52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6067 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6067  hypothetical protein  100 
 
 		 936 aa  1724    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229661  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2020  hypothetical protein  74.35 
 
 		 480 aa  341  4e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2161  hypothetical protein  61.54 
 
 		 355 aa  267  7e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22180  hypothetical protein  44.33 
 
 		 750 aa  235  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.314625  normal  0.946769 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5444  hypothetical protein  55.61 
 
 		 918 aa  228  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1513  hypothetical protein  40.39 
 
 		 680 aa  226  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3800  hypothetical protein  42.23 
 
 		 633 aa  226  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1512  hypothetical protein  40.85 
 
 		 640 aa  223  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000167269 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2042  hypothetical protein  49.81 
 
 		 349 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1337  hypothetical protein  43.22 
 
 		 788 aa  209  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25500  hypothetical protein  45.69 
 
 		 339 aa  208  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1906  tetratricopeptide TPR_4  52.47 
 
 		 753 aa  197  8.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.346521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1746  hypothetical protein  45.55 
 
 		 1079 aa  184  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000886792 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3166  tetratricopeptide TPR_2  46.57 
 
 		 654 aa  184  7e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.307175  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1897  tetratricopeptide TPR_4  54.97 
 
 		 286 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5461  hypothetical protein  47.72 
 
 		 341 aa  171  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0553967  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1981  tetratricopeptide TPR_2  51.18 
 
 		 321 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1253  tetratricopeptide TPR_4  47.74 
 
 		 350 aa  163  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.222443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4444  Tetratricopeptide TPR_4  44.96 
 
 		 365 aa  163  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457658  normal  0.0435915 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3039  hypothetical protein  56.36 
 
 		 227 aa  158  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.635634  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2969  hypothetical protein  47.95 
 
 		 277 aa  158  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2954  hypothetical protein  47.95 
 
 		 277 aa  157  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2998  hypothetical protein  47.95 
 
 		 277 aa  157  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.631181  normal  0.549818 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3293  hypothetical protein  47.95 
 
 		 285 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13630  hypothetical protein  41.95 
 
 		 621 aa  154  5e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3512  hypothetical protein  46.12 
 
 		 305 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.804632  normal  0.14913 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2830  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  45.74 
 
 		 675 aa  146  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1121  hypothetical protein  34.42 
 
 		 618 aa  145  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.642413 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4077  hypothetical protein  46.12 
 
 		 374 aa  138  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313284  hitchhiker  0.00876664 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3019  hypothetical protein  38.07 
 
 		 658 aa  137  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.882061  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11707  hypothetical protein  46.79 
 
 		 250 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.104662 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07420  hypothetical protein  42.79 
 
 		 274 aa  134  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.704818  normal  0.126809 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0801  hypothetical protein  31.09 
 
 		 591 aa  120  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0753536  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2386  hypothetical protein  50.96 
 
 		 200 aa  105  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0677  hypothetical protein  31.15 
 
 		 543 aa  102  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1681  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.98 
 
 		 854 aa  76.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2360  hypothetical protein  49.61 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0182213  hitchhiker  0.00536835 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  41.32 
 
 		 971 aa  69.3  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  40.3 
 
 		 985 aa  60.1  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0831  translation initiation factor IF-2  29.96 
 
 		 882 aa  60.1  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.857351  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1273  pseudouridine synthase Rsu  38.21 
 
 		 795 aa  57.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.897048 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1171  pseudouridine synthase Rsu  32.64 
 
 		 784 aa  54.7  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1924  RNA-binding S4 domain-containing protein  30.89 
 
 		 646 aa  54.3  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257028 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2022  pseudouridine synthase, Rsu  31.54 
 
 		 669 aa  50.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6055  pseudouridine synthase, Rsu  31.54 
 
 		 669 aa  50.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0597355  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2042  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.43 
 
 		 650 aa  49.3  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.483684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  35.07 
 
 		 1131 aa  48.9  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2316  translation initiation factor IF-2  30.89 
 
 		 1116 aa  48.1  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.100815  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1356  RNA-binding S4 domain protein  37 
 
 		 736 aa  47.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.284872  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4420  RNA-binding S4 domain protein  42.16 
 
 		 638 aa  47.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3863  pseudouridine synthase, Rsu  38.69 
 
 		 680 aa  47  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.695211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4592  pseudouridine synthase  37.06 
 
 		 624 aa  46.2  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.667434  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>