21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1844 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1844  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  350  8e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.35393 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3065  hypothetical protein  44.07 
 
 		 186 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0081027  normal  0.712309 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2801  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.07 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318638  normal  0.053059 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1010  tetratricopeptide TPR_2  41.46 
 
 		 181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0431  Tetratricopeptide domain protein  31.85 
 
 		 178 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0399  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 178 aa  84.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2884  hypothetical protein  30.59 
 
 		 177 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.181441  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4454  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3118  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 181 aa  67.4  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.202741  normal  0.0573831 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1812  TPR repeat-containing protein  53.33 
 
 		 189 aa  44.7  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3432  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3076  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 		 697 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2306  MCP methyltransferase, CheR-type  36.67 
 
 		 470 aa  41.6  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3681  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  36.67 
 
 		 510 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0294696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3788  MCP methyltransferase, CheR-type  37.36 
 
 		 472 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157072  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5515  MCP methyltransferase, CheR-type  36.67 
 
 		 520 aa  41.6  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201432  normal  0.747689 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4575  MCP methyltransferase, CheR-type  37.36 
 
 		 472 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0516  hypothetical protein  32.14 
 
 		 162 aa  41.6  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.643941 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2074  TPR repeat-containing protein  36.59 
 
 		 163 aa  41.6  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1956  TPR repeat-containing protein  38.96 
 
 		 271 aa  41.6  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  58.97 
 
 		 298 aa  40.8  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>