More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2122 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_2122  pseudouridine synthase  100 
 
 		 354 aa  668    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.327075  normal  0.0800596 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2174  pseudouridine synthase  78.54 
 
 		 329 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1682  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  78.08 
 
 		 328 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00200841  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2263  pseudouridine synthase  78.46 
 
 		 324 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0689065  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1172  pseudouridine synthase  46.54 
 
 		 266 aa  232  6e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.8005300000000004e-32 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2095  pseudouridine synthase  47.43 
 
 		 264 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.965704 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3089  pseudouridine synthase  48.71 
 
 		 266 aa  229  6e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000212991  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1403  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  50.22 
 
 		 247 aa  227  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2505  pseudouridine synthase  51.07 
 
 		 239 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000824724  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1217  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  47.17 
 
 		 258 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000897909  hitchhiker  0.000000206079 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2728  pseudouridine synthase  49.35 
 
 		 274 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1292  pseudouridine synthase  50.42 
 
 		 251 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07230  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  47.46 
 
 		 237 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000010493  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2070  pseudouridine synthase  46.54 
 
 		 271 aa  210  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0652133  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1643  pseudouridine synthase  41.91 
 
 		 238 aa  204  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.734555 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1352  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  48.32 
 
 		 240 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.92415  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1493  pseudouridine synthase  47.3 
 
 		 426 aa  199  5e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.797477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2223  pseudouridine synthase  44.03 
 
 		 243 aa  199  6e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000780288  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1142  pseudouridine synthase  43.88 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1534  pseudouridine synthase  46.91 
 
 		 403 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000449556 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4054  pseudouridine synthase  47.04 
 
 		 249 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.51659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2996  pseudouridine synthase, Rsu  45.64 
 
 		 621 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.772965  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1928  pseudouridine synthase  48.55 
 
 		 306 aa  195  8.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.262991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1206  pseudouridine synthase, Rsu  45.9 
 
 		 375 aa  195  9e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1196  pseudouridine synthase  49.16 
 
 		 238 aa  195  9e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.939109  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0398  pseudouridine synthase  45.34 
 
 		 243 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3411  pseudouridine synthase  45.67 
 
 		 255 aa  193  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5639  pseudouridine synthase  46.69 
 
 		 553 aa  193  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0976  pseudouridine synthase  47.11 
 
 		 694 aa  193  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0989035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1564  pseudouridine synthase  45.87 
 
 		 243 aa  192  6e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.531508  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1578  pseudouridine synthase  42.49 
 
 		 236 aa  192  8e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1534  pseudouridine synthase, Rsu  46.06 
 
 		 406 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171678  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4425  pseudouridine synthase  45.64 
 
 		 244 aa  189  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.223617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2458  pseudouridine synthase  45 
 
 		 332 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0683  pseudouridine synthase  49.58 
 
 		 250 aa  186  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.316582  normal  0.0629739 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1296  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  47.06 
 
 		 249 aa  186  6e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.531864  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2989  pseudouridine synthase  46.06 
 
 		 280 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.340471  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1492  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  45.67 
 
 		 405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0450106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4592  pseudouridine synthase  43.25 
 
 		 624 aa  182  6e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.667434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0689  pseudouridine synthase  43.1 
 
 		 253 aa  182  6e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2830  pseudouridine synthase  46.06 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00016926  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1396  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  43.28 
 
 		 239 aa  182  1e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.131517  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1056  pseudouridine synthase RluB  42.31 
 
 		 245 aa  181  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1196  pseudouridine synthase  42.45 
 
 		 242 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2817  pseudouridine synthase  44.86 
 
 		 329 aa  181  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0696867  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1454  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  46.61 
 
 		 252 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00702616 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1236  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  46.72 
 
 		 269 aa  180  4e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.862824 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1270  pseudouridine synthase  42.08 
 
 		 265 aa  179  5.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3120  pseudouridine synthase  42.11 
 
 		 322 aa  179  7e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.246679  hitchhiker  0.00195827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3495  pseudouridine synthase  43.85 
 
 		 247 aa  179  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0394567  normal  0.217284 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19880  pseudouridine synthase family protein  43.5 
 
 		 263 aa  178  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1841  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  46.3 
 
 		 385 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3863  pseudouridine synthase, Rsu  39.93 
 
 		 680 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.695211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0757  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  42.62 
 
 		 238 aa  177  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000912353  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0328  pseudouridine synthase  39.55 
 
 		 567 aa  177  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.106742 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3276  pseudouridine synthase  43.44 
 
 		 247 aa  177  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0129049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1395  pseudouridine synthase  41.22 
 
 		 242 aa  176  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2034  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  42.45 
 
 		 631 aa  176  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.209025 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0829  pseudouridylate synthase  40.66 
 
 		 284 aa  176  6e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1466  pseudouridine synthase  41.53 
 
 		 241 aa  175  9e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4002  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.56 
 
 		 355 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000006993 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1416  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.56 
 
 		 355 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.504489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0166  pseudouridine synthase  42.46 
 
 		 556 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0888  16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase related enzyme  40.26 
 
 		 245 aa  175  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000206154 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14070  pseudouridine synthase family protein  43.1 
 
 		 318 aa  175  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1597  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  40.82 
 
 		 242 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1382  RNA pseudouridine  40.82 
 
 		 242 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.947274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1355  pseudouridylate synthase  40.82 
 
 		 242 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2944  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  44.9 
 
 		 247 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal  0.0913763 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1633  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  40.82 
 
 		 242 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1493  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  40.82 
 
 		 242 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3785  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.56 
 
 		 354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000422758 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2929  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  44.9 
 
 		 247 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1527  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  40.82 
 
 		 242 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1565  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  40.82 
 
 		 242 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.37262e-16 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2973  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  44.9 
 
 		 247 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855259  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1815  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  44.98 
 
 		 408 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1354  pseudouridylate synthase  40.82 
 
 		 242 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3581  pseudouridine synthase, Rsu  44.98 
 
 		 409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2031  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  42.04 
 
 		 615 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09640  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  44.07 
 
 		 249 aa  172  7.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.444703  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1593  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  41.42 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1919  pseudouridine synthase  46.22 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118075 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1301  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  43.97 
 
 		 236 aa  172  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1089  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  47.39 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.164298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23110  hypothetical protein  45.56 
 
 		 386 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000760883 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1951  hypothetical protein  45.56 
 
 		 386 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0106658  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3818  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  40 
 
 		 242 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000641699 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0600  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  34.32 
 
 		 252 aa  171  2e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.168278  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0462  16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase  37.35 
 
 		 256 aa  170  3e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0481234  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0710  pseudouridine synthase  36.29 
 
 		 244 aa  170  3e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0693  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  38.36 
 
 		 239 aa  170  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2371  pseudouridine synthase  46.75 
 
 		 319 aa  169  5e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0806  pseudouridine synthase  40.96 
 
 		 274 aa  169  5e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.316767  normal  0.474505 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15190  pseudouridine synthase family protein  42.26 
 
 		 284 aa  169  5e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0192942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11726  hypothetical protein  42.86 
 
 		 254 aa  169  5e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.473369 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2497  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  43.56 
 
 		 251 aa  169  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5061  pseudouridine synthase  42.86 
 
 		 259 aa  169  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0210858  normal  0.0392738 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1286  hypothetical protein  40.82 
 
 		 598 aa  169  7e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0722025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1743  pseudouridine synthase  38.2 
 
 		 235 aa  169  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>