More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_07230 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_07230  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  100 
 
 		 237 aa  476  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000010493  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1730  pseudouridine synthase  56.17 
 
 		 273 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1578  pseudouridine synthase  55.7 
 
 		 236 aa  271  7e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2095  pseudouridine synthase  53.65 
 
 		 264 aa  268  7e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.965704 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1142  pseudouridine synthase  56.17 
 
 		 309 aa  265  4e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1217  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  54.66 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000897909  hitchhiker  0.000000206079 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2505  pseudouridine synthase  56.84 
 
 		 239 aa  262  4e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000824724  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0693  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  54.55 
 
 		 239 aa  261  4.999999999999999e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1172  pseudouridine synthase  56.65 
 
 		 266 aa  261  6e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.8005300000000004e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3089  pseudouridine synthase  56.65 
 
 		 266 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000212991  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1403  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  53.45 
 
 		 247 aa  258  4e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0398  pseudouridine synthase  57.45 
 
 		 243 aa  258  4e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2223  pseudouridine synthase  55.7 
 
 		 243 aa  257  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000780288  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3411  pseudouridine synthase  56.54 
 
 		 255 aa  255  4e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2070  pseudouridine synthase  52.16 
 
 		 271 aa  254  9e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0652133  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1196  pseudouridine synthase  52.79 
 
 		 238 aa  251  9.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.939109  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1545  pseudouridine synthase  56.16 
 
 		 230 aa  248  5e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09640  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  52.99 
 
 		 249 aa  246  2e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.444703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1352  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  53.25 
 
 		 240 aa  246  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.92415  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1056  pseudouridine synthase RluB  55.04 
 
 		 245 aa  245  4e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2728  pseudouridine synthase  50.64 
 
 		 274 aa  245  4e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1292  pseudouridine synthase  51.28 
 
 		 251 aa  244  6e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1301  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  52.34 
 
 		 236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1196  pseudouridine synthase  55.46 
 
 		 242 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1466  pseudouridine synthase  48.95 
 
 		 241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1743  pseudouridine synthase  49.78 
 
 		 235 aa  241  7e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1406  ribosomal large subunit pseudouridine synthaseB (pseudouridylate synthase) (uracil hydrolyase)  48.26 
 
 		 239 aa  241  7.999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.541928  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1597  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  54.62 
 
 		 242 aa  237  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1565  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  54.62 
 
 		 242 aa  237  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.37262e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1355  pseudouridylate synthase  54.62 
 
 		 242 aa  237  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1354  pseudouridylate synthase  54.62 
 
 		 242 aa  237  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1633  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  54.62 
 
 		 242 aa  237  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1527  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  54.62 
 
 		 242 aa  237  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1382  RNA pseudouridine  54.2 
 
 		 242 aa  235  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.947274  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1493  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  54.2 
 
 		 242 aa  235  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1395  pseudouridine synthase  54.2 
 
 		 242 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1581  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  51.46 
 
 		 245 aa  235  6e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1550  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  51.46 
 
 		 245 aa  235  6e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3818  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  53.78 
 
 		 242 aa  235  6e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000641699 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06820  pseudouridine synthase family protein  48.72 
 
 		 296 aa  230  1e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.493821 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1643  pseudouridine synthase  51.71 
 
 		 238 aa  230  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.734555 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0757  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  53.59 
 
 		 238 aa  229  3e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000912353  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1396  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  51.48 
 
 		 239 aa  228  4e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.131517  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1593  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  50.43 
 
 		 240 aa  223  3e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3863  pseudouridine synthase, Rsu  46.15 
 
 		 680 aa  222  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.695211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1296  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  51.06 
 
 		 249 aa  219  1.9999999999999999e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.531864  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0309  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  51.91 
 
 		 255 aa  219  1.9999999999999999e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2263  pseudouridine synthase  45.73 
 
 		 324 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0689065  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2174  pseudouridine synthase  45.73 
 
