15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1010 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1010  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 181 aa  374  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3065  hypothetical protein  39.66 
 
 		 186 aa  140  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0081027  normal  0.712309 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2801  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.66 
 
 		 186 aa  140  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318638  normal  0.053059 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1844  hypothetical protein  41.77 
 
 		 177 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.35393 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0431  Tetratricopeptide domain protein  30.46 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0399  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4454  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2884  hypothetical protein  27.22 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.181441  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3118  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.202741  normal  0.0573831 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3432  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2305  TPR repeat-containing protein  33.93 
 
 		 307 aa  45.8  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2074  TPR repeat-containing protein  37.88 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3236  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.076369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2298  tetratricopeptide TPR_2  30.19 
 
 		 664 aa  41.2  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  29.37 
 
 		 1073 aa  41.2  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>