More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0242 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0242  pseudouridine synthase  100 
 
 		 467 aa  920    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4592  pseudouridine synthase  36.93 
 
 		 624 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.667434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0689  pseudouridine synthase  40.43 
 
 		 253 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0328  pseudouridine synthase  42.86 
 
 		 567 aa  157  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.106742 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0494  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  39.83 
 
 		 243 aa  156  9e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0166  pseudouridine synthase  42.06 
 
 		 556 aa  154  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3919  pseudouridine synthase  35.8 
 
 		 555 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0542  pseudouridine synthase, Rsu  38.3 
 
 		 251 aa  152  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4420  RNA-binding S4 domain protein  35.51 
 
 		 638 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2996  pseudouridine synthase, Rsu  34.47 
 
 		 621 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.772965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0497  pseudouridine synthase  36.86 
 
 		 247 aa  144  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.196452  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1466  pseudouridine synthase  41.74 
 
 		 241 aa  144  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1709  RNA-binding S4 domain protein  38.03 
 
 		 387 aa  142  9e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.397798  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2751  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.48 
 
 		 295 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1196  pseudouridine synthase  41.92 
 
 		 238 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.939109  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0875  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  37.28 
 
 		 234 aa  142  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000212834  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1203  pseudouridine synthase  34.19 
 
 		 516 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0112543 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0778  pseudouridine synthase  40 
 
 		 234 aa  140  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.132612  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0763  pseudouridine synthase, Rsu  41.85 
 
 		 253 aa  140  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0143  pseudouridylate synthase (ribosomal large subunit pseudouridine synthase B)  36.12 
 
 		 562 aa  140  6e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.303983 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0498  RNA-binding S4 domain protein  36.91 
 
 		 472 aa  139  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1220  pseudouridine synthase  38.22 
 
 		 233 aa  139  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1997  pseudouridine synthase  35.65 
 
 		 252 aa  138  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3005  RNA-binding S4 domain protein  38.77 
 
 		 369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1142  pseudouridine synthase  39.04 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1643  pseudouridine synthase  39.64 
 
 		 238 aa  137  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.734555 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0441  pseudouridine synthase  39.48 
 
 		 248 aa  136  7.000000000000001e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00343055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1401  pseudouridine synthase  39.5 
 
 		 250 aa  136  8e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.288863  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3411  pseudouridine synthase  38.1 
 
 		 255 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07230  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  37.77 
 
 		 237 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000010493  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0660  pseudouridine synthase  36.89 
 
 		 239 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.665428  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0058  pseudouridine synthase  43.3 
 
 		 241 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2266  pseudouridine synthase  37.33 
 
 		 508 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0326251  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0099  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.05 
 
 		 245 aa  134  3.9999999999999996e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0684  pseudouridine synthase  36.89 
 
 		 239 aa  134  5e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0940  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.33 
 
 		 489 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.811015  normal  0.643203 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2613  RNA pseudouridine synthase family protein  36 
 
 		 298 aa  133  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2299  ribosomal large subunit pseudouridine synthase f  36.44 
 
 		 298 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0369  pseudouridine synthase  41.49 
 
 		 251 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126334 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0477  pseudouridine synthase  35.95 
 
 		 254 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1270  pseudouridine synthase  38.24 
 
 		 265 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0944  pseudouridine synthase, Rsu  37.28 
 
 		 261 aa  131  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000200951  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004196  ribosomal large subunit pseudouridine synthase F  36.64 
 
 		 385 aa  131  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00815873  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1534  pseudouridine synthase, Rsu  37.04 
 
 		 406 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171678  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4142  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.44 
 
 		 457 aa  130  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.101102 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1688  pseudouridine synthase, Rsu  35.32 
 
 		 250 aa  130  6e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0787  pseudouridine synthase  37.72 
 
 		 728 aa  129  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000926536  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1928  pseudouridine synthase  39.13 
 
 		 306 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.262991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14070  pseudouridine synthase family protein  37.12 
 
 		 318 aa  129  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0693  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  36.17 
 
 		 239 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1701  putative pseudouridine synthase, Rsu  37.09 
 
