15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4888 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4888  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 162 aa  318  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3457  TPR repeat-containing protein  72.44 
 
 		 152 aa  184  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3432  TPR repeat-containing protein  43.31 
 
 		 153 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0360  tetratricopeptide TPR_2  36.36 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2305  TPR repeat-containing protein  43.97 
 
 		 307 aa  67  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2074  TPR repeat-containing protein  45 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0431  Tetratricopeptide domain protein  33.67 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0399  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4454  TPR repeat-containing protein  38.16 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3702  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.604438 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3118  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 		 181 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.202741  normal  0.0573831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2884  hypothetical protein  32.48 
 
 		 177 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.181441  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  44.07 
 
 		 713 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  41.67 
 
 		 3035 aa  41.6  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5172  hypothetical protein  33.8 
 
 		 181 aa  41.2  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163802  normal  0.262777 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>