48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1512 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1512  hypothetical protein  100 
 
 
640 aa  1226    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000167269 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1513  hypothetical protein  62.52 
 
 
680 aa  667    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3800  hypothetical protein  41.55 
 
 
633 aa  253  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6067  hypothetical protein  39.96 
 
 
936 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229661  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22180  hypothetical protein  41.11 
 
 
750 aa  208  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.314625  normal  0.946769 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5444  hypothetical protein  48.31 
 
 
918 aa  189  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2161  hypothetical protein  49.26 
 
 
355 aa  187  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1337  hypothetical protein  48.29 
 
 
788 aa  186  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25500  hypothetical protein  48.11 
 
 
339 aa  183  8.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2042  hypothetical protein  46.23 
 
 
349 aa  182  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1121  hypothetical protein  46.31 
 
 
618 aa  180  8e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.642413 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2020  hypothetical protein  46.77 
 
 
480 aa  171  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1906  tetratricopeptide TPR_4  48.29 
 
 
753 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.346521 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1981  tetratricopeptide TPR_2  41.45 
 
 
321 aa  162  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3019  hypothetical protein  37.9 
 
 
658 aa  161  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.882061  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1253  tetratricopeptide TPR_4  52.27 
 
 
350 aa  159  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.222443 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13630  hypothetical protein  45.24 
 
 
621 aa  154  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4444  Tetratricopeptide TPR_4  42.21 
 
 
365 aa  150  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457658  normal  0.0435915 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2969  hypothetical protein  43.2 
 
 
277 aa  150  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11707  hypothetical protein  48.51 
 
 
250 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.104662 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3512  hypothetical protein  45.73 
 
 
305 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.804632  normal  0.14913 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2954  hypothetical protein  42.8 
 
 
277 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2998  hypothetical protein  42.8 
 
 
277 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.631181  normal  0.549818 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2830  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  44.28 
 
 
675 aa  146  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5461  hypothetical protein  47.76 
 
 
341 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0553967  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3293  hypothetical protein  46.77 
 
 
285 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07420  hypothetical protein  43.75 
 
 
274 aa  145  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.704818  normal  0.126809 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4077  hypothetical protein  47.26 
 
 
374 aa  141  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313284  hitchhiker  0.00876664 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1746  hypothetical protein  40.17 
 
 
1079 aa  134  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000886792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1897  tetratricopeptide TPR_4  52.44 
 
 
286 aa  133  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3166  tetratricopeptide TPR_2  42.93 
 
 
654 aa  128  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.307175  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3039  hypothetical protein  47.47 
 
 
227 aa  124  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.635634  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0801  hypothetical protein  34.16 
 
 
591 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0753536  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0677  hypothetical protein  28.08 
 
 
543 aa  116  1.0000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2386  hypothetical protein  46.96 
 
 
200 aa  107  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1681  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.94 
 
 
854 aa  82  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  29.87 
 
 
985 aa  75.5  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf584  virulence-associated lipoprotein MIA  23.98 
 
 
255 aa  74.7  0.000000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0652484  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1924  RNA-binding S4 domain-containing protein  32.89 
 
 
646 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.257028 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  32.85 
 
 
971 aa  64.7  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2055  pseudouridine synthase, Rsu  33.8 
 
 
690 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1701  putative pseudouridine synthase, Rsu  35.69 
 
 
690 aa  56.6  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0522  RNA-binding S4 domain protein  41.54 
 
 
698 aa  55.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.575781 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0477  RNA-binding S4 domain protein  36.82 
 
 
689 aa  53.9  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.53583  normal  0.544761 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1356  RNA-binding S4 domain protein  37.97 
 
 
736 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.284872  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0760  hypothetical protein  27.06 
 
 
433 aa  49.7  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.152814  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0770  translation initiation factor IF-2  35.54 
 
 
894 aa  47.8  0.0006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1401  hypothetical protein  32.45 
 
 
631 aa  45.4  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>