36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0896 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0896  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 234 aa  456  1e-127  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.323909  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13630  hypothetical protein  33.33 
 
 		 621 aa  49.3  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3019  hypothetical protein  38.46 
 
 		 658 aa  48.9  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.882061  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  34.07 
 
 		 606 aa  48.5  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2305  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 581 aa  46.6  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 613 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  32.97 
 
 		 606 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3983  putative protoheme IX biogenesis protein  29.86 
 
 		 399 aa  45.8  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0176  putative protoheme IX biogenesis protein  29.1 
 
 		 398 aa  45.8  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  32.97 
 
 		 606 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 		 606 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 		 606 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  32.97 
 
 		 606 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  32.97 
 
 		 606 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  32.97 
 
 		 606 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 607 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1897  tetratricopeptide TPR_4  32.24 
 
 		 286 aa  44.3  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  28.02 
 
 		 1077 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 607 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1906  tetratricopeptide TPR_4  32.24 
 
 		 753 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.346521 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 607 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4444  Tetratricopeptide TPR_4  30.69 
 
 		 365 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457658  normal  0.0435915 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4174  putative protoheme IX biogenesis protein  27.78 
 
 		 397 aa  43.9  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4077  hypothetical protein  32.61 
 
 		 374 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313284  hitchhiker  0.00876664 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  29.67 
 
 		 607 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 		 607 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 		 607 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4396  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.83 
 
 		 602 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 		 613 aa  42.7  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0954  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 		 595 aa  42.4  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 592 aa  42.4  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 		 607 aa  42  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  24.47 
 
 		 573 aa  42  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1125  TPR domain-containing protein  26 
 
 		 457 aa  42  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  28.57 
 
 		 613 aa  42  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>