31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13380 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13380  PPE family protein  100 
 
 
2472 aa  4520    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.21147  normal  0.142656 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13376  PPE family protein  54.92 
 
 
2532 aa  911    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0812485  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13386  PPE family protein  70.78 
 
 
3787 aa  2916    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000441987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11946  PPE family protein  44.8 
 
 
1457 aa  706    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.515956  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10310  PPE family protein  37.34 
 
 
3166 aa  620  1e-176  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.395007 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10360  PPE family protein  35.87 
 
 
3295 aa  548  1e-154  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.683224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13381  PPE family protein  53.33 
 
 
647 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00213792  normal  0.0214486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11771  PPE family protein  44.29 
 
 
975 aa  243  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.49393e-28  hitchhiker  0.0000000153091 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12379  PPE family protein  60.58 
 
 
613 aa  199  8.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000086115  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11581  PPE family protein  52.67 
 
 
760 aa  197  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.912214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11947  PPE family protein  39.02 
 
 
1013 aa  187  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13566  PPE family protein  46.27 
 
 
582 aa  181  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.514261  hitchhiker  0.0000000713233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11157  PPE family protein  49.66 
 
 
636 aa  179  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.38215e-17  normal  0.405765 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12382  PPE family protein  51.16 
 
 
615 aa  179  7e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105692  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10769  PPE family protein  48.16 
 
 
645 aa  161  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000490344  normal  0.972574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13180  PPE family protein  45.42 
 
 
590 aa  145  7e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.78339e-28  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13591  PPE family protein  48.74 
 
 
551 aa  129  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000128496  normal  0.122271 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10895  PPE family protein  49.15 
 
 
448 aa  113  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0951157  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10447  PPE family protein  51.85 
 
 
487 aa  108  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.925376  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3860  pentapeptide repeat containing protein  47.92 
 
 
285 aa  86.3  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179261  normal  0.135456 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10359  PPE family protein  43.84 
 
 
183 aa  82  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.215984  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0207  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 
316 aa  76.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0216  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 
316 aa  76.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0196  pentapeptide repeat-containing protein  44.2 
 
 
315 aa  76.3  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1851  pentapeptide repeat-containing protein  53.01 
 
 
551 aa  71.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000406154  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0811  pentapeptide repeat containing protein  46.48 
 
 
278 aa  67  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2875  pentapeptide repeat containing protein  46.48 
 
 
278 aa  67  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.88171  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  50.62 
 
 
580 aa  65.5  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2900  hypothetical protein  24.46 
 
 
793 aa  51.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.366877  normal  0.180357 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5055  hypothetical protein  43.84 
 
 
265 aa  50.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1708  hypothetical protein  25.98 
 
 
591 aa  47.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.864094  normal  0.0229836 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>