52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_13630 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_13630  hypothetical protein  100 
 
 		 621 aa  1149    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3800  hypothetical protein  43.58 
 
 		 633 aa  225  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22180  hypothetical protein  45.41 
 
 		 750 aa  197  6e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.314625  normal  0.946769 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25500  hypothetical protein  47.18 
 
 		 339 aa  194  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1513  hypothetical protein  40.97 
 
 		 680 aa  177  7e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6067  hypothetical protein  45.11 
 
 		 936 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2161  hypothetical protein  43.21 
 
 		 355 aa  172  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1906  tetratricopeptide TPR_4  50.46 
 
 		 753 aa  173  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.346521 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2042  hypothetical protein  42.59 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1512  hypothetical protein  36.68 
 
 		 640 aa  169  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000167269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5444  hypothetical protein  43.18 
 
 		 918 aa  159  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2020  hypothetical protein  38.76 
 
 		 480 aa  157  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3512  hypothetical protein  44.62 
 
 		 305 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.804632  normal  0.14913 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3293  hypothetical protein  46.44 
 
 		 285 aa  156  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1981  tetratricopeptide TPR_2  44.02 
 
 		 321 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1253  tetratricopeptide TPR_4  47.84 
 
 		 350 aa  152  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.222443 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1121  hypothetical protein  41.98 
 
 		 618 aa  152  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.642413 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1337  hypothetical protein  41.39 
 
 		 788 aa  152  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2969  hypothetical protein  47.89 
 
 		 277 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0801  hypothetical protein  38.74 
 
 		 591 aa  150  5e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0753536  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2998  hypothetical protein  47.42 
 
 		 277 aa  150  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.631181  normal  0.549818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2954  hypothetical protein  47.42 
 
 		 277 aa  150  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553875  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2830  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  47.89 
 
 		 675 aa  150  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0677  hypothetical protein  38.12 
 
 		 543 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4444  Tetratricopeptide TPR_4  44.39 
 
 		 365 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457658  normal  0.0435915 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1746  hypothetical protein  43.73 
 
 		 1079 aa  143  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000886792 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07420  hypothetical protein  42.71 
 
 		 274 aa  143  8e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.704818  normal  0.126809 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11707  hypothetical protein  46.95 
 
 		 250 aa  140  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.104662 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3166  tetratricopeptide TPR_2  42.86 
 
 		 654 aa  138  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.307175  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4077  hypothetical protein  46.76 
 
 		 374 aa  131  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313284  hitchhiker  0.00876664 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1897  tetratricopeptide TPR_4  49.32 
 
 		 286 aa  124  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3039  hypothetical protein  47.46 
 
 		 227 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.635634  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5461  hypothetical protein  44.05 
 
 		 341 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0553967  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3019  hypothetical protein  42.05 
 
 		 658 aa  110  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.882061  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2386  hypothetical protein  44.33 
 
 		 200 aa  91.3  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16331  hypothetical protein  35.24 
 
 		 190 aa  79  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.377957 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  23.23 
 
 		 2449 aa  70.5  0.00000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0783  hypothetical protein  35.37 
 
 		 166 aa  67.8  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.024345  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  32.91 
 
 		 1161 aa  58.2  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2360  hypothetical protein  40.91 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0182213  hitchhiker  0.00536835 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0655  Pericardin like protein  44.04 
 
 		 684 aa  55.5  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.541208  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2996  pseudouridine synthase, Rsu  41.78 
 
 		 621 aa  54.3  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.772965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4028  transcription termination factor Rho  46.23 
 
 		 688 aa  52.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016816 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3171  pseudouridine synthase, Rsu  38.52 
 
 		 687 aa  48.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.601748  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  33.02 
 
 		 2313 aa  47.8  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9251  hypothetical protein  40.48 
 
 		 651 aa  47.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0896  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.62 
 
 		 234 aa  47.4  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.323909  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4750  hypothetical protein  44.44 
 
 		 347 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.139905  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3005  hypothetical protein  11.56 
 
 		 570 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0520915  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1733  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.7 
 
 		 712 aa  46.6  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.555065  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3403  pseudouridine synthase RluD  40 
 
 		 501 aa  45.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0666836  normal  0.0916306 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0477  RNA-binding S4 domain protein  39.01 
 
 		 689 aa  44.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.53583  normal  0.544761 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>