36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0677 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0677  hypothetical protein  100 
 
 		 543 aa  1089    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0801  hypothetical protein  65.53 
 
 		 591 aa  422  1e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0753536  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22180  hypothetical protein  31.29 
 
 		 750 aa  159  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.314625  normal  0.946769 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1121  hypothetical protein  36.36 
 
 		 618 aa  149  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.642413 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1337  hypothetical protein  34.44 
 
 		 788 aa  145  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13630  hypothetical protein  39.09 
 
 		 621 aa  133  7.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25500  hypothetical protein  34.08 
 
 		 339 aa  124  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5444  hypothetical protein  32.84 
 
 		 918 aa  120  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1512  hypothetical protein  28.71 
 
 		 640 aa  120  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000167269 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1513  hypothetical protein  31.39 
 
 		 680 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1253  tetratricopeptide TPR_4  40.56 
 
 		 350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.222443 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2830  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  37.56 
 
 		 675 aa  109  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2020  hypothetical protein  38.75 
 
 		 480 aa  108  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3800  hypothetical protein  34.88 
 
 		 633 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6067  hypothetical protein  33.67 
 
 		 936 aa  104  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4077  hypothetical protein  37.95 
 
 		 374 aa  101  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313284  hitchhiker  0.00876664 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2042  hypothetical protein  35.68 
 
 		 349 aa  99  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4444  Tetratricopeptide TPR_4  33.85 
 
 		 365 aa  99  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457658  normal  0.0435915 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07420  hypothetical protein  39.86 
 
 		 274 aa  98.2  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.704818  normal  0.126809 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2161  hypothetical protein  34.33 
 
 		 355 aa  97.8  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3166  tetratricopeptide TPR_2  30.62 
 
 		 654 aa  97.4  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.307175  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11707  hypothetical protein  36.27 
 
 		 250 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.104662 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3512  hypothetical protein  32.8 
 
 		 305 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.804632  normal  0.14913 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3293  hypothetical protein  33.59 
 
 		 285 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1981  tetratricopeptide TPR_2  35.38 
 
 		 321 aa  94.4  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2969  hypothetical protein  32.27 
 
 		 277 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2998  hypothetical protein  32.27 
 
 		 277 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.631181  normal  0.549818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2954  hypothetical protein  32.27 
 
 		 277 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553875  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1906  tetratricopeptide TPR_4  30.53 
 
 		 753 aa  91.3  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.346521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1746  hypothetical protein  28.68 
 
 		 1079 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000886792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5461  hypothetical protein  34.15 
 
 		 341 aa  77.8  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0553967  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3019  hypothetical protein  37.66 
 
 		 658 aa  78.2  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.882061  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2386  hypothetical protein  40.88 
 
 		 200 aa  76.6  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1897  tetratricopeptide TPR_4  30.4 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3039  hypothetical protein  35.95 
 
 		 227 aa  62.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.635634  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2360  hypothetical protein  31.37 
 
 		 245 aa  53.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0182213  hitchhiker  0.00536835 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>