48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1906 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1906  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 753 aa  1313    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.346521 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1897  tetratricopeptide TPR_4  76.45 
 
 		 286 aa  361  2e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1337  hypothetical protein  51.89 
 
 		 788 aa  317  6e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4444  Tetratricopeptide TPR_4  58.7 
 
 		 365 aa  238  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457658  normal  0.0435915 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25500  hypothetical protein  56.33 
 
 		 339 aa  235  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2161  hypothetical protein  51.46 
 
 		 355 aa  230  7e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5444  hypothetical protein  51.97 
 
 		 918 aa  230  7e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3800  hypothetical protein  50.33 
 
 		 633 aa  222  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1513  hypothetical protein  40.87 
 
 		 680 aa  216  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2020  hypothetical protein  53.36 
 
 		 480 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2042  hypothetical protein  52.7 
 
 		 349 aa  208  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1512  hypothetical protein  38.71 
 
 		 640 aa  192  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000167269 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3512  hypothetical protein  50 
 
 		 305 aa  183  9.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.804632  normal  0.14913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5461  hypothetical protein  53.19 
 
 		 341 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0553967  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1746  hypothetical protein  50.43 
 
 		 1079 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000886792 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2969  hypothetical protein  53.92 
 
 		 277 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3293  hypothetical protein  48.86 
 
 		 285 aa  179  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2998  hypothetical protein  53.92 
 
 		 277 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.631181  normal  0.549818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2954  hypothetical protein  53.92 
 
 		 277 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553875  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13630  hypothetical protein  46.3 
 
 		 621 aa  176  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1253  tetratricopeptide TPR_4  55.45 
 
 		 350 aa  173  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.222443 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1981  tetratricopeptide TPR_2  47.64 
 
 		 321 aa  169  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11707  hypothetical protein  54.3 
 
 		 250 aa  164  6e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.104662 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2830  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  49.78 
 
 		 675 aa  160  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1121  hypothetical protein  36.66 
 
 		 618 aa  160  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.642413 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3039  hypothetical protein  53.97 
 
 		 227 aa  157  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.635634  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22180  hypothetical protein  38.88 
 
 		 750 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.314625  normal  0.946769 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4077  hypothetical protein  53.49 
 
 		 374 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313284  hitchhiker  0.00876664 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3019  hypothetical protein  48.24 
 
 		 658 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.882061  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0801  hypothetical protein  31.62 
 
 		 591 aa  118  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0753536  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07420  hypothetical protein  43.59 
 
 		 274 aa  117  6e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.704818  normal  0.126809 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0677  hypothetical protein  29.17 
 
 		 543 aa  111  4.0000000000000004e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0371  IcmE  15.92 
 
 		 1039 aa  100  9e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1811  IcmE protein  15.91 
 
 		 1034 aa  100  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2386  hypothetical protein  50 
 
 		 200 aa  99.4  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0493  hypothetical protein  20.85 
 
 		 1048 aa  91.7  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0517  hypothetical protein  20.85 
 
 		 1048 aa  91.3  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2360  hypothetical protein  46.88 
 
 		 245 aa  82.4  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0182213  hitchhiker  0.00536835 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0557  hypothetical protein  36.31 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  45.75 
 
 		 1079 aa  65.9  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10310  PPE family protein  23.81 
 
 		 3166 aa  54.3  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.395007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1681  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.3 
 
 		 854 aa  50.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10360  PPE family protein  26.67 
 
 		 3295 aa  48.9  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.683224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13380  PPE family protein  26.61 
 
 		 2472 aa  48.1  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.21147  normal  0.142656 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  37.5 
 
 		 971 aa  46.6  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13376  PPE family protein  26.57 
 
 		 2532 aa  45.8  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0812485  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0242  pseudouridine synthase  44.44 
 
 		 467 aa  45.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  28.35 
 
 		 286 aa  45.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>