 		 690 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3863  pseudouridine synthase, Rsu  33.86 
 
 		 680 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.695211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1396  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  36.36 
 
 		 239 aa  129  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.131517  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1743  pseudouridine synthase  36.16 
 
 		 235 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0601  ribosomal large subunit pseudouridine synthase F  39.71 
 
 		 240 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.624758  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1722  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  37.87 
 
 		 398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.950771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14081  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal small subunit  39.71 
 
 		 240 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.484902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2231  RNA-binding S4 domain-containing protein  36 
 
 		 466 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00234161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0462  16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase  34.71 
 
 		 256 aa  128  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0481234  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01258  pseudouridylate synthase  36.21 
 
 		 384 aa  127  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1151  RNA pseudouridine synthase family protein  36.44 
 
 		 228 aa  128  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000576228  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0069  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.2 
 
 		 601 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2192  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.9 
 
 		 235 aa  127  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.731966  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1534  pseudouridine synthase  35.62 
 
 		 403 aa  127  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000449556 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0206  RNA pseudouridylate synthase family protein  35.27 
 
 		 598 aa  127  6e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1730  pseudouridine synthase  37.2 
 
 		 273 aa  127  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0910  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  36.74 
 
 		 704 aa  126  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.237604  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4170  RNA-binding S4 domain protein  34.93 
 
 		 674 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0806  pseudouridine synthase  36.33 
 
 		 274 aa  125  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.316767  normal  0.474505 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3094  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.24 
 
 		 620 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.703122 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3861  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.93 
 
 		 669 aa  125  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227341 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1217  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  36.68 
 
 		 258 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000897909  hitchhiker  0.000000206079 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3036  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.27 
 
 		 576 aa  125  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.246075  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1816  pseudouridine synthase family 1 protein  36.61 
 
 		 340 aa  125  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1273  pseudouridine synthase Rsu  36.53 
 
 		 795 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.897048 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1005  RNA-binding S4 domain protein  34.5 
 
 		 227 aa  125  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.0262199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4321  RNA-binding S4 domain protein  35.62 
 
 		 577 aa  125  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0568238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0185  RNA pseudouridylate synthase family protein  35.27 
 
 		 598 aa  125  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1841  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  35.08 
 
 		 385 aa  125  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4141  pseudouridine synthase  35.04 
 
 		 554 aa  125  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.244372  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1319  RNA-binding S4 domain protein  36.44 
 
 		 268 aa  124  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.834019  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1395  pseudouridine synthase  36.4 
 
 		 242 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2242  pseudouridine synthase  35.54 
 
 		 318 aa  124  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3238  pseudouridine synthase  38.77 
 
 		 229 aa  124  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.643571  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0987  ribosomal large subunit pseudouridine synthase f  35.56 
 
 		 228 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2221  RNA pseudouridylate synthase  37.27 
 
 		 238 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2160  pseudouridylate synthase (pseudouridine synthase)  37.27 
 
 		 238 aa  124  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.28876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2144  tRNA pseudouridine synthase A  37.27 
 
 		 238 aa  124  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2790  RNA pseudouridine synthase  38.18 
 
 		 322 aa  124  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.525633  normal  0.683012 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2386  RNA pseudouridine synthase family protein  37.27 
 
 		 238 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04827  ribosomal large subunit pseudouridine synthase F  38.7 
 
 		 240 aa  124  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1454  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  39.04 
 
 		 252 aa  124  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00702616 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1493  pseudouridine synthase  35.56 
 
 		 426 aa  124  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.797477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0309  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  37.39 
 
 		 255 aa  124  4e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1236  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  36.36 
 
 		 269 aa  124  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.862824 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2974  RNA pseudouridine synthase family protein  37.44 
 
 		 235 aa  124  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.462691 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2353  RNA pseudouridine synthase family protein  37.44 
 
 		 235 aa  124  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0916  RNA pseudouridine synthase family protein  31.56 
 
 		 314 aa  123  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2403  RNA pseudouridine synthase family protein  37.44 
 
 		 235 aa  123  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0710  pseudouridine synthase  36.36 
 
 		 244 aa  123  6e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>