92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42758 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42758  predicted protein  100 
 
 		 1346 aa  2788    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.59748  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14940  predicted protein  24.41 
 
 		 1059 aa  99.4  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0306125  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00490  Pol II transcription elongation factor, putative  24.14 
 
 		 1186 aa  84  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.84309  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72239  protein required for normal CLN1 and CLN2 G1 cyclin expression  24.03 
 
 		 1120 aa  80.1  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0270618 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11128  RNA polymerase II transcription elongation factor (Ctr9), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G05870)  25.3 
 
 		 1027 aa  67.4  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0503014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.22 
 
 		 1056 aa  62.8  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.68 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 		 750 aa  56.2  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.79 
 
 		 927 aa  54.3  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.59 
 
 		 1737 aa  54.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.76 
 
 		 632 aa  53.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.29 
 
 		 586 aa  53.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  25.64 
 
 		 561 aa  52.4  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 792 aa  52  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.53 
 
 		 1056 aa  52.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  24.25 
 
 		 718 aa  52  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  25.64 
 
 		 561 aa  52  0.00009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  24.15 
 
 		 732 aa  51.6  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  28.28 
 
 		 650 aa  51.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1812  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 189 aa  50.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  23.12 
 
 		 700 aa  50.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2423  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.39 
 
 		 415 aa  50.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.11 
 
 		 810 aa  50.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  22.22 
 
 		 782 aa  50.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.33 
 
 		 363 aa  50.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3107  TPR repeat-containing protein  23.35 
 
 		 219 aa  49.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  29.01 
 
 		 587 aa  49.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.33 
 
 		 363 aa  49.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.77 
 
 		 624 aa  49.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.3 
 
 		 818 aa  49.3  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  22.72 
 
 		 878 aa  49.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  25.77 
 
 		 267 aa  49.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  21.42 
 
 		 4079 aa  49.3  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 466 aa  49.3  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  29.01 
 
 		 545 aa  49.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 		 392 aa  49.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  22.36 
 
 		 1276 aa  48.5  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  27.34 
 
 		 1101 aa  48.5  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36889  predicted protein  27.92 
 
 		 209 aa  48.5  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00688126  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  23.76 
 
 		 643 aa  48.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  33.75 
 
 		 882 aa  48.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4242  TPR repeat-containing protein  23.17 
 
 		 219 aa  47.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.07 
 
 		 384 aa  48.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 4489 aa  47.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 		 3145 aa  47.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4515  TPR domain protein  23.35 
 
 		 219 aa  48.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 		 2262 aa  48.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 523 aa  47.8  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  33.75 
 
 		 882 aa  48.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.54 
 
 		 645 aa  48.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000607684  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4127  TPR repeat-containing protein  23.17 
 
 		 219 aa  47.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0499017  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4475  TPR domain protein  23.17 
 
 		 219 aa  47.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000190548 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0721  TPR domain protein  22.75 
 
 		 219 aa  47.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4138  TPR repeat-containing protein  23.17 
 
 		 219 aa  47.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4290  TPR domain-containing protein  23.17 
 
 		 219 aa  47.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0073  cellulose synthase subunit BcsC  23.45 
 
 		 1164 aa  47  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 808 aa  47.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 		 258 aa  47.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 3035 aa  47  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 		 3560 aa  47  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4624  TPR domain-containing protein  23.17 
 
 		 219 aa  47.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472019  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4608  TPR repeat-containing protein  29.12 
 
 		 1404 aa  47.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.406661 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0070  cellulose synthase subunit BcsC  22.07 
 
 		 1159 aa  47  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.494386  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  24.86 
 
 		 864 aa  47.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4191  zinc finger/thioredoxin putative  29.13 
 
 		 392 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.49 
 
 		 647 aa  46.6  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.54 
 
 		 222 aa  46.6  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3735  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 707 aa  46.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4478  TPR domain-containing protein  22.56 
 
 		 219 aa  46.6  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.404717  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 713 aa  47  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.93 
 
 		 1022 aa  46.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  25.77 
 
 		 1067 aa  46.6  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4528  TPR domain protein  22.56 
 
 		 219 aa  46.6  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000798973  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.17 
 
 		 988 aa  46.2  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  26.94 
 
 		 1677 aa  46.2  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 1096 aa  46.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.2 
 
 		 466 aa  46.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1754  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 184 aa  46.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107491  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6434  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 230 aa  45.8  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257359  normal  0.680724 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0662  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.86 
 
 		 330 aa  46.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0114263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  22.43 
 
 		 573 aa  45.8  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.2 
 
 		 639 aa  46.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4323  MJ0042 family finger-like protein  28.16 
 
 		 382 aa  46.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0299  TPR repeat-containing protein  22.86 
 
 		 458 aa  45.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1811  TPR repeat-containing protein  40.54 
 
 		 596 aa  45.8  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.541585  normal  0.135887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6170  hypothetical protein  31.71 
 
 		 612 aa  45.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.198655 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  21.3 
 
 		 1073 aa  45.4  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2048  TPR repeat-containing protein  38.37 
 
 		 253 aa  45.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 568 aa  45.1  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.94 
 
 		 344 aa  45.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 		 344 aa  45.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.49 
 
 		 784 aa  45.1  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>