More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0394 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0394  pseudouridine synthase  100 
 
 		 261 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.734579 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1184  pseudouridine synthase  58.7 
 
 		 254 aa  286  2e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1820  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  59.51 
 
 		 288 aa  285  5e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1293  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  57.26 
 
 		 254 aa  276  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.159925  normal  0.17953 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4316  pseudouridine synthase  56.4 
 
 		 259 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1581  pseudouridine synthase  54.37 
 
 		 252 aa  275  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1557  pseudouridine synthase  54.37 
 
 		 252 aa  275  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1010  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  55.47 
 
 		 243 aa  246  3e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09831  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal small subunit  50.98 
 
 		 244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07230  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  44.9 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000010493  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1616  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  51.19 
 
 		 250 aa  205  7e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.771877  normal  0.0569453 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3411  pseudouridine synthase  46.59 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1292  pseudouridine synthase  46.25 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11041  16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase  42.86 
 
 		 237 aa  198  9e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0249401  normal  0.321161 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1377  pseudouridine synthase, Rsu  49.58 
 
 		 247 aa  196  3e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09640  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  44.26 
 
 		 249 aa  188  7e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.444703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2095  pseudouridine synthase  42.86 
 
 		 264 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.965704 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1578  pseudouridine synthase  39.34 
 
 		 236 aa  185  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0166  pseudouridine synthase  46.51 
 
 		 556 aa  185  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4592  pseudouridine synthase  46.9 
 
 		 624 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.667434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1730  pseudouridine synthase  43.37 
 
 		 273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2505  pseudouridine synthase  45.9 
 
 		 239 aa  182  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000824724  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1142  pseudouridine synthase  43.65 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2070  pseudouridine synthase  44.92 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0652133  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2223  pseudouridine synthase  41.39 
 
 		 243 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000780288  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1466  pseudouridine synthase  40.16 
 
 		 241 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1545  pseudouridine synthase  40 
 
 		 230 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0369  pseudouridine synthase  45.14 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126334 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0328  pseudouridine synthase  46.22 
 
 		 567 aa  177  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.106742 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1296  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  42.17 
 
 		 249 aa  175  9e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.531864  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1352  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  45.16 
 
 		 240 aa  173  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.92415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3863  pseudouridine synthase, Rsu  40.51 
 
 		 680 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.695211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06820  pseudouridine synthase family protein  41.53 
 
 		 296 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.493821 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0689  pseudouridine synthase  41.94 
 
 		 253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0398  pseudouridine synthase  40.98 
 
 		 243 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1211  pseudouridine synthase  41.53 
 
 		 243 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1172  pseudouridine synthase  41.37 
 
 		 266 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.8005300000000004e-32 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1743  pseudouridine synthase  38.27 
 
 		 235 aa  171  9e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0757  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  40.65 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000912353  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3089  pseudouridine synthase  41.37 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000212991  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0693  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  37.76 
 
 		 239 aa  169  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1217  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  43.27 
 
 		 258 aa  169  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000897909  hitchhiker  0.000000206079 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0683  pseudouridine synthase  45.12 
 
 		 250 aa  169  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.316582  normal  0.0629739 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2497  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  42.98 
 
 		 251 aa  169  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1056  pseudouridine synthase RluB  39.43 
 
 		 245 aa  168  7e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1919  pseudouridine synthase  42.51 
 
 		 256 aa  168  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118075 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2989  pseudouridine synthase  40.71 
 
 		 280 aa  167  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.340471  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1403  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  43.67 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1236  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  43.53 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.862824 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1643  pseudouridine synthase  37.5 
 
 		 238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.734555 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1330  pseudouridine synthase  38.77 
 
 		 282 aa  165  5.9999999999999996e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.297072 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1928  pseudouridine synthase  42.51 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0159722  normal  0.219047 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1406  ribosomal large subunit pseudouridine synthaseB (pseudouridylate synthase) (uracil hydrolyase)  39.42 
 
 		 239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.541928  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1597  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  39.68 
 
 		 242 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1354  pseudouridylate synthase  39.68 
 
 		 242 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5061  pseudouridine synthase  41.6 
 
 		 259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0210858  normal  0.0392738 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1301  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  42.04 
 
 		 236 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0806  pseudouridine synthase  41.34 
 
 		 274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.316767  normal  0.474505 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1633  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  39.68 
 
 		 242 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2944  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  43.87 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal  0.0913763 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2929  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  43.87 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11726  hypothetical protein  43.03 
 
 		 254 aa  163  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.473369 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2973  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  43.87 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4141  pseudouridine synthase  38.25 
 
 		 554 aa  162  7e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.244372  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14070  pseudouridine synthase family protein  41.27 
 
 		 318 aa  162  7e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3276  pseudouridine synthase  42.69 
 
 		 247 aa  162  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0129049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1534  pseudouridine synthase  41.27 
 
 		 403 aa  161  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000449556 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1355  pseudouridylate synthase  39.27 
 
 		 242 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0763  pseudouridine synthase, Rsu  43.27 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1442  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  42.45 
 
 		 236 aa  161  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000380815  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1565  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  39.27 
 
 		 242 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.37262e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1527  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  39.27 
 
 		 242 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1395  pseudouridine synthase  38.87 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1196  pseudouridine synthase  39.27 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3818  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  39.27 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000641699 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1382  RNA pseudouridine  38.87 
 
 		 242 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.947274  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1206  pseudouridine synthase, Rsu  42.75 
 
 		 375 aa  159  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1493  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  38.87 
 
 		 242 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1454  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  42.06 
 
 		 252 aa  159  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00702616 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1196  pseudouridine synthase  42.51 
 
 		 238 aa  159  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.939109  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1534  pseudouridine synthase, Rsu  39.6 
 
 		 406 aa  159  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171678  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1356  pseudouridine synthase  39.68 
 
 		 254 aa  159  5e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3744  pseudouridine synthase  39.75 
 
 		 233 aa  158  7e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212732  normal  0.0135633 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4054  pseudouridine synthase  41.67 
 
 		 249 aa  158  8e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.51659 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19880  pseudouridine synthase family protein  41.43 
 
 		 263 aa  157  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0976  pseudouridine synthase  41.34 
 
 		 694 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0989035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3495  pseudouridine synthase  41.9 
 
 		 247 aa  156  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0394567  normal  0.217284 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1006  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  34.84 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1418  pseudouridine synthase  42.41 
 
 		 292 aa  155  4e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.126081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2728  pseudouridine synthase  42.45 
 
 		 274 aa  156  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15310  pseudouridine synthase family protein  41.67 
 
 		 306 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.226125  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2817  pseudouridine synthase  42.46 
 
 		 329 aa  155  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0696867  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1928  pseudouridine synthase  39.2 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.262991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1951  hypothetical protein  38.85 
 
 		 386 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0106658  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1550  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  36.99 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4002  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.16 
 
 		 355 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000006993 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1416  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.16 
 
 		 355 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.504489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1581  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  36.99 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3785  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.78 
 
 		 354 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000422758 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25330  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  41.37 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.411992  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>