More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1643 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_1643  pseudouridine synthase  100 
 
 		 238 aa  474  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.734555 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1292  pseudouridine synthase  51.88 
 
 		 251 aa  247  1e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1578  pseudouridine synthase  51.93 
 
 		 236 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07230  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  51.71 
 
 		 237 aa  230  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000010493  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1196  pseudouridine synthase  48.32 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.939109  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1142  pseudouridine synthase  47.5 
 
 		 309 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2095  pseudouridine synthase  47.68 
 
 		 264 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.965704 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1466  pseudouridine synthase  49.79 
 
 		 241 aa  223  3e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2728  pseudouridine synthase  48.05 
 
 		 274 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3089  pseudouridine synthase  50 
 
 		 266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000212991  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1172  pseudouridine synthase  50 
 
 		 266 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.8005300000000004e-32 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1352  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  45.8 
 
 		 240 aa  219  3.9999999999999997e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.92415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2223  pseudouridine synthase  48.1 
 
 		 243 aa  218  6e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000780288  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0693  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  47.84 
 
 		 239 aa  218  7.999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2070  pseudouridine synthase  48.02 
 
 		 271 aa  217  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0652133  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0398  pseudouridine synthase  49.37 
 
 		 243 aa  216  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2505  pseudouridine synthase  46.78 
 
 		 239 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000824724  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1730  pseudouridine synthase  44.81 
 
 		 273 aa  210  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1403  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  44.49 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1147  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  45.92 
 
 		 236 aa  209  4e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000045472  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1336  ribosomal small subunit pseudouridine synthase B  45.92 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.014485  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2263  pseudouridine synthase  41.67 
 
 		 324 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0689065  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2174  pseudouridine synthase  41.67 
 
 		 329 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3411  pseudouridine synthase  48.15 
 
 		 255 aa  206  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09640  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  42.98 
 
 		 249 aa  205  4e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.444703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0689  pseudouridine synthase  44.54 
 
 		 253 aa  205  5e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2122  pseudouridine synthase  41.91 
 
 		 354 aa  205  7e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.327075  normal  0.0800596 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3863  pseudouridine synthase, Rsu  44.19 
 
 		 680 aa  204  9e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.695211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1330  pseudouridine synthase  40.52 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.297072 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1217  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  45.18 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000897909  hitchhiker  0.000000206079 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0328  pseudouridine synthase  47.19 
 
 		 567 aa  204  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.106742 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1296  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  46.15 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.531864  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1196  pseudouridine synthase  46.22 
 
 		 242 aa  203  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1682  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  41.35 
 
 		 328 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00200841  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0166  pseudouridine synthase  44.44 
 
 		 556 aa  201  7e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0462  16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase  40.98 
 
 		 256 aa  200  9.999999999999999e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0481234  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3744  pseudouridine synthase  43.51 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212732  normal  0.0135633 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4592  pseudouridine synthase  45.3 
 
 		 624 aa  199  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.667434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0757  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  44.3 
 
 		 238 aa  198  5e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000912353  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1270  pseudouridine synthase  44.12 
 
 		 265 aa  198  6e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5639  pseudouridine synthase  44.17 
 
 		 553 aa  198  7e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3818  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  44.96 
 
 		 242 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000641699 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1319  RNA-binding S4 domain protein  43.33 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.834019  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1206  pseudouridine synthase, Rsu  40.25 
 
 		 375 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1301  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  43.59 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1406  ribosomal large subunit pseudouridine synthaseB (pseudouridylate synthase) (uracil hydrolyase)  44.07 
 
 		 239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.541928  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15190  pseudouridine synthase family protein  43.28 
 
 		 284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0192942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0888  16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase related enzyme  43.88 
 
 		 245 aa  195  5.000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000206154 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06820  pseudouridine synthase family protein  41.25 
 
 		 296 aa  195  5.000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.493821 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1395  pseudouridine synthase  44.12 
 
 		 242 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0683  pseudouridine synthase  46.22 
 
 		 250 aa  195  6e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.316582  normal  0.0629739 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1545  pseudouridine synthase  43.17 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3276  pseudouridine synthase  41.91 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0129049  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1597  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  44.12 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1382  RNA pseudouridine  44.12 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.947274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1355  pseudouridylate synthase  44.12 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1354  pseudouridylate synthase  44.12 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1527  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  44.12 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1493  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  44.12 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1565  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  44.12 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.37262e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1633  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  44.12 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1396  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  44.44 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.131517  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1534  pseudouridine synthase  41.91 
 
 		 403 aa  193  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000449556 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1236  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  42.02 
 
 		 269 aa  193  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.862824 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1184  pseudouridine synthase  42.8 
 
 		 254 aa  192  3e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0723  pseudouridine synthase  41.02 
 
 		 279 aa  192  4e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0159498  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3919  pseudouridine synthase  44.02 
 
 		 555 aa  192  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0806  pseudouridine synthase  42.45 
 
 		 274 aa  192  4e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.316767  normal  0.474505 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1616  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  44.17 
 
 		 250 aa  192  5e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.771877  normal  0.0569453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0498  RNA-binding S4 domain protein  44.68 
 
 		 472 aa  192  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1593  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  42.02 
 
 		 240 aa  191  6e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2817  pseudouridine synthase  40.66 
 
 		 329 aa  191  6e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0696867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1743  pseudouridine synthase  41.92 
 
 		 235 aa  191  8e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1534  pseudouridine synthase, Rsu  41 
 
 		 406 aa  191  8e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171678  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2497  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  41 
 
 		 251 aa  191  9e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0976  pseudouridine synthase  41.18 
 
 		 694 aa  190  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0989035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0829  pseudouridylate synthase  40.98 
 
 		 284 aa  190  2e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0058  pseudouridine synthase  47.35 
 
 		 241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15310  pseudouridine synthase family protein  40.17 
 
 		 306 aa  189  4e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.226125  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0309  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  41.18 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1928  pseudouridine synthase  41 
 
 		 306 aa  187  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.262991  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1056  pseudouridine synthase RluB  44.3 
 
 		 245 aa  186  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25330  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  41.77 
 
 		 247 aa  186  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.411992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0542  pseudouridine synthase, Rsu  39.75 
 
 		 251 aa  186  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11726  hypothetical protein  41.49 
 
 		 254 aa  187  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.473369 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1454  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  40.76 
 
 		 252 aa  186  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00702616 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3120  pseudouridine synthase  41.6 
 
 		 322 aa  186  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.246679  hitchhiker  0.00195827 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5061  pseudouridine synthase  40.59 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0210858  normal  0.0392738 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2929  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  39.42 
 
 		 247 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0143  pseudouridylate synthase (ribosomal large subunit pseudouridine synthase B)  45.11 
 
 		 562 aa  186  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.303983 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2973  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  39.42 
 
 		 247 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2944  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  39.42 
 
 		 247 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal  0.0913763 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3495  pseudouridine synthase  40.66 
 
 		 247 aa  186  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0394567  normal  0.217284 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1919  pseudouridine synthase  42.86 
 
 		 256 aa  186  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2458  pseudouridine synthase  40.34 
 
 		 332 aa  184  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1688  pseudouridine synthase, Rsu  40.42 
 
 		 250 aa  184  8e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1928  pseudouridine synthase  42.44 
 
 		 262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0159722  normal  0.219047 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1377  pseudouridine synthase, Rsu  43.53 
 
 		 247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14070  pseudouridine synthase family protein  40.34 
 
 		 318 aa  183  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0494  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  42.44 
 
 		 243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>