
 
 		 622 aa  49.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0360  tetratricopeptide TPR_2  31.63 
 
 		 160 aa  49.7  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  33.8 
 
 		 417 aa  49.3  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  31.09 
 
 		 340 aa  48.9  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.07 
 
 		 725 aa  48.5  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.31 
 
 		 818 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.53 
 
 		 784 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  35.23 
 
 		 929 aa  47.8  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5172  hypothetical protein  26.85 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163802  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.54 
 
 		 839 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0399  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  32.05 
 
 		 799 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  29.41 
 
 		 442 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42758  predicted protein  27.33 
 
 		 1346 aa  45.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.59748  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1008  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 		 359 aa  45.8  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000389173  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2884  hypothetical protein  29.47 
 
 		 177 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.181441  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 1056 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 		 900 aa  45.1  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1030  cellulose synthase operon protein C  30.77 
 
 		 1230 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4639  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 		 311 aa  45.1  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3118  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 		 181 aa  45.1  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.202741  normal  0.0573831 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1336  hypothetical protein  32.54 
 
 		 627 aa  44.7  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3432  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 153 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0420  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  25.4 
 
 		 249 aa  43.9  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209508 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  34.57 
 
 		 643 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1291  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  25.4 
 
 		 249 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1184  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  25.4 
 
 		 249 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2888  type IV pilus biogenesis protein PilF, putative  28.12 
 
 		 255 aa  44.3  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0516  hypothetical protein  29.2 
 
 		 162 aa  44.3  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.643941 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 		 565 aa  43.9  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  33 
 
 		 266 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0431  Tetratricopeptide domain protein  23.57 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2074  TPR repeat-containing protein  34.86 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1922  tetratricopeptide TPR_2  23.48 
 
 		 142 aa  43.5  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2697  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 		 268 aa  43.5  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000108911  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 1069 aa  43.5  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 		 796 aa  43.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1138 aa  43.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  30.86 
 
 		 1154 aa  43.5  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 754 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  39.06 
 
 		 744 aa  42.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 927 aa  42.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 1276 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 931 aa  42.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 589 aa  42.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1702  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 		 226 aa  42.7  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0899  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.57 
 
 		 245 aa  42.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  31 
 
 		 764 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 		 311 aa  42  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.86 
 
 		 689 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.55 
 
 		 264 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0224916  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  29.13 
 
 		 864 aa  42  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.65 
 
 		 1034 aa  42  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 		 597 aa  42  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  40.35 
 
 		 577 aa  42  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0447  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 		 839 aa  42  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  40.35 
 
 		 577 aa  41.6  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.37 
 
 		 277 aa  41.6  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  32.33 
 
 		 444 aa  41.6  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 3145 aa  41.6  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  31.88 
 
 		 887 aa  41.2  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2382  photosystem I assembly protein Ycf3  31 
 
 		 173 aa  41.6  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2674  TPR repeat-containing protein  25.28 
 
 		 316 aa  41.2  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.717454  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 265 aa  40.8  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>