More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2751 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2751  RNA-binding S4 domain-containing protein  100 
 
 		 295 aa  598  1e-170  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3005  RNA-binding S4 domain protein  69.67 
 
 		 369 aa  340  1e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0763  pseudouridine synthase, Rsu  54.04 
 
 		 253 aa  233  3e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09640  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  47.5 
 
 		 249 aa  198  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.444703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0689  pseudouridine synthase  45.89 
 
 		 253 aa  185  8e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3744  pseudouridine synthase  45.76 
 
 		 233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212732  normal  0.0135633 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1643  pseudouridine synthase  44.05 
 
 		 238 aa  182  6e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.734555 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1292  pseudouridine synthase  47.06 
 
 		 251 aa  182  7e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0693  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  42.67 
 
 		 239 aa  178  9e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1352  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  48.72 
 
 		 240 aa  175  8e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.92415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1330  pseudouridine synthase  41.7 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.297072 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2497  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  43.51 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06820  pseudouridine synthase family protein  41.87 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.493821 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1743  pseudouridine synthase  40.51 
 
 		 235 aa  172  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1442  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  45.11 
 
 		 236 aa  172  5.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000380815  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07230  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  44.4 
 
 		 237 aa  172  7.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000010493  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2153  pseudouridine synthase  45 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.433224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4425  pseudouridine synthase  44.35 
 
 		 244 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.223617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0829  pseudouridylate synthase  41.7 
 
 		 284 aa  169  4e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1196  pseudouridine synthase  44.17 
 
 		 238 aa  169  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.939109  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1236  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  46.96 
 
 		 269 aa  169  4e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.862824 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1730  pseudouridine synthase  43.03 
 
 		 273 aa  168  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2817  pseudouridine synthase  43.62 
 
 		 329 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0696867  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1578  pseudouridine synthase  41.99 
 
 		 236 aa  166  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0328  pseudouridine synthase  44.17 
 
 		 567 aa  166  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.106742 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1466  pseudouridine synthase  40.43 
 
 		 241 aa  166  4e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0166  pseudouridine synthase  42.06 
 
 		 556 aa  166  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252408  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1928  pseudouridine synthase  43.33 
 
 		 306 aa  165  8e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.262991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0462  16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase  41.03 
 
 		 256 aa  165  9e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0481234  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25330  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  45.53 
 
 		 247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.411992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3495  pseudouridine synthase  42.39 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0394567  normal  0.217284 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1142  pseudouridine synthase  37.87 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3276  pseudouridine synthase  42.39 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0129049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2944  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  43.44 
 
 		 247 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal  0.0913763 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2929  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  43.44 
 
 		 247 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2973  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  43.44 
 
 		 247 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1564  pseudouridine synthase  41.56 
 
 		 243 aa  162  6e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.531508  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4592  pseudouridine synthase  41.15 
 
 		 624 aa  162  9e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.667434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1919  pseudouridine synthase  41.45 
 
 		 256 aa  162  9e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118075 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1270  pseudouridine synthase  41.91 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1010  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  41.98 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1367  pseudouridine synthase  38.33 
 
 		 228 aa  160  3e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19880  pseudouridine synthase family protein  40 
 
 		 263 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5061  pseudouridine synthase  42.74 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0210858  normal  0.0392738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2996  pseudouridine synthase, Rsu  42.74 
 
 		 621 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.772965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1319  RNA-binding S4 domain protein  41.83 
 
 		 268 aa  159  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.834019  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3411  pseudouridine synthase  43.15 
 
 		 255 aa  159  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1056  pseudouridine synthase RluB  39.91 
 
 		 245 aa  159  7e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2728  pseudouridine synthase  40.38 
 
 		 274 aa  159  7e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11726  hypothetical protein  41.56 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.473369 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2830  pseudouridine synthase  43.51 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00016926  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1928  pseudouridine synthase  41.45 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0159722  normal  0.219047 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1534  pseudouridine synthase  39.51 
 
 		 403 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000449556 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1206  pseudouridine synthase, Rsu  41.98 
 
 		 375 aa  156  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1534  pseudouridine synthase, Rsu  40.25 
 
 		 406 aa  157  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171678  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2989  pseudouridine synthase  41.67 
 
 		 280 aa  155  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.340471  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1147  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  39.21 
 
 		 236 aa  155  6e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000045472  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3120  pseudouridine synthase  42.92 
 
 		 322 aa  155  7e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.246679  hitchhiker  0.00195827 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1167  RNA-binding S4 domain protein  36.28 
 
 		 228 aa  155  7e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1336  ribosomal small subunit pseudouridine synthase B  39.21 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.014485  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3089  pseudouridine synthase  40.95 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000212991  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1172  pseudouridine synthase  40.95 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.8005300000000004e-32 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2010  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  42.86 
 
 		 268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154184  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2371  pseudouridine synthase  41.74 
 
 		 319 aa  152  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0542  pseudouridine synthase, Rsu  39 
 
 		 251 aa  152  4e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1872  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  34.41 
 
 		 383 aa  152  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14070  pseudouridine synthase family protein  42.86 
 
 		 318 aa  152  5e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1820  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  39.85 
 
 		 288 aa  152  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1454  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  42.5 
 
 		 252 aa  152  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00702616 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1356  pseudouridine synthase  43.61 
 
 		 254 aa  152  5e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0976  pseudouridine synthase  41.67 
 
 		 694 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0989035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1581  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  38.63 
 
 		 245 aa  152  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1550  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  38.63 
 
 		 245 aa  152  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2263  pseudouridine synthase  43.22 
 
 		 324 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0689065  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0309  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  38.66 
 
 		 255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2174  pseudouridine synthase  43.22 
 
 		 329 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0017  pseudouridine synthase  37.97 
 
 		 239 aa  152  7e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355614  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3919  pseudouridine synthase  39.06 
 
 		 555 aa  152  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1593  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  38.91 
 
 		 240 aa  151  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4141  pseudouridine synthase  39.08 
 
 		 554 aa  151  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.244372  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4639  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.76 
 
 		 501 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0394  pseudouridine synthase  38.93 
 
 		 261 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.734579 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1493  pseudouridine synthase  43.33 
 
 		 426 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.797477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1406  ribosomal large subunit pseudouridine synthaseB (pseudouridylate synthase) (uracil hydrolyase)  37.55 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.541928  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1038  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  39.2 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716965 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4054  pseudouridine synthase  41.67 
 
 		 249 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.51659 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1682  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  42.8 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00200841  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0143  pseudouridylate synthase (ribosomal large subunit pseudouridine synthase B)  38.46 
 
 		 562 aa  150  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.303983 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4379  pseudouridine synthase  37.44 
 
 		 229 aa  150  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1301  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  40.69 
 
 		 236 aa  149  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1557  pseudouridine synthase  41.3 
 
 		 252 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1581  pseudouridine synthase  41.3 
 
 		 252 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15190  pseudouridine synthase family protein  43.53 
 
 		 284 aa  149  6e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0192942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3863  pseudouridine synthase, Rsu  37.98 
 
 		 680 aa  148  8e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.695211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2458  pseudouridine synthase  41 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0684  pseudouridine synthase  38.53 
 
 		 239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1709  RNA-binding S4 domain protein  40.17 
 
 		 387 aa  148  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.397798  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0660  pseudouridine synthase  38.1 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.665428  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1217  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  42.06 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000897909  hitchhiker  0.000000206079 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0806  pseudouridine synthase  40.59 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.316767  normal  0.474505 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>