40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0801 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0801  hypothetical protein  100 
 
 
591 aa  1154    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0753536  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0677  hypothetical protein  68.35 
 
 
543 aa  431  1e-119  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22180  hypothetical protein  36.65 
 
 
750 aa  179  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.314625  normal  0.946769 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1337  hypothetical protein  36.33 
 
 
788 aa  161  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1121  hypothetical protein  40.19 
 
 
618 aa  154  4e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.642413 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13630  hypothetical protein  35.5 
 
 
621 aa  136  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1512  hypothetical protein  31.48 
 
 
640 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000167269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5444  hypothetical protein  35.18 
 
 
918 aa  131  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1513  hypothetical protein  32.66 
 
 
680 aa  128  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2020  hypothetical protein  40.96 
 
 
480 aa  120  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6067  hypothetical protein  35.2 
 
 
936 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229661  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1253  tetratricopeptide TPR_4  36.09 
 
 
350 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.222443 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3800  hypothetical protein  34.48 
 
 
633 aa  117  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25500  hypothetical protein  36.22 
 
 
339 aa  115  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3166  tetratricopeptide TPR_2  31.05 
 
 
654 aa  103  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.307175  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2042  hypothetical protein  30.98 
 
 
349 aa  103  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2161  hypothetical protein  38.12 
 
 
355 aa  102  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1906  tetratricopeptide TPR_4  37.04 
 
 
753 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.346521 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07420  hypothetical protein  41.43 
 
 
274 aa  101  5e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.704818  normal  0.126809 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4077  hypothetical protein  40.26 
 
 
374 aa  99  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313284  hitchhiker  0.00876664 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11707  hypothetical protein  38.42 
 
 
250 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.104662 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3293  hypothetical protein  37.32 
 
 
285 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2969  hypothetical protein  37.56 
 
 
277 aa  97.8  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2954  hypothetical protein  37.56 
 
 
277 aa  97.4  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2998  hypothetical protein  37.56 
 
 
277 aa  97.4  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.631181  normal  0.549818 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1746  hypothetical protein  30.51 
 
 
1079 aa  97.1  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000886792 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3512  hypothetical protein  38.51 
 
 
305 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.804632  normal  0.14913 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2830  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  37.11 
 
 
675 aa  95.9  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1981  tetratricopeptide TPR_2  35.71 
 
 
321 aa  94  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4444  Tetratricopeptide TPR_4  36.6 
 
 
365 aa  89  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457658  normal  0.0435915 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3019  hypothetical protein  36.09 
 
 
658 aa  81.6  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.882061  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2386  hypothetical protein  43.07 
 
 
200 aa  81.3  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5461  hypothetical protein  36.36 
 
 
341 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0553967  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1897  tetratricopeptide TPR_4  34.13 
 
 
286 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3039  hypothetical protein  38.83 
 
 
227 aa  61.2  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.635634  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2360  hypothetical protein  35.95 
 
 
245 aa  58.5  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0182213  hitchhiker  0.00536835 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2316  translation initiation factor IF-2  34.76 
 
 
1116 aa  50.4  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.100815  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0166  pseudouridine synthase  60.47 
 
 
556 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252408  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3867  hypothetical protein  37.63 
 
 
333 aa  45.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.279775  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4592  pseudouridine synthase  40.19 
 
 
624 aa  43.9  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.667434  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>