48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1337 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1337  hypothetical protein  100 
 
 
788 aa  1388    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22180  hypothetical protein  50.66 
 
 
750 aa  333  7.000000000000001e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.314625  normal  0.946769 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1121  hypothetical protein  49.83 
 
 
618 aa  246  9.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.642413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6067  hypothetical protein  41.78 
 
 
936 aa  233  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229661  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1513  hypothetical protein  41.59 
 
 
680 aa  182  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1512  hypothetical protein  37.67 
 
 
640 aa  182  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000167269 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3800  hypothetical protein  40.22 
 
 
633 aa  179  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25500  hypothetical protein  44.83 
 
 
339 aa  170  8e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1253  tetratricopeptide TPR_4  58 
 
 
350 aa  161  4e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.222443 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2161  hypothetical protein  47.74 
 
 
355 aa  154  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0677  hypothetical protein  30.71 
 
 
543 aa  153  1e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0801  hypothetical protein  34.91 
 
 
591 aa  149  3e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0753536  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2042  hypothetical protein  40.34 
 
 
349 aa  147  8.000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3166  tetratricopeptide TPR_2  40.15 
 
 
654 aa  144  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.307175  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13630  hypothetical protein  42.37 
 
 
621 aa  141  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5461  hypothetical protein  52.87 
 
 
341 aa  140  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0553967  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1906  tetratricopeptide TPR_4  43.1 
 
 
753 aa  140  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.346521 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2360  hypothetical protein  60.75 
 
 
245 aa  138  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0182213  hitchhiker  0.00536835 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3293  hypothetical protein  48.68 
 
 
285 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1746  hypothetical protein  38.14 
 
 
1079 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000886792 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3019  hypothetical protein  47.18 
 
 
658 aa  134  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.882061  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4444  Tetratricopeptide TPR_4  47.9 
 
 
365 aa  134  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457658  normal  0.0435915 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2969  hypothetical protein  46.4 
 
 
277 aa  131  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4077  hypothetical protein  53.75 
 
 
374 aa  130  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313284  hitchhiker  0.00876664 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2998  hypothetical protein  45.95 
 
 
277 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.631181  normal  0.549818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2954  hypothetical protein  45.95 
 
 
277 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553875  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1981  tetratricopeptide TPR_2  46.12 
 
 
321 aa  129  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3512  hypothetical protein  48.94 
 
 
305 aa  125  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.804632  normal  0.14913 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2830  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  47.34 
 
 
675 aa  121  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11707  hypothetical protein  48.4 
 
 
250 aa  114  9e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.104662 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07420  hypothetical protein  43.82 
 
 
274 aa  109  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.704818  normal  0.126809 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1897  tetratricopeptide TPR_4  48.73 
 
 
286 aa  103  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2386  hypothetical protein  55.07 
 
 
200 aa  103  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3039  hypothetical protein  49.32 
 
 
227 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.635634  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  44.53 
 
 
1079 aa  68.6  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4592  pseudouridine synthase  42.5 
 
 
624 aa  67  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.667434  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0493  hypothetical protein  20.83 
 
 
1048 aa  62.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0517  hypothetical protein  20.83 
 
 
1048 aa  62.4  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0371  IcmE  20.06 
 
 
1039 aa  61.2  0.00000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1811  IcmE protein  20.06 
 
 
1034 aa  60.8  0.00000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0557  hypothetical protein  38.56 
 
 
272 aa  60.5  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  38.84 
 
 
971 aa  60.1  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0831  translation initiation factor IF-2  29.73 
 
 
882 aa  58.5  0.0000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.857351  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5444  hypothetical protein  44.16 
 
 
918 aa  50.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  31.96 
 
 
1029 aa  50.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0242  pseudouridine synthase  49 
 
 
467 aa  45.4  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2996  pseudouridine synthase, Rsu  44.44 
 
 
621 aa  45.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.772965  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0166  pseudouridine synthase  57.83 
 
 
556 aa  44.7  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252408  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>