36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2161 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2161  hypothetical protein  100 
 
 
355 aa  685    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2020  hypothetical protein  60.91 
 
 
480 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2042  hypothetical protein  60.87 
 
 
349 aa  260  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6067  hypothetical protein  62.05 
 
 
936 aa  259  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229661  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25500  hypothetical protein  55.29 
 
 
339 aa  238  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5444  hypothetical protein  55.9 
 
 
918 aa  225  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1906  tetratricopeptide TPR_4  54.71 
 
 
753 aa  202  9e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.346521 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1253  tetratricopeptide TPR_4  56.76 
 
 
350 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.222443 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3800  hypothetical protein  50.2 
 
 
633 aa  200  3.9999999999999996e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3039  hypothetical protein  59.26 
 
 
227 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.635634  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2969  hypothetical protein  53.46 
 
 
277 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2954  hypothetical protein  53.92 
 
 
277 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2998  hypothetical protein  53.92 
 
 
277 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.631181  normal  0.549818 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2830  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  52.07 
 
 
675 aa  192  6e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3293  hypothetical protein  50.84 
 
 
285 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4444  Tetratricopeptide TPR_4  49.56 
 
 
365 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457658  normal  0.0435915 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1512  hypothetical protein  49.26 
 
 
640 aa  188  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000167269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5461  hypothetical protein  52.1 
 
 
341 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0553967  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1513  hypothetical protein  50.25 
 
 
680 aa  188  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3512  hypothetical protein  47.69 
 
 
305 aa  185  9e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.804632  normal  0.14913 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1897  tetratricopeptide TPR_4  57.45 
 
 
286 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1981  tetratricopeptide TPR_2  51.35 
 
 
321 aa  178  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11707  hypothetical protein  52.07 
 
 
250 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.104662 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13630  hypothetical protein  42.57 
 
 
621 aa  169  9e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3166  tetratricopeptide TPR_2  50.43 
 
 
654 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.307175  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1746  hypothetical protein  50.22 
 
 
1079 aa  162  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000886792 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22180  hypothetical protein  49.49 
 
 
750 aa  155  9e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.314625  normal  0.946769 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4077  hypothetical protein  46.35 
 
 
374 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313284  hitchhiker  0.00876664 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1337  hypothetical protein  49.71 
 
 
788 aa  149  5e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07420  hypothetical protein  42.55 
 
 
274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.704818  normal  0.126809 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2386  hypothetical protein  53.5 
 
 
200 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1121  hypothetical protein  42.61 
 
 
618 aa  142  9e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.642413 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3019  hypothetical protein  45.41 
 
 
658 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.882061  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0801  hypothetical protein  36.46 
 
 
591 aa  106  6e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0753536  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0677  hypothetical protein  34.17 
 
 
543 aa  100  4e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2360  hypothetical protein  50.31 
 
 
245 aa  96.7  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0182213  hitchhiker  0.00536835 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>