36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1981 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1981  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 321 aa  627  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5444  hypothetical protein  51.83 
 
 		 918 aa  203  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2161  hypothetical protein  46.97 
 
 		 355 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25500  hypothetical protein  42.43 
 
 		 339 aa  194  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2042  hypothetical protein  47 
 
 		 349 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6067  hypothetical protein  51.18 
 
 		 936 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229661  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2020  hypothetical protein  51.17 
 
 		 480 aa  192  7e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1513  hypothetical protein  50.52 
 
 		 680 aa  189  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1512  hypothetical protein  50.52 
 
 		 640 aa  188  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000167269 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3800  hypothetical protein  47.81 
 
 		 633 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2998  hypothetical protein  43.66 
 
 		 277 aa  175  8e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.631181  normal  0.549818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2954  hypothetical protein  43.66 
 
 		 277 aa  175  8e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553875  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1906  tetratricopeptide TPR_4  49.52 
 
 		 753 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.346521 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2969  hypothetical protein  43.61 
 
 		 277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1253  tetratricopeptide TPR_4  52.5 
 
 		 350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.222443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4444  Tetratricopeptide TPR_4  45.45 
 
 		 365 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457658  normal  0.0435915 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3166  tetratricopeptide TPR_2  52.11 
 
 		 654 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.307175  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4077  hypothetical protein  51.4 
 
 		 374 aa  162  8.000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313284  hitchhiker  0.00876664 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3293  hypothetical protein  44.4 
 
 		 285 aa  159  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13630  hypothetical protein  46.41 
 
 		 621 aa  159  6e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11707  hypothetical protein  47.51 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.104662 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3039  hypothetical protein  49.72 
 
 		 227 aa  153  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.635634  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22180  hypothetical protein  39.01 
 
 		 750 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.314625  normal  0.946769 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2830  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  43.66 
 
 		 675 aa  149  9e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1337  hypothetical protein  49.07 
 
 		 788 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3512  hypothetical protein  40.94 
 
 		 305 aa  146  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.804632  normal  0.14913 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3019  hypothetical protein  50.26 
 
 		 658 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.882061  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1121  hypothetical protein  43.39 
 
 		 618 aa  143  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.642413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1746  hypothetical protein  49.07 
 
 		 1079 aa  142  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000886792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5461  hypothetical protein  45.71 
 
 		 341 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0553967  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1897  tetratricopeptide TPR_4  48.57 
 
 		 286 aa  135  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07420  hypothetical protein  40.51 
 
 		 274 aa  125  9e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.704818  normal  0.126809 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2386  hypothetical protein  49.48 
 
 		 200 aa  122  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0801  hypothetical protein  33.33 
 
 		 591 aa  109  5e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0753536  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0677  hypothetical protein  35.38 
 
 		 543 aa  108  1e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2360  hypothetical protein  47.1 
 
 		 245 aa  86.3  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0182213  hitchhiker  0.00536835 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>