284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2830 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2830  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  100 
 
 
675 aa  1299    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3292  HAD family hydrolase  57.19 
 
 
337 aa  313  7.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11708  phosphatase  53.35 
 
 
353 aa  312  2e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.900168  normal  0.127356 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3511  HAD family hydrolase  55.26 
 
 
337 aa  302  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.540896  normal  0.0582396 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2385  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  58.51 
 
 
316 aa  286  7e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2968  HAD family hydrolase  56.81 
 
 
334 aa  276  8e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0800557  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2953  HAD family hydrolase  53.47 
 
 
334 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.361868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2997  HAD family hydrolase  53.47 
 
 
334 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411928  normal  0.553212 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4076  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  51.69 
 
 
366 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.125935  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25490  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  49.04 
 
 
336 aa  252  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1898  HAD family hydrolase  49.03 
 
 
340 aa  251  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000214064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5443  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  55.81 
 
 
264 aa  251  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.931975  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13640  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  53.52 
 
 
343 aa  249  1e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2016  HAD-superfamily hydrolase  49.49 
 
 
333 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0636976 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5439  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  46.77 
 
 
344 aa  240  6.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6062  sugar phosphatase of the HAD superfamily-like protein  50.18 
 
 
336 aa  239  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  48.14 
 
 
342 aa  237  7e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.706316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3163  HAD family hydrolase  49.3 
 
 
449 aa  235  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0117236  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1513  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  50.19 
 
 
329 aa  233  7.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000783822 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1250  HAD family hydrolase  48.87 
 
 
338 aa  233  1e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.395408 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3034  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  48.06 
 
 
335 aa  231  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2166  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  47.12 
 
 
334 aa  230  6e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000345894  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1749  HAD family hydrolase  51.54 
 
 
366 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0343675  hitchhiker  0.000628636 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2038  HAD family hydrolase  48.97 
 
 
334 aa  228  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1907  HAD family hydrolase  49.31 
 
 
340 aa  224  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.275606 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1514  HAD family hydrolase  49.42 
 
 
330 aa  220  6e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2969  hypothetical protein  57.8 
 
 
277 aa  217  7e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2954  hypothetical protein  57.34 
 
 
277 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2998  hypothetical protein  57.34 
 
 
277 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.631181  normal  0.549818 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1338  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  46.45 
 
 
338 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3512  hypothetical protein  55.3 
 
 
305 aa  213  9e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.804632  normal  0.14913 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3015  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  45.64 
 
 
359 aa  212  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.25557  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3293  hypothetical protein  54.43 
 
 
285 aa  211  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11707  hypothetical protein  57.6 
 
 
250 aa  209  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.104662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2161  hypothetical protein  50.21 
 
 
355 aa  205  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22170  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  44.73 
 
 
345 aa  204  6e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368706  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2479  HAD family hydrolase  45.21 
 
 
332 aa  204  6e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19473  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4443  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIA  43.44 
 
 
360 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.198933  normal  0.115883 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2386  hypothetical protein  63.96 
 
 
200 aa  202  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5444  hypothetical protein  51.85 
 
 
918 aa  197  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25500  hypothetical protein  49.57 
 
 
339 aa  197  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1655  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  46.89 
 
 
337 aa  193  9e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0557426  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2042  hypothetical protein  50.23 
 
 
349 aa  191  4e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2359  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  44.88 
 
 
349 aa  189  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0246768  hitchhiker  0.00643781 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3150  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  49.4 
 
 
365 aa  187  5e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.714605  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0678  HAD hydrolase, family IIA  38.95 
 
 
366 aa  185  2.0000000000000003e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14240  haloacid dehalogenase subfamily IIA protein  47.15 
 
 
276 aa  182  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00966269  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0800  putative HAD superfamily sugar phosphatase  40.43 
 
 
346 aa  178  3e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2020  hypothetical protein  48.28 
 
 
480 aa  171  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3800  hypothetical protein  48.18 
 
 
633 aa  165  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1906  tetratricopeptide TPR_4  49.77 
 
 
753 aa  160  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.346521 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4444  Tetratricopeptide TPR_4  45.83 
 
