More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1196 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1196  pseudouridine synthase  100 
 
 		 238 aa  464  9.999999999999999e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.939109  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1292  pseudouridine synthase  60.94 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2095  pseudouridine synthase  55.36 
 
 		 264 aa  252  3e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.965704 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07230  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  52.79 
 
 		 237 aa  251  9.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000010493  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1142  pseudouridine synthase  55.7 
 
 		 309 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1352  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  57.56 
 
 		 240 aa  249  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.92415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2728  pseudouridine synthase  55.41 
 
 		 274 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2505  pseudouridine synthase  57.08 
 
 		 239 aa  241  7e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000824724  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1403  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  54.98 
 
 		 247 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0398  pseudouridine synthase  53.16 
 
 		 243 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3089  pseudouridine synthase  52.36 
 
 		 266 aa  231  7.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000212991  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2223  pseudouridine synthase  49.79 
 
 		 243 aa  231  9e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000780288  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3411  pseudouridine synthase  54.77 
 
 		 255 aa  230  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1466  pseudouridine synthase  46.61 
 
 		 241 aa  229  2e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1172  pseudouridine synthase  51.93 
 
 		 266 aa  229  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.8005300000000004e-32 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1406  ribosomal large subunit pseudouridine synthaseB (pseudouridylate synthase) (uracil hydrolyase)  49.58 
 
 		 239 aa  228  5e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.541928  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1643  pseudouridine synthase  48.32 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.734555 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0693  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  48.71 
 
 		 239 aa  227  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1395  pseudouridine synthase  50.64 
 
 		 242 aa  224  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1565  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  50.64 
 
 		 242 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.37262e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1597  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  50.64 
 
 		 242 aa  223  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1633  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  50.64 
 
 		 242 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1382  RNA pseudouridine  50.64 
 
 		 242 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.947274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1355  pseudouridylate synthase  50.64 
 
 		 242 aa  223  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3818  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  50.42 
 
 		 242 aa  223  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000641699 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1493  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  50.64 
 
 		 242 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1527  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  50.64 
 
 		 242 aa  223  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2070  pseudouridine synthase  51.95 
 
 		 271 aa  223  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0652133  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1354  pseudouridylate synthase  50.64 
 
 		 242 aa  223  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1743  pseudouridine synthase  46.81 
 
 		 235 aa  221  6e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1217  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  52.81 
 
 		 258 aa  221  6e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000897909  hitchhiker  0.000000206079 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1301  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  53.85 
 
 		 236 aa  221  7e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1196  pseudouridine synthase  49.16 
 
 		 242 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0166  pseudouridine synthase  56.22 
 
 		 556 aa  219  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0328  pseudouridine synthase  56.6 
 
 		 567 aa  218  6e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.106742 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4592  pseudouridine synthase  57.08 
 
 		 624 aa  215  5e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.667434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0683  pseudouridine synthase  54.62 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.316582  normal  0.0629739 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1730  pseudouridine synthase  52.36 
 
 		 273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1578  pseudouridine synthase  47.86 
 
 		 236 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1056  pseudouridine synthase RluB  48.09 
 
 		 245 aa  211  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1545  pseudouridine synthase  46.12 
 
 		 230 aa  209  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09640  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  49.58 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.444703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0787  pseudouridine synthase  55.17 
 
 		 728 aa  209  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000926536  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0689  pseudouridine synthase  48.93 
 
 		 253 aa  209  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1010  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  48.95 
 
 		 243 aa  207  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15310  pseudouridine synthase family protein  50.21 
 
 		 306 aa  207  1e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.226125  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0806  pseudouridine synthase  47.72 
 
 		 274 aa  206  4e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.316767  normal  0.474505 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2263  pseudouridine synthase  51.48 
 
 		 324 aa  205  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0689065  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2174  pseudouridine synthase  51.05 
 
 		 329 aa  204  7e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3744  pseudouridine synthase  53.65 
 
