More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1956 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1956  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
271 aa  498  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2007  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  86.59 
 
 
270 aa  332  4e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.695904  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1922  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  90.38 
 
 
270 aa  329  3e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1897  TPR repeat-containing protein  63.06 
 
 
268 aa  279  4e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0935119 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 
685 aa  90.1  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  30.4 
 
 
875 aa  90.5  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 
681 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.03 
 
 
810 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 
878 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  30.56 
 
 
865 aa  86.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  29.51 
 
 
733 aa  85.5  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 
909 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 
3145 aa  84.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  27.78 
 
 
603 aa  80.1  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  27.54 
 
 
816 aa  80.5  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 
612 aa  80.1  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 
637 aa  79.7  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  35 
 
 
715 aa  79.3  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 
362 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  24.27 
 
 
750 aa  76.6  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  30.1 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 
3172 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  38.2 
 
 
833 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 
566 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 
649 aa  73.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
762 aa  72.8  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.05 
 
 
632 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.83 
 
 
725 aa  72  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  37.19 
 
 
714 aa  72  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.96 
 
 
3301 aa  71.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 
1421 aa  71.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 
643 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 
700 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  33.69 
 
 
708 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  33.16 
 
 
732 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  35.02 
 
 
1694 aa  70.5  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  33.33 
 
 
620 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 
739 aa  69.3  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 
374 aa  68.9  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 
718 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  26.44 
 
 
1154 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  27.94 
 
 
638 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  31.56 
 
 
620 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  23.73 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.11 
 
 
397 aa  66.2  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  35.38 
 
 
645 aa  65.9  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.46 
 
 
293 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  23.56 
 
 
832 aa  65.5  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
789 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  32.9 
 
 
714 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 
3035 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2764  TPR repeat-containing protein  39.72 
 
 
683 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762539  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 
776 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  33.83 
 
 
1005 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 
594 aa  63.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 
686 aa  64.3  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.23 
 
 
1737 aa  63.5  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 
486 aa  63.2  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7095  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.24 
 
 
354 aa  62.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.524118  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  32.68 
 
 
615 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 
502 aa  62.4  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 
505 aa  62  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 
583 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 
879 aa  61.6  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  34.34 
 
 
430 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  36.72 
 
 
833 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  31.05 
 
 
754 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 
542 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 
824 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  33.14 
 
 
602 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 
828 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 
643 aa  61.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  26.92 
 
 
622 aa  60.1  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 
503 aa  60.1  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 
284 aa  60.1  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.99 
 
 
798 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  37.72 
 
 
828 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 
754 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1518  TPR domain-containing protein  39.5 
 
 
258 aa  59.7  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3772  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 
208 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  32.58 
 
 
656 aa  59.7  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  20.47 
 
 
887 aa  59.7  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 
1406 aa  59.3  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.18 
 
 
1676 aa  58.9  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.58 
 
 
406 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.58 
 
 
406 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  24.08 
 
 
512 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  30 
 
 
653 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
653 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 
465 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  21.89 
 
 
462 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 
1276 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.91 
 
 
219 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.94 
 
 
818 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  42.72 
 
 
1106 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  29.09 
 
 
764 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  28.25 
 
 
808 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  23.94 
 
 
391 aa  57.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3476  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
634 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.287996  normal  0.161614 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>