67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3118 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3118  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
181 aa  378  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.202741  normal  0.0573831 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4454  TPR repeat-containing protein  61.33 
 
 
177 aa  224  6e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2884  hypothetical protein  57.95 
 
 
177 aa  205  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.181441  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0399  TPR repeat-containing protein  52.57 
 
 
178 aa  191  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0431  Tetratricopeptide domain protein  58.39 
 
 
178 aa  190  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2801  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.33 
 
 
186 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318638  normal  0.053059 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3065  hypothetical protein  35.33 
 
 
186 aa  101  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0081027  normal  0.712309 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0360  tetratricopeptide TPR_2  39 
 
 
160 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3432  TPR repeat-containing protein  39.18 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1844  hypothetical protein  30.36 
 
 
177 aa  64.3  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.35393 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3236  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 
178 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.076369  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2074  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 
163 aa  60.8  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3702  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 
166 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.604438 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5172  hypothetical protein  31.37 
 
 
181 aa  58.2  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163802  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1010  tetratricopeptide TPR_2  27.45 
 
 
181 aa  55.8  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2305  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 
307 aa  55.1  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192767  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  40.96 
 
 
560 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3457  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 
152 aa  52  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88728  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2197  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 
178 aa  50.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0670804 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  34.51 
 
 
878 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  45.76 
 
 
292 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 
589 aa  48.1  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.78 
 
 
397 aa  48.1  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 
827 aa  47.8  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 
1276 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.18 
 
 
810 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  26.43 
 
 
243 aa  46.2  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2423  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.9 
 
 
415 aa  45.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  39.06 
 
 
3560 aa  45.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.33 
 
 
632 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1754  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 
184 aa  45.1  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107491  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 
3145 aa  45.1  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  35.23 
 
 
762 aa  44.7  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4888  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.15 
 
 
162 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 
4079 aa  44.7  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 
605 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  44.9 
 
 
363 aa  44.3  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  44.44 
 
 
734 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  42.37 
 
 
292 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  29.73 
 
 
456 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  32.1 
 
 
716 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3449  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 
357 aa  43.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395031  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  42.37 
 
 
290 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0823  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 
502 aa  42.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1387  TPR repeat-containing protein  38.57 
 
 
333 aa  42.4  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.316988  normal  0.93517 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.68 
 
 
790 aa  42.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  34.43 
 
 
792 aa  42.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2908  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
203 aa  42  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 
732 aa  42  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  37.1 
 
 
828 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 
754 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  33.78 
 
 
4489 aa  41.6  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  37.1 
 
 
828 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2020  TPR repeat-containing protein  34.43 
 
 
243 aa  41.6  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4410  TPR repeat-containing protein  33.96 
 
 
360 aa  41.6  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.204971  normal  0.0658159 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  41.18 
 
 
562 aa  41.2  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 
162 aa  41.6  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.67 
 
 
1022 aa  41.6  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  37.1 
 
 
833 aa  41.2  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 
988 aa  41.2  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 
847 aa  41.2  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.58 
 
 
286 aa  41.2  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.25 
 
 
466 aa  40.8  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  37.1 
 
 
833 aa  41.2  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
780 aa  41.2  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2559  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.32 
 
 
250 aa  40.8  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 
1737 aa  40.8  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>