 
365 aa  160  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457658  normal  0.0435915 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1513  hypothetical protein  44.5 
 
 
680 aa  159  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1512  hypothetical protein  44.71 
 
 
640 aa  159  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000167269 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13630  hypothetical protein  46.75 
 
 
621 aa  157  7e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6067  hypothetical protein  46.02 
 
 
936 aa  157  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229661  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2900  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  37.4 
 
 
257 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4077  hypothetical protein  49.77 
 
 
374 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313284  hitchhiker  0.00876664 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07430  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  42.34 
 
 
274 aa  154  7e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.699759  normal  0.0830184 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0515  HAD superfamily hydrolase  37.55 
 
 
259 aa  153  8e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3039  hypothetical protein  52.6 
 
 
227 aa  153  8.999999999999999e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.635634  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1044  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  36.51 
 
 
266 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1253  tetratricopeptide TPR_4  49.5 
 
 
350 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.222443 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3557  HAD family hydrolase  35.71 
 
 
254 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0563  HAD family hydrolase  36.76 
 
 
256 aa  145  3e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0984026  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4827  phosphatase  35.69 
 
 
254 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00162438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5192  phosphatase  35.69 
 
 
254 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.183726  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1310  HAD family hydrolase  39.46 
 
 
265 aa  144  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3045  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  36.19 
 
 
256 aa  144  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5096  phosphatase  35.69 
 
 
254 aa  144  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.344211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4668  4-nitrophenylphosphatase (p-nitrophenylphosphate phosphohydrolase)  35.69 
 
 
254 aa  144  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.265618  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5063  phosphatase,haloacid dehalogenase family  35.69 
 
 
254 aa  144  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5101  phosphatase,haloacid dehalogenase family  35.69 
 
 
254 aa  144  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.348234  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4685  4-nitrophenylphosphatase (p-nitrophenylphosphate phosphohydrolase)  35.69 
 
 
254 aa  143  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109873  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5102  phosphatase,haloacid dehalogenase family  35.69 
 
 
254 aa  143  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0137  phosphatase,haloacid dehalogenase family  35.69 
 
 
254 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.651243  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0039  HAD family sugar phosphatase  34.9 
 
 
258 aa  142  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5461  hypothetical protein  43.2 
 
 
341 aa  142  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0553967  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4780  HAD family hydrolase  35.69 
 
 
254 aa  140  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2607  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  42.75 
 
 
269 aa  139  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0928  HAD family hydrolase  35.43 
 
 
259 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0947  HAD family hydrolase  35.43 
 
 
259 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3166  tetratricopeptide TPR_2  48.31 
 
 
654 aa  135  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.307175  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1746  hypothetical protein  49.1 
 
 
1079 aa  134  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000886792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1897  tetratricopeptide TPR_4  47.51 
 
 
286 aa  134  7.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1981  tetratricopeptide TPR_2  43.66 
 
 
321 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1643  HAD family hydrolase  37.69 
 
 
265 aa  132  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  hitchhiker  0.00147879 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1592  HAD family hydrolase  40.94 
 
 
266 aa  129  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07420  hypothetical protein  38.25 
 
 
274 aa  128  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.704818  normal  0.126809 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0677  hypothetical protein  37.85 
 
 
543 aa  127  7e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22180  hypothetical protein  44.74 
 
 
750 aa  125  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.314625  normal  0.946769 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33094  predicted protein  32.75 
 
 
308 aa  124  4e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4163  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  37.07 
 
 
259 aa  124  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.81021  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0892  HAD superfamily hydrolase  35.77 
 
 
256 aa  124  7e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.65538  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1914  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  33.46 
 
 
261 aa  124  8e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00534341  hitchhiker  0.000838349 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3370  HAD family hydrolase  34.75 
 
 
257 aa  123  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109866  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1214  HAD family sugar phosphatase  33.33 
 
 
257 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000012407  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34110  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  36.92 
 
 
264 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.800157  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0444  HAD family sugar phosphatase  33.71 
 
 
260 aa  122  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163433  normal  0.182428 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55335  p-nitrophenyl phosphatase  29.18 
 
 
308 aa  122  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.424742  normal  0.747519 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>