 		 233 aa  204  7e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212732  normal  0.0135633 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1682  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  50.63 
 
 		 328 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00200841  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1296  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  48.72 
 
 		 249 aa  203  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.531864  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0757  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  47.88 
 
 		 238 aa  201  6e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000912353  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0498  RNA-binding S4 domain protein  45.99 
 
 		 472 aa  199  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1236  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  51.68 
 
 		 269 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.862824 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5639  pseudouridine synthase  47.08 
 
 		 553 aa  197  9e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0888  16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase related enzyme  44.26 
 
 		 245 aa  197  9e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000206154 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0309  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  44.35 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0462  16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase  43.51 
 
 		 256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0481234  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2122  pseudouridine synthase  49.16 
 
 		 354 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.327075  normal  0.0800596 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1593  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  44.92 
 
 		 240 aa  196  3e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1206  pseudouridine synthase, Rsu  48.74 
 
 		 375 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0710  pseudouridine synthase  40.43 
 
 		 244 aa  195  4.0000000000000005e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3863  pseudouridine synthase, Rsu  45.74 
 
 		 680 aa  195  6e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.695211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1396  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  43.78 
 
 		 239 aa  195  7e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.131517  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1336  ribosomal small subunit pseudouridine synthase B  43.59 
 
 		 236 aa  194  8.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.014485  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0017  pseudouridine synthase  39.83 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355614  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4316  pseudouridine synthase  44.94 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1454  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  50 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00702616 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1709  RNA-binding S4 domain protein  46.81 
 
 		 387 aa  193  2e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.397798  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1147  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  43.16 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000045472  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1581  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  46.38 
 
 		 245 aa  192  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1550  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  46.38 
 
 		 245 aa  192  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1270  pseudouridine synthase  46.64 
 
 		 265 aa  192  3e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06820  pseudouridine synthase family protein  46.35 
 
 		 296 aa  192  5e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.493821 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0829  pseudouridylate synthase  43.1 
 
 		 284 aa  192  6e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3919  pseudouridine synthase  45.34 
 
 		 555 aa  192  6e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2830  pseudouridine synthase  49.38 
 
 		 250 aa  191  7e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00016926  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4425  pseudouridine synthase  46.22 
 
 		 244 aa  191  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.223617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1330  pseudouridine synthase  44.78 
 
 		 282 aa  191  9e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.297072 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4141  pseudouridine synthase  44.02 
 
 		 554 aa  191  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.244372  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1534  pseudouridine synthase  47.52 
 
 		 403 aa  191  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000449556 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2497  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  45.38 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0976  pseudouridine synthase  48.51 
 
 		 694 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0989035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1401  pseudouridine synthase  45.61 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.288863  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0497  pseudouridine synthase  45.87 
 
 		 247 aa  189  4e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.196452  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0369  pseudouridine synthase  47.92 
 
 		 251 aa  188  5e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126334 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1928  pseudouridine synthase  48.31 
 
 		 306 aa  187  9e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.262991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1442  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  50.21 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000380815  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1534  pseudouridine synthase, Rsu  47.08 
 
 		 406 aa  187  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171678  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3120  pseudouridine synthase  47.28 
 
 		 322 aa  186  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.246679  hitchhiker  0.00195827 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1581  pseudouridine synthase  44.63 
 
 		 252 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1688  pseudouridine synthase, Rsu  45.45 
 
 		 250 aa  186  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1557  pseudouridine synthase  44.63 
 
 		 252 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0542  pseudouridine synthase, Rsu  45.38 
 
 		 251 aa  185  6e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2817  pseudouridine synthase  48.76 
 
 		 329 aa  184  7e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0696867  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0430  hypothetical protein  42.55 
 
 		 252 aa  184  9e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.877766 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1919  pseudouridine synthase  47.68 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118075 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5061  pseudouridine synthase  48.74 
 
 		 259 aa  182  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0210858  normal  0.0392738 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4420  RNA-binding S4 domain protein  43.83 
 
 		 638 aa  182  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>