More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2007 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2007  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 270 aa  495  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.695904  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1922  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  97.67 
 
 		 270 aa  362  3e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1956  TPR repeat-containing protein  89.58 
 
 		 271 aa  349  3e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1897  TPR repeat-containing protein  68.26 
 
 		 268 aa  277  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0935119 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 		 681 aa  90.1  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 		 685 aa  89  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  30.84 
 
 		 875 aa  88.2  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  30.81 
 
 		 865 aa  86.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.76 
 
 		 810 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 		 909 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  28.16 
 
 		 816 aa  83.2  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 		 3145 aa  82.8  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  27.92 
 
 		 603 aa  82  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 		 637 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 		 762 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  28.96 
 
 		 733 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 878 aa  79  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 		 612 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 		 3172 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  35.5 
 
 		 715 aa  75.9  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 		 750 aa  73.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  29.08 
 
 		 725 aa  73.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.15 
 
 		 632 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 566 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  36.68 
 
 		 714 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  33.66 
 
 		 1694 aa  69.7  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 		 739 aa  69.3  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 		 718 aa  69.3  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  34.57 
 
 		 732 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 		 3035 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  38.67 
 
 		 714 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 		 1421 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  37.29 
 
 		 833 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  24.75 
 
 		 3301 aa  66.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 643 aa  65.9  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.22 
 
 		 1737 aa  65.9  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  35.35 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 		 502 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 686 aa  65.1  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 		 583 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 789 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.18 
 
 		 798 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 		 486 aa  63.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 3560 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 		 808 aa  63.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  31.22 
 
 		 505 aa  63.5  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  33.18 
 
 		 645 aa  63.5  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  25.96 
 
 		 1154 aa  63.2  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 		 708 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 		 700 aa  62.8  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  31.08 
 
 		 594 aa  62.4  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  25.44 
 
 		 632 aa  62.4  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  41.46 
 
 		 776 aa  62.4  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  30.96 
 
 		 653 aa  62  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7095  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 354 aa  62  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.524118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  30.96 
 
 		 653 aa  62  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 542 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  29.39 
 
 		 620 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  25 
 
 		 682 aa  61.6  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2764  TPR repeat-containing protein  39.01 
 
 		 683 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762539  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  27.67 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 643 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  33.75 
 
 		 1005 aa  60.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  23.56 
 
 		 832 aa  60.1  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 		 824 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  28.63 
 
 		 620 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  28.74 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 		 754 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  29.58 
 
 		 448 aa  58.9  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  33.14 
 
 		 602 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  31.79 
 
 		 566 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1518  TPR domain-containing protein  39.5 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  26.92 
 
 		 622 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.98 
 
 		 689 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2937  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000196888  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1969  tetratricopeptide TPR_2  34.69 
 
 		 172 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.467519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2470  TPR repeat-containing protein  37.89 
 
 		 581 aa  58.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1114  TPR domain-containing protein  29.34 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0729535  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 870 aa  57.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.93 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  31.16 
 
 		 529 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  26.56 
 
 		 764 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 494 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  31.77 
 
 		 725 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  24.26 
 
 		 676 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  29.85 
 
 		 1486 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.96 
 
 		 4079 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  25.86 
 
 		 887 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  26.97 
 
 		 638 aa  57  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.35 
 
 		 2240 aa  57.4  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  41.75 
 
 		 1106 aa  57  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  32.29 
 
 		 514 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 927 aa  56.6  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0901  tfp pilus assembly protein PilF  25.58 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  41.75 
 
 		 656 aa  56.6  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>