More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1005 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1005  RNA-binding S4 domain protein  100 
 
 		 227 aa  449  1e-125  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.0262199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2529  pseudouridine synthase, Rsu  38.82 
 
 		 380 aa  176  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2613  RNA pseudouridine synthase family protein  45.13 
 
 		 298 aa  171  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4291  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.62 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0474  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.46 
 
 		 360 aa  169  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.15939 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2299  ribosomal large subunit pseudouridine synthase f  45.13 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0465  RNA-binding S4 domain protein  38.46 
 
 		 248 aa  168  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.117084  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0693  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  41.88 
 
 		 239 aa  168  7e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3468  pseudouridine synthase, Rsu  38.78 
 
 		 379 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.242566  normal  0.43397 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0485  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.65 
 
 		 305 aa  166  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1913  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.36 
 
 		 416 aa  165  6.9999999999999995e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162231 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0058  pseudouridine synthase  38.16 
 
 		 241 aa  164  8e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07230  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  43.48 
 
 		 237 aa  164  9e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000010493  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1743  pseudouridine synthase  39.04 
 
 		 235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2033  putative arginine/proline rich protein  35.89 
 
 		 421 aa  162  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0619869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4985  RNA-binding S4 domain protein  35.45 
 
 		 273 aa  162  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33907  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0577  RNA pseudouridine synthase family protein  40 
 
 		 229 aa  161  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1151  RNA pseudouridine synthase family protein  39.82 
 
 		 228 aa  161  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000576228  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3411  pseudouridine synthase  37.61 
 
 		 255 aa  160  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3544  RNA-binding S4  35.71 
 
 		 304 aa  160  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.824299  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0987  ribosomal large subunit pseudouridine synthase f  39.37 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0684  pseudouridine synthase  36.96 
 
 		 239 aa  159  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0494  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  36.64 
 
 		 243 aa  159  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0660  pseudouridine synthase  36.36 
 
 		 239 aa  158  8e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.665428  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1558  pseudouridine synthase family protein  35.22 
 
 		 249 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1106  pseudouridine synthase  36.36 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0733925  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1816  pseudouridine synthase family 1 protein  39.38 
 
 		 340 aa  157  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01765  RNA pseudouridine synthase family protein  41.67 
 
 		 248 aa  156  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00504065  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4661  RNA pseudouridine synthase family protein  40.18 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.636337  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1196  pseudouridine synthase  36.36 
 
 		 238 aa  155  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.939109  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5332  pseudouridine synthase, Rsu  35.48 
 
 		 623 aa  155  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1217  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  36.13 
 
 		 258 aa  155  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000897909  hitchhiker  0.000000206079 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1688  pseudouridine synthase, Rsu  35.5 
 
 		 250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4664  RNA pseudouridine synthase family protein  40.89 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000338172 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01258  pseudouridylate synthase  40.89 
 
 		 384 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1396  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  37.18 
 
 		 239 aa  155  5.0000000000000005e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.131517  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1339  RNA-binding S4 domain protein  36.44 
 
 		 627 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.476364  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4674  RNA pseudouridylate synthase family protein  39.73 
 
 		 229 aa  155  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6055  pseudouridine synthase, Rsu  35.48 
 
 		 669 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0597355  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2022  pseudouridine synthase, Rsu  35.48 
 
 		 669 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4284  pseudouridylate synthase  40.44 
 
 		 229 aa  154  8e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4677  RNA pseudouridine synthase family protein  39.73 
 
 		 229 aa  154  9e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2974  RNA pseudouridine synthase family protein  42.79 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.462691 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1142  pseudouridine synthase  38.79 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2353  RNA pseudouridine synthase family protein  42.79 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1211  pseudouridine synthase  39.57 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0782  ribosomal large subunit pseudouridine synthase F  42.54 
 
 		 324 aa  153  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.168526  normal  0.0685581 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0606  ribosomal large subunit pseudouridine synthase F  37.35 
 
 		 266 aa  153  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000119564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2403  RNA pseudouridine synthase family protein  42.79 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2042  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.48 
 