 		 329 aa  218  5e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3744  pseudouridine synthase  50.21 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212732  normal  0.0135633 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0166  pseudouridine synthase  47.48 
 
 		 556 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1682  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  45.3 
 
 		 328 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00200841  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1010  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  45 
 
 		 243 aa  215  5.9999999999999996e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2122  pseudouridine synthase  47.46 
 
 		 354 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.327075  normal  0.0800596 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4592  pseudouridine synthase  47.9 
 
 		 624 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.667434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0689  pseudouridine synthase  47.21 
 
 		 253 aa  211  5.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1442  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  46.12 
 
 		 236 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000380815  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0394  pseudouridine synthase  44.9 
 
 		 261 aa  209  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.734579 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2497  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  45.34 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3919  pseudouridine synthase  48.71 
 
 		 555 aa  209  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1147  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  48.51 
 
 		 236 aa  207  9e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000045472  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1820  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  43.44 
 
 		 288 aa  207  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0806  pseudouridine synthase  44.35 
 
 		 274 aa  206  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.316767  normal  0.474505 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0888  16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase related enzyme  50 
 
 		 245 aa  206  2e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000206154 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0683  pseudouridine synthase  48.92 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.316582  normal  0.0629739 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1330  pseudouridine synthase  43.45 
 
 		 282 aa  205  5e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.297072 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0017  pseudouridine synthase  45.65 
 
 		 239 aa  205  6e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355614  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4316  pseudouridine synthase  44.67 
 
 		 259 aa  205  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1336  ribosomal small subunit pseudouridine synthase B  48.09 
 
 		 236 aa  204  8e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.014485  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1184  pseudouridine synthase  42.98 
 
 		 254 aa  204  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5639  pseudouridine synthase  45.11 
 
 		 553 aa  204  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2817  pseudouridine synthase  47.44 
 
 		 329 aa  204  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0696867  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1006  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  45.53 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0723  pseudouridine synthase  45.82 
 
 		 279 aa  202  5e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0159498  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0710  pseudouridine synthase  43.59 
 
 		 244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1270  pseudouridine synthase  44.44 
 
 		 265 aa  199  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0498  RNA-binding S4 domain protein  44.44 
 
 		 472 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1928  pseudouridine synthase  44.59 
 
 		 306 aa  199  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.262991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2830  pseudouridine synthase  45.45 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00016926  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1534  pseudouridine synthase, Rsu  44.64 
 
 		 406 aa  197  7.999999999999999e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171678  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0462  16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase  44.83 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0481234  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1534  pseudouridine synthase  45.53 
 
 		 403 aa  196  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000449556 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0328  pseudouridine synthase  45.06 
 
 		 567 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.106742 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1236  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  45.15 
 
 		 269 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.862824 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1581  pseudouridine synthase  43.5 
 
 		 252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1557  pseudouridine synthase  43.5 
 
 		 252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15310  pseudouridine synthase family protein  44.44 
 
 		 306 aa  195  4.0000000000000005e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.226125  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1616  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  44.21 
 
 		 250 aa  195  6e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.771877  normal  0.0569453 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5061  pseudouridine synthase  43.97 
 
 		 259 aa  195  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0210858  normal  0.0392738 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1709  RNA-binding S4 domain protein  47.23 
 
 		 387 aa  194  9e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.397798  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1401  pseudouridine synthase  43.7 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.288863  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2996  pseudouridine synthase, Rsu  42.86 
 
 		 621 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.772965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1293  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  44.49 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.159925  normal  0.17953 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1377  pseudouridine synthase, Rsu  43.23 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1454  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  43.72 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00702616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2458  pseudouridine synthase  42.86 
 
 		 332 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0763  pseudouridine synthase, Rsu  48.07 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0430  hypothetical protein  41.53 
 
 		 252 aa  192  3e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.877766 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0369  pseudouridine synthase  42.02 
 
 		 251 aa  191  7e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126334 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09831  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal small subunit  42.8 
 
 		 244 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>