More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0689 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0689  pseudouridine synthase  100 
 
 		 253 aa  509  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1292  pseudouridine synthase  50.84 
 
 		 251 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1403  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  51.95 
 
 		 247 aa  217  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1466  pseudouridine synthase  48.31 
 
 		 241 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07230  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  47.21 
 
 		 237 aa  211  5.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000010493  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1142  pseudouridine synthase  47.76 
 
 		 309 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1196  pseudouridine synthase  48.93 
 
 		 238 aa  209  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.939109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2095  pseudouridine synthase  46.84 
 
 		 264 aa  208  8e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.965704 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0328  pseudouridine synthase  46.12 
 
 		 567 aa  206  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.106742 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1217  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  51.08 
 
 		 258 aa  206  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000897909  hitchhiker  0.000000206079 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0166  pseudouridine synthase  45.71 
 
 		 556 aa  206  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1643  pseudouridine synthase  44.54 
 
 		 238 aa  205  5e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.734555 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1352  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  48.74 
 
 		 240 aa  205  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.92415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1010  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  47.44 
 
 		 243 aa  204  8e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1056  pseudouridine synthase RluB  44.64 
 
 		 245 aa  204  9e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0462  16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase  46.03 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0481234  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1206  pseudouridine synthase, Rsu  48.96 
 
 		 375 aa  204  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2830  pseudouridine synthase  46.25 
 
 		 250 aa  204  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00016926  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2505  pseudouridine synthase  49.14 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000824724  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0398  pseudouridine synthase  47.44 
 
 		 243 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3744  pseudouridine synthase  50 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212732  normal  0.0135633 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0693  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  44.93 
 
 		 239 aa  203  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3089  pseudouridine synthase  48.09 
 
 		 266 aa  202  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000212991  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4592  pseudouridine synthase  46.53 
 
 		 624 aa  202  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.667434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1172  pseudouridine synthase  48.09 
 
 		 266 aa  201  7e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.8005300000000004e-32 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09640  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  44.49 
 
 		 249 aa  201  9.999999999999999e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.444703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2728  pseudouridine synthase  46.75 
 
 		 274 aa  199  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0710  pseudouridine synthase  43.35 
 
 		 244 aa  198  7e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0542  pseudouridine synthase, Rsu  44.96 
 
 		 251 aa  198  9e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2223  pseudouridine synthase  44.26 
 
 		 243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000780288  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2070  pseudouridine synthase  46.86 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0652133  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2497  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  47.81 
 
 		 251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0757  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  42.62 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000912353  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0829  pseudouridylate synthase  44.21 
 
 		 284 aa  195  5.000000000000001e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1578  pseudouridine synthase  43.1 
 
 		 236 aa  195  6e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1395  pseudouridine synthase  43.15 
 
 		 242 aa  194  9e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1545  pseudouridine synthase  45.09 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1743  pseudouridine synthase  41.99 
 
 		 235 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1196  pseudouridine synthase  42.74 
 
 		 242 aa  192  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3411  pseudouridine synthase  46.89 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0494  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  44.87 
 
 		 243 aa  192  5e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1382  RNA pseudouridine  42.32 
 
 		 242 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.947274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1355  pseudouridylate synthase  42.32 
 
 		 242 aa  192  6e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1493  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  42.32 
 
 		 242 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1565  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  42.32 
 
 		 242 aa  192  6e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.37262e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1527  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  42.32 
 
 		 242 aa  192  6e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1336  ribosomal small subunit pseudouridine synthase B  40.09 
 
 		 236 aa  191  7e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.014485  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0976  pseudouridine synthase  48.32 
 
 		 694 aa  191  8e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0989035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3818  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  41.91 
 
 		 242 aa  191  9e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000641699 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0806  pseudouridine synthase  44.53 
 
 		 274 aa  191  9e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.316767  normal  0.474505 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1597  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  42.32 
 
 		 242 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1354  pseudouridylate synthase  42.32 
 
 		 242 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1633  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  42.32 
 
 		 242 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1236  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  45.38 
 
 		 269 aa  191  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.862824 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1919  pseudouridine synthase  45.19 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118075 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1730  pseudouridine synthase  46.5 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1147  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  39.66 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000045472  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1401  pseudouridine synthase  44.72 
 
 		 250 aa  189  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.288863  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1688  pseudouridine synthase, Rsu  42.15 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0441  pseudouridine synthase  43.15 
 
 		 248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00343055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0763  pseudouridine synthase, Rsu  49.34 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1406  ribosomal large subunit pseudouridine synthaseB (pseudouridylate synthase) (uracil hydrolyase)  42.86 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.541928  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06820  pseudouridine synthase family protein  39.83 
 
 		 296 aa  187  1e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.493821 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0497  pseudouridine synthase  42.62 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.196452  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3005  RNA-binding S4 domain protein  45.19 
 
 		 369 aa  187  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1550  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  43.35 
 
 		 245 aa  186  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1581  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  43.35 
 
 		 245 aa  186  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1682  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  43.46 
 
 		 328 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00200841  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5061  pseudouridine synthase  44.21 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0210858  normal  0.0392738 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2174  pseudouridine synthase  43.46 
 
 		 329 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3276  pseudouridine synthase  43.44 
 
 		 247 aa  186  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0129049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2996  pseudouridine synthase, Rsu  44.54 
 
 		 621 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.772965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1709  RNA-binding S4 domain protein  43.64 
 
 		 387 aa  186  4e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.397798  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1928  pseudouridine synthase  43.33 
 
 		 306 aa  185  5e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.262991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2263  pseudouridine synthase  41.7 
 
 		 324 aa  185  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0689065  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2751  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.89 
 
 		 295 aa  185  6e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2790  RNA pseudouridine synthase  44.58 
 
 		 322 aa  184  8e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.525633  normal  0.683012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2929  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  44.13 
 
 		 247 aa  184  9e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2944  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  44.13 
 
 		 247 aa  184  9e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal  0.0913763 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2973  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  44.13 
 
 		 247 aa  184  9e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1581  pseudouridine synthase  43.09 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1928  pseudouridine synthase  44.35 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0159722  normal  0.219047 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1557  pseudouridine synthase  43.09 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1493  pseudouridine synthase  45.15 
 
 		 426 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.797477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1301  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  43.97 
 
 		 236 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2122  pseudouridine synthase  43.1 
 
 		 354 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.327075  normal  0.0800596 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1454  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  43.98 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00702616 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1296  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  42.86 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.531864  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0017  pseudouridine synthase  42.37 
 
 		 239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355614  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1534  pseudouridine synthase, Rsu  43.1 
 
 		 406 aa  182  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171678  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3120  pseudouridine synthase  43.33 
 
 		 322 aa  181  7e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.246679  hitchhiker  0.00195827 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11726  hypothetical protein  43.57 
 
 		 254 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.473369 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0477  pseudouridine synthase  44.02 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3495  pseudouridine synthase  42.62 
 
 		 247 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0394567  normal  0.217284 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4425  pseudouridine synthase  44.35 
 
 		 244 aa  179  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.223617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5639  pseudouridine synthase  44.26 
 
 		 553 aa  179  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14070  pseudouridine synthase family protein  43.28 
 
 		 318 aa  179  4e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1534  pseudouridine synthase  42.32 
 
 		 403 aa  179  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000449556 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4054  pseudouridine synthase  43.57 
 
 		 249 aa  179  4.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.51659 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0888  16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase related enzyme  41.92 
 
 		 245 aa  179  4.999999999999999e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000206154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>