 		 650 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.483684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2488  RNA pseudouridine synthase family protein  42.79 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.970242  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2024  pseudouridine synthase family protein  34.82 
 
 		 557 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2221  RNA pseudouridylate synthase  42.34 
 
 		 238 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2160  pseudouridylate synthase (pseudouridine synthase)  42.34 
 
 		 238 aa  152  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.28876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2144  tRNA pseudouridine synthase A  42.34 
 
 		 238 aa  152  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1332  RNA pseudouridine synthase family protein  34.82 
 
 		 559 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.126858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2386  RNA pseudouridine synthase family protein  42.34 
 
 		 238 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4379  pseudouridine synthase  39.56 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3251  RNA pseudouridine synthase family protein  34.82 
 
 		 563 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.9005  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1168  pseudouridine synthase  36.18 
 
 		 591 aa  152  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0497  pseudouridine synthase  34.91 
 
 		 247 aa  152  5e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.196452  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1401  hypothetical protein  35.46 
 
 		 631 aa  152  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4446  RNA pseudouridylate synthase  40.44 
 
 		 229 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0435  ribosomal large subunit pseudouridine synthase F  33.74 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2586  pseudouridine synthase family protein  34.82 
 
 		 585 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4792  RNA pseudouridine synthase family protein  40.44 
 
 		 229 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2060  RNA pseudouridine synthase family protein  34.82 
 
 		 559 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.239559  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004196  ribosomal large subunit pseudouridine synthase F  40.44 
 
 		 385 aa  152  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00815873  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2497  RNA pseudouridine synthase family protein  34.82 
 
 		 571 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1924  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.22 
 
 		 646 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257028 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2440  RNA pseudouridine synthase family protein  34.82 
 
 		 574 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0855  23S rRNA pseudouridine synthase F  39.65 
 
 		 332 aa  151  7e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.532937 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1275  RNA-binding S4 domain protein  36.03 
 
 		 674 aa  151  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.206781 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1403  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  33.77 
 
 		 247 aa  151  8e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4295  tRNA pseudouridine synthase A  39.3 
 
 		 229 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.502862  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0908  23S rRNA pseudouridine synthase F  39.21 
 
 		 328 aa  151  8.999999999999999e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.500296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1254  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.41 
 
 		 249 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0063069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3595  pseudouridine synthase  36.14 
 
 		 278 aa  150  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0369  pseudouridine synthase  34.45 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126334 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2417  RNA pseudouridylate synthase family protein  41.89 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0542  pseudouridine synthase, Rsu  35.78 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0778  pseudouridine synthase  37.05 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.132612  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2035  pseudouridine synthase  36.82 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2055  pseudouridine synthase, Rsu  35.22 
 
 		 690 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2192  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.34 
 
 		 235 aa  149  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.731966  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1692  pseudouridine synthase  33.88 
 
 		 255 aa  149  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1753  RNA-binding S4 domain protein  35.56 
 
 		 245 aa  149  5e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.577127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1432  pseudouridine synthase, Rsu  34.41 
 
 		 610 aa  148  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000648222 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0263  pseudouridine synthase, Rsu  36.55 
 
 		 243 aa  148  7e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0539496  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1748  23S rRNA pseudouridine synthase F  39.57 
 
 		 309 aa  148  8e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2459  RNA-binding S4 domain protein  32.79 
 
 		 250 aa  148  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0124526  hitchhiker  0.000345164 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1341  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.01 
 
 		 624 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.358627 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6011  pseudouridine synthase  40.27 
 
 		 389 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2938  23S rRNA pseudouridine synthase F  39.47 
 
 		 355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0236  pseudouridine synthase  42.15 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1593  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  39.22 
 
 		 240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1204  ribosomal large subunit pseudouridine synthase F  41.88 
 
 		 240 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.501525  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1987  ribosomal large subunit pseudouridine synthase F  40.44 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.514849  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1406  ribosomal large subunit pseudouridine synthaseB (pseudouridylate synthase) (uracil hydrolyase)  36.21 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.541928  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2070  pseudouridine synthase  34.91 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0652133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>